| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,726,680 | 0 | A | C | 5.3% | 867.7 / 26.6 | 249 | intergenic (‑124/+24) | azlC/PP_2386 | branched‑chain amino acid transport protein AzlC/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (105/130); new base C (6/7); total (112/137) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.16e-01 | |||||||||||
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
GCTTGGCGGGCGATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGCCTGG > NC_002947/2726534‑2726827 | cgggcgATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGccc < 2:1879423/150‑1 (MQ=255) cgggcgATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGccc < 2:468070/150‑1 (MQ=255) cgggcgATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGccc < 1:3764902/150‑1 (MQ=255) 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ttcggggCCGCCTTGCGGCCCTGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACAcc > 2:2108764/5‑150 (MQ=255) ttcggggCCGCCTTGCGGCCCTGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACAcc > 1:1953092/5‑150 (MQ=255) aGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCg > 1:3366838/1‑150 (MQ=255) aGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCg > 2:3024946/1‑150 (MQ=255) ggCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGc < 1:3580855/150‑1 (MQ=255) ggCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGc > 1:3741120/1‑150 (MQ=255) ggCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGc > 1:4425004/1‑150 (MQ=255) cGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGCCTg < 1:1312526/150‑1 (MQ=255) cGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGCCTg < 1:3996313/150‑1 (MQ=255) gCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGCCTgg < 1:702897/150‑1 (MQ=255) cAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTgc < 1:247571/89‑1 (MQ=255) cAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTgc > 2:247571/1‑89 (MQ=255) | GCTTGGCGGGCGATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGCCTGG > NC_002947/2726534‑2726827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |