Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,725,648 | G→T | 10.2% | intergenic (+13/+17) | PP_3288 → / ← PP_3289 | universal stress protein family protein/acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,725,648 | 0 | G | T | 10.2% | 753.4 / 55.2 | 233 | intergenic (+13/+17) | PP_3288/PP_3289 | universal stress protein family protein/acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (102/107); new base T (9/15); total (111/122) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.89e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TGATATCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCATGCACTGA > NC_002947/3725500‑3725797 | tatCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAg < 2:3729928/150‑1 (MQ=255) tatCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAg < 2:1829605/150‑1 (MQ=255) atCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAgg < 1:3994011/150‑1 (MQ=255) atCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAgg < 2:3748715/150‑1 (MQ=255) cGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGc < 2:4279786/150‑1 (MQ=255) aCGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCt < 2:2971088/150‑1 (MQ=255) cGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCtt < 2:2938490/150‑1 (MQ=255) gTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTg > 2:2114617/1‑150 (MQ=255) tACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCTTGCGGGCCTTGt < 2:546957/150‑1 (MQ=255) tACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCTTGCGGGCCTTGt < 2:1952995/150‑1 (MQ=255) tACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCTTGCGGGCCTTGt < 2:1333198/150‑1 (MQ=255) tACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGt > 1:309423/1‑150 (MQ=255) aCTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCTTGCGGGCCTTGtg < 2:3851483/150‑2 (MQ=255) aCTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTc < 2:1267053/150‑1 (MQ=255) tGGTCATGGGCGGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGGTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCtt > 1:2122709/1‑150 (MQ=255) tGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCtt < 1:400703/150‑1 (MQ=255) tCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCTTGCGGGCCTTGtgcttca < 1:2328954/150‑7 (MQ=255) tCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCTTGCGGGCCTTGtgcttca < 2:3192285/150‑7 (MQ=255) aTGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCaa < 1:173169/150‑1 (MQ=255) gggCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCGGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAgg > 2:4371501/1‑150 (MQ=255) ttATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAg > 2:3413855/1‑150 (MQ=255) aTCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGt > 2:2125572/1‑150 (MQ=255) tCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTc < 2:1210560/150‑1 (MQ=255) tCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTc > 1:2577731/1‑150 (MQ=255) caccacCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCa > 1:385072/1‑150 (MQ=255) ccaccGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAg < 1:569456/150‑1 (MQ=255) caccGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGt > 1:2057536/1‑150 (MQ=255) gTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGt < 1:2993412/150‑1 (MQ=255) gTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGt < 2:4305574/150‑1 (MQ=255) gTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGt < 1:1436092/150‑1 (MQ=255) tGGCATCGGCTGGTTCAGCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACACGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTg < 1:1894908/150‑1 (MQ=255) ggCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTTATTTCTCCAGAGAGCTCCAAAGGATGAAGCACAAGTCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAATGCCGCAGGTCAAGTTCGTGc < 2:367336/150‑1 (MQ=255) gCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCa > 1:908780/1‑150 (MQ=255) cATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCCGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAg > 1:759306/1‑150 (MQ=255) aTCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGa > 1:2721461/1‑150 (MQ=255) tCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCACGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGaa < 2:1606927/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAAtc > 1:3227866/1‑150 (MQ=255) gCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAAtct > 2:1333890/1‑150 (MQ=255) gCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAAtct < 2:2745796/150‑1 (MQ=255) tGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGATCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCg < 1:2953136/150‑1 (MQ=255) ggTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGc < 1:1491408/150‑1 (MQ=255) gTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCt < 2:3913211/150‑1 (MQ=255) cgctCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTca > 2:3374869/4‑150 (MQ=255) cAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATcgcc < 2:4432711/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCggg > 2:3896408/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCgggg < 1:73606/150‑1 (MQ=255) cGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTa > 2:2242618/1‑150 (MQ=255) gTTATGCATCGGTGGTCCAGCAGTGTGCTGGTGAGTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAg < 2:3965082/150‑1 (MQ=255) ttATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAgg < 2:2498265/150‑1 (MQ=255) ttATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAgg < 2:4042719/150‑1 (MQ=255) gCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGaa < 1:3528527/150‑1 (MQ=255) gCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGaa < 2:1609279/150‑1 (MQ=255) gtggccAGCAGTGTGCTGGTGATTTCGCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCCAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCCGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGt < 2:4060884/146‑1 (MQ=255) cagcagTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCtt < 2:3293457/150‑1 (MQ=255) cagcagTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCtt < 2:4161837/150‑1 (MQ=255) cagcagTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCtt < 1:3712233/150‑1 (MQ=255) agcagTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTg > 1:1334882/1‑150 (MQ=255) cagTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGAc < 1:2275994/150‑1 (MQ=255) tGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGt > 2:765935/1‑150 (MQ=255) tGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGt < 1:1820846/150‑1 (MQ=255) gTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGc > 2:2219103/1‑150 (MQ=255) gTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGc > 2:3298451/1‑150 (MQ=255) gTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGc > 1:3580777/1‑150 (MQ=255) aTTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATc < 2:4018009/150‑1 (MQ=255) ttCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATcgc > 2:2277649/1‑150 (MQ=255) ctcCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGt < 2:3580777/150‑1 (MQ=255) tcCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTa > 1:2502889/1‑150 (MQ=255) tcCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTa < 1:813285/150‑1 (MQ=255) tcCAGAGCGCTCCCAAGGCCGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTa > 1:429286/1‑150 (MQ=255) cAGAGCGCTCCCCAGGCTGAAGCACCAGGCCCGCCAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGGTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGt < 1:2747472/150‑1 (MQ=255) gagCGCTCCCAAGGCTGAAGCACACCGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGACTCTCGCTCACATCGCCTCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTg < 2:1005134/150‑1 (MQ=255) gagCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTg < 2:1977226/150‑1 (MQ=255) agCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGc > 1:549528/1‑150 (MQ=255) agCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGc > 2:678205/1‑150 (MQ=255) gcgcTCCCCAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTGCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCt < 2:2885296/150‑1 (MQ=255) cgcTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTg < 1:3391890/150‑1 (MQ=255) cTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGc > 2:935064/1‑150 (MQ=255) tCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGcc > 1:4095058/1‑150 (MQ=255) tCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGcc > 1:2634122/1‑150 (MQ=255) ccAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAg < 1:449539/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAg < 1:4383867/150‑1 (MQ=255) cAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAgg > 1:1066670/1‑150 (MQ=255) cTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCt < 2:3802832/150‑1 (MQ=255) tGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTg > 2:1669976/1‑150 (MQ=255) tGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTg < 1:4248432/150‑1 (MQ=255) gaaaagacaAGGCCCTTGCGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTg > 1:3477810/7‑150 (MQ=255) gAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTgg > 1:699968/1‑150 (MQ=255) aagacaAGGCCCTTGCGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGgag > 2:1884209/4‑150 (MQ=255) acaAGGCCCTTGCGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGAcc > 2:3462225/1‑150 (MQ=255) acaAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGAcc < 1:2999473/150‑1 (MQ=255) acaAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGAcc > 2:3565178/1‑150 (MQ=255) caAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCa < 2:1419520/150‑1 (MQ=255) aaGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCAt > 1:326887/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCAt > 1:4191766/1‑150 (MQ=255) aGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCATg < 1:360345/150‑1 (MQ=255) aGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCATg < 1:2364927/150‑1 (MQ=255) aGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCATg < 1:2223681/150‑1 (MQ=255) gCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGGGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCATGCACTGa > 2:156194/1‑150 (MQ=255) gCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCATGCACTGa > 1:2301762/1‑150 (MQ=255) gCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCATGCACTGa > 2:1786319/1‑150 (MQ=255) | TGATATCGACGTACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCATGCACTGA > NC_002947/3725500‑3725797 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |