| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,823,966 | A→C | 64.5% | F395V (TTC→GTC) | kguT ← | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,823,966 | 0 | A | C | 64.5% | 254.0 / 242.5 | 217 | F395V (TTC→GTC) | kguT | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/37); new base C (79/61); total (119/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
TTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGCCGGCAGGATCTCGGGCACGATCGCGA > NC_002947/3823819‑3824115 | tttATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCa < 2:52602/150‑1 (MQ=255)tttATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGAGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGAGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCa > 1:1221331/1‑150 (MQ=255) ataCAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGt < 2:1764909/150‑1 (MQ=255) aCAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTaa > 2:3931423/1‑150 (MQ=255) aGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAaga < 1:4405887/150‑1 (MQ=255) aGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAaga > 2:2638754/1‑150 (MQ=255) aGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAaga > 2:3777913/1‑150 (MQ=255) aGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAaga < 1:2260890/150‑1 (MQ=255) gACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAgg > 2:215122/1‑150 (MQ=255) ttCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCg > 2:1101331/1‑150 (MQ=255) tctcttcttCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCgg < 1:1157549/147‑1 (MQ=255) tCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGACgg > 1:494462/1‑150 (MQ=255) cGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCggg < 2:327992/150‑1 (MQ=255) gCTTCCTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGgc < 1:3403104/150‑1 (MQ=255) ccttctaCATTGCAGGTTTCCTAATGTATCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGACTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGgc < 2:3671181/149‑1 (MQ=255) cttcttCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGgcc < 1:3787253/150‑1 (MQ=255) cttcttCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGgcc > 1:2964475/1‑150 (MQ=255) ttcttcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGATGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGgcc > 1:56910/1‑150 (MQ=255) ttcttcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGgccc > 2:811089/1‑150 (MQ=255) ttcttcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgccc < 1:3729434/150‑1 (MQ=255) cttcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGgcccgc < 1:1790923/150‑1 (MQ=255) ttcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGgcccgcc > 1:2843487/1‑150 (MQ=255) ttcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcccgcc > 2:716606/1‑150 (MQ=255) tcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGgcccgccc < 2:155137/150‑1 (MQ=255) tcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGgcccgccc > 2:800261/1‑150 (MQ=255) gCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTTGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGc < 2:625042/150‑1 (MQ=255) aGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGccc > 2:466410/1‑150 (MQ=255) ggTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGcccc > 1:2068103/1‑150 (MQ=255) tttCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCAt > 1:1700351/1‑150 (MQ=255) ttCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCAtt < 1:4472760/150‑1 (MQ=255) ccTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGa < 1:4108309/150‑1 (MQ=255) cTAATGGTTCATTGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGT‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCATCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTATCCCCATTGAg < 1:2240287/150‑1 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGATGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAg < 1:874088/150‑1 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAgg > 2:3194141/1‑150 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAgg > 2:2414255/1‑150 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAgg > 1:3169267/1‑150 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAgg > 1:1554116/1‑150 (MQ=255) tGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGATGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTa < 2:2274674/150‑1 (MQ=255) tGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGATGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTa < 2:2613095/150‑1 (MQ=255) tGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAg < 1:2943105/150‑1 (MQ=255) cATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGATGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCcca > 2:3520760/1‑150 (MQ=255) cATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccac > 2:495194/1‑150 (MQ=255) aTGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccacc > 2:4211076/1‑150 (MQ=255) tGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccacca < 2:1541959/150‑1 (MQ=255) ccAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGcc > 2:3559331/1‑150 (MQ=255) cAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCa > 2:2225161/1‑150 (MQ=255) aGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCAc > 1:2567773/1‑150 (MQ=255) aCGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGa < 2:3422380/150‑1 (MQ=255) aCGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGa > 1:3073873/1‑150 (MQ=255) aCGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGa < 2:1482217/150‑1 (MQ=255) aCGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGa < 2:2473896/150‑1 (MQ=255) gcgAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgc > 2:3981831/1‑150 (MQ=255) cgAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgcc < 1:3847266/150‑1 (MQ=255) gAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgccg > 1:449345/1‑150 (MQ=255) aGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgccgc > 2:324726/1‑150 (MQ=255) tATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCaa < 1:1885951/150‑1 (MQ=255) aTCGCGCTTTGCCCGGCCAGATGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCaa > 1:2759048/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCTTTGCCCGGCCAGATGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCaa > 2:4475561/1‑150 (MQ=255) tCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAAc < 1:320809/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGa > 1:1720966/1‑150 (MQ=255) cgcTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAg > 1:2374323/1‑150 (MQ=255) tttGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGccc > 1:3066930/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCa < 1:349960/150‑1 (MQ=255) aga‑gGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCAt > 1:1976882/1‑150 (MQ=255) gTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTg < 1:28346/150‑1 (MQ=255) tCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGt > 1:1307434/1‑150 (MQ=255) cTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGtt < 1:1384594/150‑1 (MQ=255) cTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGtt < 1:3661333/150‑1 (MQ=255) 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> 2:2724749/1‑150 (MQ=255) aaGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGc < 1:2989801/150‑1 (MQ=255) cACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGtt > 1:893091/1‑150 (MQ=255) tGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGc < 1:3177712/150‑1 (MQ=255) tGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGc < 1:3323502/150‑1 (MQ=255) tGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGc < 1:1227602/150‑1 (MQ=255) 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gcACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGCGCCGCCAAACGAGCCCATCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGCCGGCATGATCTCg < 1:2290041/150‑1 (MQ=255) gcACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGCCGGCAGGATCTCg < 2:2964475/150‑1 (MQ=255) caccacACCTGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCAGGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGCCGGCAGGATCTCgg < 2:88691/150‑1 (MQ=255) caccacACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGCCGGCAGGATCTCgg > 1:3999326/1‑150 (MQ=255) accacACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGCCGGCAGGATCTCggg > 2:1290326/1‑150 (MQ=255) cacacaTGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGCCGGCAGGATCTCGGGcc > 1:4221876/1‑149 (MQ=255) acacaTGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGCCGGCAGGATCTCGGGCAc < 1:3615803/150‑1 (MQ=255) acacaTGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGCCGGCAGGATCTCGGGCAc < 2:2843448/150‑1 (MQ=255) acacaTGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGCCGGCAGGATCTCGGGCAc > 2:685255/1‑150 (MQ=255) aTGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGCCGGCAGGATCTCGGGCACGATc < 2:1982946/150‑1 (MQ=255) gAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGCCGGCAGGATCTCGGGCACGATcgc < 2:2543450/150‑1 (MQ=255) | TTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGCTGTTGATCAGCGCCATGGCGCCGCCTGCGACGTTGGCCGGCAGGATCTCGGGCACGATCGCGA > NC_002947/3823819‑3824115 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |