Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,679,160 | T→C | 6.5% | R67R (CGT→CGC) ‡ | PP_2347 → | two‑component system response regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,679,160 | 0 | T | C | 6.5% | 640.9 / 22.0 | 198 | R67R (CGT→CGC) ‡ | PP_2347 | two‑component system response regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (96/89); new base C (4/9); total (100/98) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 |
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
CGGCCTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATCCAGGCGTTGCTGCG > NC_002947/2679013‑2679309 | cgGCCTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGc < 2:2615796/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCCGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGcc < 2:4489804/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGct > 1:3748898/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGCCAGGGCTTTGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctg < 1:778779/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctg > 2:2265381/1‑150 (MQ=255) gCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCGGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctgg < 1:2643692/150‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGCGGCACGCCActgggc < 1:715477/150‑3 (MQ=255) gcgcCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGCGGCACGCCActgggcc < 2:934889/150‑4 (MQ=255) cgcCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctggcctg < 1:4393540/150‑1 (MQ=255) cgcCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGCGGCACGCCActgggcca < 1:1962955/150‑5 (MQ=255) ccAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctggcctggc < 1:434215/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctggcctggc < 1:3912899/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctggcctggc < 2:674947/150‑1 (MQ=255) gTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTg < 1:2729617/150‑1 (MQ=255) tccacggctggctGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGAt > 1:4006533/6‑150 (MQ=255) gACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATc < 1:1152781/150‑1 (MQ=255) gACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATc < 2:1263925/150‑1 (MQ=255) aCTGGCGGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATcc < 1:3185060/150‑1 (MQ=255) ctggctggCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCt < 2:4021141/150‑1 (MQ=255) tggctggcTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTc > 2:4231736/1‑150 (MQ=255) tggctggcTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTc > 2:2888496/1‑150 (MQ=255) ggctggctGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCa < 2:611826/150‑1 (MQ=255) gctggctgATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCAc > 1:3817108/1‑150 (MQ=255) ctggctgATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCAcc > 1:701124/1‑150 (MQ=255) tgATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCAccgcccg > 2:3298494/1‑150 (MQ=255) tGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCgg > 1:2239519/1‑150 (MQ=255) gTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCt < 2:3956368/150‑1 (MQ=255) gACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTgg < 1:778416/150‑1 (MQ=255) gACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTgg < 1:2437589/150‑1 (MQ=255) gACGCGGATTACCCGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGACCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTgg < 2:3150057/150‑1 (MQ=255) aCGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTggg > 2:1635941/1‑150 (MQ=255) aCGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTAATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTggg < 1:3384461/150‑1 (MQ=255) cgcgGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGc > 1:3737877/1‑150 (MQ=255) tttACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAgc < 1:3876136/150‑1 (MQ=255) ttACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAgcg < 2:2030828/150‑1 (MQ=255) aCCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCa < 1:1579265/150‑1 (MQ=255) ccAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCAt > 2:1848253/1‑150 (MQ=255) ccAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCAt > 2:2664482/1‑150 (MQ=255) cAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATc < 2:1711199/150‑1 (MQ=255) cAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATc > 2:2189/1‑150 (MQ=255) cAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATc > 1:3097931/1‑150 (MQ=255) ggCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAg > 1:2478491/1‑150 (MQ=255) gCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGGATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAgg > 2:3252374/1‑150 (MQ=255) 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aCGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCgggg > 1:4319273/1‑150 (MQ=255) aCCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTg < 1:1902623/150‑1 (MQ=255) aCCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTg > 1:4445873/1‑150 (MQ=255) ccTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGa < 2:3085038/150‑1 (MQ=255) ccTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGa > 1:3339628/1‑150 (MQ=255) 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cTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTg > 1:3304629/1‑150 (MQ=255) tGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGa < 2:2958661/150‑1 (MQ=255) tGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGa < 2:4213428/150‑1 (MQ=255) tGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGa < 1:2616689/150‑1 (MQ=255) gACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCGCCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGc < 2:725603/150‑1 (MQ=255) gACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGc < 1:1015694/150‑1 (MQ=255) gACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGc < 2:725611/150‑1 (MQ=255) aCCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCa > 1:1249045/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCcgcg > 1:2127181/1‑91 (MQ=255) cTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCaaa > 1:445878/1‑150 (MQ=255) tCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAAc > 1:534186/1‑150 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gccaggccAGCGGCACGCCACTGGGCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTgc > 1:3529221/7‑146 (MQ=255) gccaggccAGCGGCACGCCACTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCAt > 1:3426630/7‑150 (MQ=255) gCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCAt > 2:400325/1‑150 (MQ=255) caggccAGCGGCACGCCACTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATcc > 2:3623052/5‑150 (MQ=255) gCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCggg > 2:2452334/1‑93 (MQ=255) ccAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATCCAGGc > 1:1810980/1‑150 (MQ=255) ccAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATCCAGGc > 1:4238571/1‑150 (MQ=255) gTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATCCAGGCGtt < 2:858887/150‑1 (MQ=255) gTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATCCAGGCGtt < 2:2813529/150‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTCTTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATCCAGGCGTtgctgc < 1:4130517/150‑1 (MQ=255) tGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATCCAGGCGTTGCTgcg > 1:2084408/1‑150 (MQ=255) | CGGCCTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATCCAGGCGTTGCTGCG > NC_002947/2679013‑2679309 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |