| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,059,765 | A→T | 5.0% | Y258N (TAT→AAT) ‡ | PP_5538 ← | ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,059,765 | 0 | A | T | 5.0% | 614.1 / 13.1 | 176 | Y258N (TAT→AAT) ‡ | PP_5538 | ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (80/86); new base T (2/7); total (83/93) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
AGCCATCCAGGCGGCGAAGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTCCAGGTTTTTTCCGCGA > NC_002947/3059616‑3059914 | aGCCATCCAGGCGGCGAAGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATa < 2:521183/150‑1 (MQ=255) gCCATCCAGGCGGCGAAGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATAc < 1:3205315/150‑1 (MQ=255) ccATCCAGGCGGCGAAGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATAcc > 1:1567997/1‑150 (MQ=255) ccATCCAGGCGGCGAAGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATAcc > 1:443819/1‑150 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCt < 1:2128070/150‑1 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCt > 1:1527810/1‑150 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCAGACGTGGTATCCACGTcc < 1:3231210/150‑2 (MQ=255) ggcggcGAAGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTg < 1:3908902/150‑1 (MQ=255) ggcggcGAAGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCAGACGTGGTATCCACGTccg < 1:4155318/150‑3 (MQ=255) ggcggcGAAGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCAGACGTGGTATCCACGTccg < 1:1814861/150‑3 (MQ=255) cgAAGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCAGACGTGGTATCCACGTCCGGtggc < 2:3457660/150‑4 (MQ=255) aaGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGAGTACCTGCCCTACCAGACGTGGTATCCACGTCCGGtggc < 1:4482712/150‑4 (MQ=37) gTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAg > 2:800139/1‑150 (MQ=255) gTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAg < 2:307043/150‑1 (MQ=255) tCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAgg > 2:390753/1‑150 (MQ=255) tCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAgg < 2:3635543/150‑1 (MQ=255) ggTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACt > 1:1092755/1‑150 (MQ=255) ggTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACt > 2:4140717/1‑150 (MQ=255) gTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTc < 2:1833177/150‑1 (MQ=255) ttcatCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCg > 2:1421506/1‑150 (MQ=255) ttcatCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCg > 1:2920386/1‑150 (MQ=255) ttcatCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGGAGGGCAGGTACTCGCCg > 1:4272106/1‑150 (MQ=255) tcatCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGa > 1:2688363/1‑150 (MQ=255) catCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGaa < 1:3597358/150‑1 (MQ=255) catCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGaa < 2:1360316/150‑1 (MQ=255) catCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGaa < 2:4240347/150‑1 (MQ=255) catCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGaa < 2:1180978/150‑1 (MQ=255) atCCATCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCTGCCCCGAAGGTTTACACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGAACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAg > 1:1241033/1‑150 (MQ=255) atCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCTGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAg > 1:1240958/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTATCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGGCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑CCCGGACGTGGATACCACGGCTGGTCGGGCAGGTACTCGCCGAAGTcc > 2:3745729/1‑149 (MQ=255) gcgcCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCAcc > 2:3934145/1‑150 (MQ=255) gcCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACcgc < 1:2965852/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTtc < 2:1028101/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTtc < 2:2834608/150‑1 (MQ=255) tGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTtcgtcg < 2:2054543/150‑1 (MQ=255) tGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTtcgtcg < 2:2054892/150‑1 (MQ=255) tGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTtcgtcg < 2:4323221/150‑1 (MQ=255) tGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTtcgtcg < 2:92198/150‑1 (MQ=255) tGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTtcgtcg < 1:4049477/150‑1 (MQ=255) gCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGcc > 1:534803/1‑150 (MQ=255) cTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGccac < 2:1066973/150‑1 (MQ=255) tCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGccacc > 2:4338929/1‑150 (MQ=255) cGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGccacca < 2:2694662/150‑1 (MQ=255) cGTTTGTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTAcc < 2:2402597/150‑1 (MQ=255) ttttGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCAcg < 2:1989337/150‑1 (MQ=255) ttGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCAcgtc < 1:2455706/150‑1 (MQ=255) ttGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCAcgtc < 1:2830196/150‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACt > 1:1578934/1‑150 (MQ=255) cTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTc < 2:2448312/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTc < 1:2123370/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTc > 1:1095971/1‑150 (MQ=255) tGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCg > 2:3285944/1‑150 (MQ=255) gccgccCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCa < 1:2628343/150‑1 (MQ=255) gccgccCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCa < 2:46257/150‑1 (MQ=255) gccgccCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCa < 1:4396340/150‑1 (MQ=255) ccGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTgg < 2:3055995/150‑1 (MQ=255) gAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGt < 2:125805/150‑1 (MQ=255) gAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGt > 2:3559498/1‑150 (MQ=255) gAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGt > 2:665806/1‑150 (MQ=255) aaGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTg > 1:3547862/1‑150 (MQ=255) ccACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCg < 1:663184/150‑1 (MQ=255) ccACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCg < 1:564103/150‑1 (MQ=255) cACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCgg > 1:4366954/1‑150 (MQ=255) cACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACAACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCgg > 2:2146292/1‑150 (MQ=255) aCCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGc < 1:1388528/150‑1 (MQ=255) aCCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGc > 2:2172175/1‑150 (MQ=255) tCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGt < 1:2783000/150‑1 (MQ=255) tCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTA‑GTCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTc > 2:3155493/1‑150 (MQ=255) tgtgCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCgg < 1:3438769/150‑1 (MQ=255) gtgCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGc < 1:2809585/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCt < 2:3369643/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCt > 1:1113845/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTg < 1:2426857/150‑1 (MQ=255) cAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTgg < 2:4044495/150‑1 (MQ=255) gCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGgc > 2:409370/1‑150 (MQ=255) gCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGgc > 2:535422/1‑150 (MQ=255) gCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGgc > 2:2664875/1‑150 (MQ=255) ccGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCCGACGTGGAAACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGAGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGgcgc > 2:1806347/1‑150 (MQ=255) gggggTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTgcg < 2:397400/150‑1 (MQ=255) tCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCt < 1:2401924/150‑1 (MQ=255) tCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGACAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCt > 2:2330628/1‑150 (MQ=255) cAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTg < 2:1241033/150‑1 (MQ=255) cccTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCg > 2:2883460/1‑150 (MQ=255) ccTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGt > 1:1743476/1‑150 (MQ=255) cTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGtt < 1:1172616/150‑1 (MQ=255) cTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGtt > 1:1831878/1‑150 (MQ=255) gggTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGt > 2:2133051/1‑150 (MQ=255) gCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTc > 2:2649675/1‑150 (MQ=255) gCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTc > 2:2299063/1‑150 (MQ=255) aCCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTCCAg < 1:1303818/150‑1 (MQ=255) agACGTGGTATCCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTCCAGGtt > 1:664817/2‑150 (MQ=255) aCGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTCCAGGtttt < 2:1541061/150‑1 (MQ=255) aCGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTCCAGGtttt < 2:1527810/150‑1 (MQ=255) gTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTCCAGGtttttt < 1:3066898/150‑1 (MQ=255) tGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTCCAGGTTTTTTc < 2:1388474/150‑1 (MQ=255) ggATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTCCAGGTTTTTTcc > 2:4473879/1‑150 (MQ=255) gATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTCCAGGTTTTTTCcg > 2:4418946/1‑150 (MQ=255) aCCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTCCAGGTTTTTTCCGCGa < 1:3804028/150‑1 (MQ=255) aCCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTCCAGGTTTTTTCCGCGa > 1:3979185/1‑150 (MQ=255) aCCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTCCAGGTTTTTTCCGCGa < 1:1053315/150‑1 (MQ=255) | AGCCATCCAGGCGGCGAAGTCACGGTCATTCATCCAGCGCCCGGCCTGGGCCTCGAAGCGTTTTTGCAACTGCGCCGCCCCGAAGGTTTCCACCGTCTTGTGCCAGCCCGTGGGGGTCAGGCCCTGGGTACCGGCC‑‑ACCGGACGTGGATACCACGTCTGGTAGGGCAGGTACTCGCCGAAGTCACCGCGTTCGTCGGCCACCAGTACCACGTCGTACTCGGCAGTCTGGGTGAACAGCGGCATGTCGGCCTGGGCGCTGCGGCGCTGGTCGTTGTCGAAGGTCCAGGTTTTTTCCGCGA > NC_002947/3059616‑3059914 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |