| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_002947 | 2,726,682 | 0 | G | T | 5.2% | 859.4 / 25.2 | 248 | intergenic (‑126/+22) | azlC/PP_2386 | branched‑chain amino acid transport protein AzlC/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (105/130); new base T (6/7); total (111/137) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
GCTTGGCGGGCGATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGCCTGGTAGT > NC_002947/2726534‑2726831 | cgggcgATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGccc < 2:1879423/150‑1 (MQ=255) cgggcgATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGccc < 1:3764829/150‑1 (MQ=255) gggcgATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCCTTGCGGccct < 2:723780/150‑2 (MQ=255) 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tGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTa > 1:1057438/1‑150 (MQ=255) acaacaGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTaca > 1:608543/1‑150 (MQ=255) ttcggggCCGCCTTGCGGCCCTGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACAcc > 1:1953092/5‑150 (MQ=255) ttcggggCCGCCTTGCGGCCCTGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACAcc > 2:737598/5‑150 (MQ=255) ttcggggCCGCCTTGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACAcc > 2:4129908/5‑150 (MQ=255) aGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCg > 2:3024946/1‑150 (MQ=255) aGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCg > 1:3366838/1‑150 (MQ=255) ggCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGc > 1:3741120/1‑150 (MQ=255) ggCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGc > 1:4425001/1‑150 (MQ=255) gCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGcc < 1:1178841/150‑1 (MQ=255) cAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTgc < 1:247571/89‑1 (MQ=255) ggcggcCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGCCTGGTAGt > 1:3625052/1‑150 (MQ=255) | GCTTGGCGGGCGATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGCCTGGTAGT > NC_002947/2726534‑2726831 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |