Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_002947 | 2,865,794 | T→G | 10.2% | S297A (TCG→GCG) | gllR → | HTH‑type transcriptional regulator GalR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,865,794 | 0 | T | G | 10.2% | 537.6 / 18.9 | 209 | S297A (TCG→GCG) | gllR | HTH‑type transcriptional regulator GalR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (71/109); new base G (21/5); total (95/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.89e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
GCCTCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCT > NC_002947/2865646‑2865943 | gCCTCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTc < 1:3209353/150‑1 (MQ=255) cTCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGc < 1:2711989/150‑1 (MQ=255) cTCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGc < 1:2031197/150‑1 (MQ=255) tctcGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGTTATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGGACACTCTCCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGcc < 2:4336096/147‑1 (MQ=255) tCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGcc > 1:178356/1‑150 (MQ=255) gACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGcc > 1:951684/1‑150 (MQ=255) gACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGAGCCGGcc > 1:654772/1‑150 (MQ=255) tATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCACGCCGGCCCgg > 1:3870193/1‑149 (MQ=255) tATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCACGGGCCGGCGAGCCGGCCCgc < 1:832988/150‑2 (MQ=255) aTGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGAGCCGGCCCgcg < 2:654772/150‑3 (MQ=255) aTGCCAGCGACCTGGGGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCACGGGCCGGCGAGCCGGCCCgcg < 2:3398164/150‑3 (MQ=255) tGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCa < 2:2059573/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCa < 1:689631/150‑1 (MQ=255) aGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCGGCCCGGCCgctg > 1:3585987/1‑150 (MQ=255) cGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGGCGGCGCGCCCGCCCGGCAgctgct > 1:3556428/1‑150 (MQ=255) cGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAgctgct < 1:2444348/150‑1 (MQ=255) cGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGACaccggcg > 1:777302/1‑144 (MQ=255) cGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCCGCCCGTCAgctgct > 1:2090473/1‑150 (MQ=255) ccTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCGGCCCGGCCGCTGCTCgc > 2:1548305/1‑149 (MQ=255) cTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGAc < 2:428244/150‑1 (MQ=255) ggCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGc < 1:3932864/150‑1 (MQ=255) gCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCCGCTGCTCGACAACTGCTTcgc > 1:1898761/1‑150 (MQ=255) ccGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTcgcc < 1:402099/150‑1 (MQ=255) ccGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTcgcc < 2:764978/150‑1 (MQ=255) gCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACAGCGTcgccgc > 2:1717744/1‑150 (MQ=255) tcatcaACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGGCACCTGCTCGACAACTGCTTcgccgccg > 1:522865/1‑150 (MQ=255) catcaACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTcgccgccgc < 1:1084918/150‑1 (MQ=255) atcaACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGGCAGCTGCTCGACAACAGCTTCGCCGCcccg > 1:88020/1‑150 (MQ=255) tcaACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCgg > 2:1375755/1‑150 (MQ=255) tcaACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCgg < 1:1001442/150‑1 (MQ=255) tcaACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCgg < 1:3295462/150‑1 (MQ=255) aaCGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGGTCGCCGGCCCGTCCGCTGCGCGACAACAGCGTCGCCGCCGCGGGc > 1:11003/1‑150 (MQ=255) aaCGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGc > 1:372168/1‑150 (MQ=255) 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ggtgCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCCGCTCGCCCGCCCGTCAGCTGCTCGAAAACAGGATGGGCGCCGCGGGCCGGACAGCGCCgag > 2:3448470/1‑148 (MQ=255) gtgCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGACTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTgg > 1:1263467/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCg < 2:122806/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCACGGCGCTGTCAGGCCCGCGGcgg < 1:2823199/150‑3 (MQ=255) ccGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCACGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCggtggt < 2:280959/150‑1 (MQ=255) ccGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCggtggt < 1:136111/150‑1 (MQ=255) ccGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCGGACCGCGCCGTGGCCgggggg > 1:241687/1‑149 (MQ=255) ccGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCGGCCCGGCCGCGGCGCGACCACAGCGTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCCGGGCCgggggt > 2:1616794/1‑150 (MQ=255) cGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGgtggtg < 2:3932886/150‑1 (MQ=255) cGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGaa > 1:2575535/1‑150 (MQ=255) gggggCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGaaa < 2:1852576/150‑1 (MQ=255) gggggCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGaaa < 1:923548/150‑1 (MQ=255) ggggCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAg < 1:331318/150‑1 (MQ=255) gggCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCCTCAGCGGCTCGCCAACAGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGGGGCCGGGGGGGGTAAgc > 2:195248/1‑150 (MQ=255) cccGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGa < 2:3643265/150‑1 (MQ=255) 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tGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTTCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTgg < 1:253836/150‑1 (MQ=255) acTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGgtggtg > 1:4342753/1‑126 (MQ=255) cTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATcc < 1:495726/150‑1 (MQ=255) cTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATcc < 2:795610/150‑1 (MQ=255) cACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGt < 1:2715263/150‑1 (MQ=255) 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gCACCAGGCGCGCTGGGTGGTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGa < 2:4405915/150‑1 (MQ=255) ttccAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGGGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGAc > 2:3758875/3‑150 (MQ=255) aCCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTAGGACa > 1:3733723/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCACGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCGTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGAGGCCGGGGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCt > 2:2670079/1‑150 (MQ=255) gcgcgcTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCGCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGGGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGGTCGGACATGCTg > 1:3068913/1‑150 (MQ=255) cgcTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTggcg < 2:2151474/150‑1 (MQ=255) cTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTggcggc < 1:4261463/150‑1 (MQ=255) cTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTggcggc < 2:466503/150‑1 (MQ=255) cTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGATCGCCGGCCCTTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGAAAGCGCCTTGGCCGTTGGTGTAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCATACTGTTGCTTTCGGAAATGCTggcggc < 2:3556509/150‑1 (MQ=255) ggTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGgt < 1:1221195/150‑1 (MQ=255) ggTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGgt < 1:1016429/150‑1 (MQ=255) gtTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCCGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCCTGGCCTACAGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTc > 2:128758/1‑150 (MQ=255) cgcgGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTgcgc < 1:728660/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGGGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTgcgc > 1:4269434/1‑150 (MQ=255) gggCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCAcc > 2:2996543/1‑150 (MQ=255) 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ggCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTg < 2:1828368/150‑1 (MQ=255) acTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGTGCACCAGTTgg < 2:1263467/149‑1 (MQ=255) | GCCTCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCT > NC_002947/2865646‑2865943 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |