| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,072,452 | C→T | 5.1% | intergenic (+55/‑299) | aldB‑II → / → pqqD‑II | aldehyde dehydrogenase/coenzyme PQQ synthesis protein D |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,072,452 | 0 | C | T | 5.1% | 581.7 / 13.3 | 175 | intergenic (+55/‑299) | aldB‑II/pqqD‑II | aldehyde dehydrogenase/coenzyme PQQ synthesis protein D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (100/66); new base T (6/3); total (106/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.40e-01 | |||||||||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
TTGGCCGTGAGACCCACAAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCATTAATGCTTCTACCGGAATC > NC_002947/3072303‑3072600 | ttGGCCGTGAGACCCACAAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTcc > 1:2387094/1‑150 (MQ=255)ttGGCCGTGAGACCCACAAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTcc < 2:1028697/150‑1 (MQ=255)ttGGCCGTGAGACCCACAAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTcc < 1:2486288/150‑1 (MQ=255) gTGAGACCCACAAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAAcc < 2:2510390/150‑1 (MQ=255) tGAGACCCACAAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCg < 1:3640415/150‑1 (MQ=255) agaCCCACAAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGt < 1:301306/150‑1 (MQ=255) agaCCCACAAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGt < 2:2675435/150‑1 (MQ=255) ccaccaGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTgcag > 2:3492422/1‑150 (MQ=255) ccACACGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGCACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCGTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTgaag < 2:2807530/150‑1 (MQ=255) ccACAAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTgaag > 1:3781521/1‑150 (MQ=255) cacaAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTgaaga < 1:4044949/150‑1 (MQ=255) cacaAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCAACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTgaaga > 2:2566688/1‑150 (MQ=255) acaAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTgaagaa > 1:3137955/1‑150 (MQ=255) acaAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTgaagaa > 1:4019937/1‑150 (MQ=255) acaAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTgaagaa > 1:4402907/1‑150 (MQ=255) aGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCt > 2:1200391/1‑150 (MQ=255) gatgCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTgg < 1:1814776/150‑1 (MQ=255) gatgCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTgg < 2:1946867/150‑1 (MQ=255) cTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCGTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGgggc < 2:1120049/150‑1 (MQ=255) ttGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGgggcg < 1:921308/150‑1 (MQ=255) ttGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGgggcg > 2:1641651/1‑150 (MQ=255) tGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGgggcgg > 1:1460823/1‑150 (MQ=255) tGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGgggcgg < 2:3144113/150‑1 (MQ=255) aCCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGgggcgggc > 1:1736615/1‑150 (MQ=255) cATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCTCAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCGGTGGGggcgggcgt > 1:2199105/1‑149 (MQ=255) cATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGa > 1:1015871/1‑150 (MQ=255) cATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGa < 1:2481002/150‑1 (MQ=255) cATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGa > 1:1316820/1‑150 (MQ=255) aTTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAg > 2:3171006/1‑150 (MQ=255) ttATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGc < 1:1307926/150‑1 (MQ=255) aTCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGccc < 2:2603707/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCg > 1:852439/1‑150 (MQ=255) tCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCg < 1:1384214/150‑1 (MQ=255) agcagACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCa > 1:1215949/1‑150 (MQ=255) agACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCaaaa < 1:2685993/150‑1 (MQ=255) aCCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAgg < 1:809498/150‑1 (MQ=255) ccAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAggg > 1:3723411/1‑150 (MQ=255) ccAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAggg > 2:4425173/1‑150 (MQ=255) cAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGc > 1:2000103/1‑150 (MQ=255) cAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGc > 2:1131480/1‑150 (MQ=255) gAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCgg > 1:1681321/1‑150 (MQ=255) aaCCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGc > 1:938558/1‑150 (MQ=255) tgctgGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCAcat > 1:3632569/1‑150 (MQ=255) tgctgGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCAcat > 1:3632174/1‑150 (MQ=255) gctgGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCAcatg > 1:1377934/1‑150 (MQ=255) ggTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCAcatgcat < 2:226602/150‑1 (MQ=255) tGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGTGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATgg > 1:759246/1‑150 (MQ=255) gAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTACACCGCGTCGCGGCCTGCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGc < 1:3749902/150‑1 (MQ=255) gAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGc < 1:2865847/150‑1 (MQ=255) aGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGcc < 2:1280037/150‑1 (MQ=255) aGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGcc < 2:3177722/150‑1 (MQ=255) tACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTAc > 2:1203461/1‑150 (MQ=255) tACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTAc > 2:3308618/1‑150 (MQ=255) aCGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTAcc < 1:1439811/150‑1 (MQ=255) aCATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGt > 1:528561/1‑150 (MQ=255) aTCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTAc > 1:2084621/1‑150 (MQ=255) cAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCa > 2:634290/1‑150 (MQ=255) aaTCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCa < 1:1948374/77‑1 (MQ=255) tCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGACACATGCATGGCCTACCCGTACCAACg > 1:309716/1‑150 (MQ=255) ttcttcTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCaa < 1:3161312/150‑1 (MQ=255) ttcttcTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCaa > 2:4173685/1‑150 (MQ=255) ttctAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCt < 1:413818/150‑1 (MQ=255) tctAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGc < 2:3021439/144‑1 (MQ=255) tAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGt > 2:765602/1‑150 (MQ=255) aaaCCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGtt > 1:645519/1‑150 (MQ=255) aaaCCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGtt < 1:3981557/150‑1 (MQ=255) aaaCCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACACGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGtt > 2:4461953/1‑150 (MQ=255) aaCCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTc > 1:2618864/1‑150 (MQ=255) ccGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTTGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCAAATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCa > 1:971518/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTa < 1:1641651/150‑1 (MQ=255) gcgGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGc < 1:4346720/150‑1 (MQ=255) gCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCAtt < 1:4508143/150‑1 (MQ=255) gagcgGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCAGTCGGt > 2:2276084/3‑150 (MQ=255) cgcgGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTGCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTc < 2:3991630/150‑1 (MQ=255) cgGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCa < 2:2037689/150‑1 (MQ=255) gggCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCGGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCACAGTAGCATTCGGTCCAg > 2:3120453/1‑150 (MQ=255) ggCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGt < 2:243275/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCg > 1:3941894/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCg < 1:2919762/150‑1 (MQ=255) gCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCg < 2:2387094/150‑1 (MQ=255) ccccACAGGTTCTTCACCGGTTCTGGAACCAGCGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTg > 2:4183727/2‑150 (MQ=25) ccACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTa > 2:3205266/1‑123 (MQ=255) ccACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCa > 2:138386/1‑150 (MQ=255) cacaGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCAt > 2:4295957/1‑150 (MQ=255) cacaGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCAt > 2:854385/1‑150 (MQ=255) cacaGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCAt > 1:2533684/1‑150 (MQ=255) acaGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCAtt > 2:1638664/1‑150 (MQ=255) acaGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCAtt > 2:667582/1‑150 (MQ=255) acaGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCAtt > 1:2243389/1‑150 (MQ=255) gTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCATTAATg > 1:2785459/1‑150 (MQ=255) ttCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCATTAATGc > 1:3223733/1‑150 (MQ=255) ttCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCATTAATGc > 1:1061955/1‑150 (MQ=255) tCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCATTAATGCt < 1:3344145/150‑1 (MQ=255) cACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCATTAATGCtt < 2:1815764/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCATTAATGCTTCt < 2:3781521/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCATTAATGCTTCt > 1:226808/1‑150 (MQ=255) cTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCATTAATGCTTCTAcc < 2:2000103/150‑1 (MQ=255) gTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCATTAATGCTTCTACCGGa > 1:4311835/1‑150 (MQ=255) gTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCATTAATGCTTCTACCGGa > 1:4311812/1‑150 (MQ=255) ccAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACAAGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCATTAATGCTTCTACCGGAAtc > 2:68946/1‑150 (MQ=255) | TTGGCCGTGAGACCCACAAGATGATGCTTGACCATTATCAGCAGACCAAGAACCTGCTGGTGAGCTACGACATCAATCCGCTGGGCTTCTTCTAAACCGCGTCGCGGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTTCACCGCTGGTTCCAGAACCGGTGAAGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCAAAAGGGCCGGCACATGCATGGCCTACCCGTACCAACGCACCCCGCAAGCTCGTTCCAAAGTAGCATTCGGTCCAGTCCGCCCCCGTGCATTAATGCTTCTACCGGAATC > NC_002947/3072303‑3072600 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |