Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,824,695 | G→C | 100% | L152V (CTG→GTG) | kguT ← | 2‑ketogluconate transporter, putative |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,824,695 | 0 | G | C | 100.0% | 668.4 / NA | 183 | L152V (CTG→GTG) | kguT | 2‑ketogluconate transporter, putative |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (86/97); total (86/97) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
CGCTCAGCCAAGCCACCTGGGCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGT > NC_002947/3824548‑3824841 | cgctcAGCCAAGCCACCTGGGCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACaa < 2:2335645/150‑1 (MQ=255) gctcAGCCAAGCCACCTGGGCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAAt > 2:2630662/1‑150 (MQ=255) ctcAGCCAAGCCACCTGGGCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATg < 2:27940/150‑1 (MQ=255) tcAGCCAAGCCACCTGGGCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATgg > 1:4045818/1‑150 (MQ=255) tcAGCCAAGCCACCTGGGCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATgg > 1:1760773/1‑150 (MQ=255) tcAGCCAAGCCACCTGGGCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATgg > 2:2935069/1‑150 (MQ=255) ccaagccaCCTGGGCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCAc < 1:391060/150‑1 (MQ=255) ccaagccaCCTGGGCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAAGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCAc < 1:770893/150‑1 (MQ=255) aagccaCCTGGGCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCg > 2:3207440/1‑150 (MQ=255) caCCTGGGCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGtt < 1:2155995/150‑1 (MQ=255) gggCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACCTCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCa < 2:2664938/150‑1 (MQ=255) gggCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCa < 2:71957/150‑1 (MQ=255) ggCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAg > 1:2642407/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAgtc > 1:2965309/1‑148 (MQ=255) ccGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAgta > 2:229332/1‑148 (MQ=255) gggCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATc > 1:742203/1‑150 (MQ=255) ggCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCa < 1:844888/150‑1 (MQ=255) ggCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCa < 1:1731698/150‑1 (MQ=255) gTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGaa < 1:3552291/150‑1 (MQ=255) gTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGaa < 2:1761966/150‑1 (MQ=255) gTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGaa < 1:2693231/150‑1 (MQ=255) gTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACACCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGaa < 1:4301941/150‑1 (MQ=255) tCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAGCGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAg > 1:2589890/1‑150 (MQ=255) tCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAg < 1:1447010/150‑1 (MQ=255) tCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGgtg > 2:1507373/1‑150 (MQ=255) caccaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTACCCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCCCCGGGGTGCCCCGCATCAGGAAGGTGtt > 1:4466821/1‑150 (MQ=255) caccaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGtt < 1:3661396/150‑1 (MQ=255) aGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGgcg > 2:2744416/1‑150 (MQ=255) ggCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGgcgc < 2:4121672/150‑1 (MQ=255) ggCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGgcgc < 1:2527897/150‑1 (MQ=255) ggCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGgcgc < 1:1182404/150‑1 (MQ=255) cgcCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGt < 2:266418/150‑1 (MQ=255) cgcCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGt < 1:1423144/150‑1 (MQ=255) cgcCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGt < 1:1973643/150‑1 (MQ=255) gcCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTg < 2:624840/150‑1 (MQ=255) accaGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAAc > 1:317540/1‑150 (MQ=255) accaGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAAc > 2:305047/1‑150 (MQ=255) gaagaaCGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTc < 1:386787/150‑1 (MQ=255) cGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCg < 2:471262/150‑1 (MQ=255) gCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCATGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCgg > 2:3269421/1‑150 (MQ=255) gCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCgg < 1:893745/150‑1 (MQ=255) gCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCgg > 1:1228050/1‑150 (MQ=255) gCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCgg > 2:655655/1‑150 (MQ=255) ccAGATCACGGCAGGCGGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGt > 2:944451/1‑150 (MQ=255) ccAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGt > 1:3394962/1‑150 (MQ=255) ccAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGt > 2:671641/1‑150 (MQ=255) ccAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGt < 1:4273600/150‑1 (MQ=255) aGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGa > 1:1340657/1‑150 (MQ=255) cGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAAt < 1:3010707/150‑1 (MQ=255) gcaggcagGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGgcgc > 2:3730872/1‑121 (MQ=255) gcaggcagGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATgg > 1:3465522/1‑150 (MQ=255) aggcaggcCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGca > 2:4170233/1‑150 (MQ=255) aggcaggcCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGca > 1:2937660/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) ggTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCa < 1:676908/150‑1 (MQ=255) ggTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCa > 2:2895562/1‑150 (MQ=255) gTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAgg > 1:2848841/1‑55 (MQ=255) gTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAgg < 2:2848841/55‑1 (MQ=255) ccGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAg < 1:2886623/150‑1 (MQ=255) cGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGACGc > 2:3346467/1‑150 (MQ=255) cGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGc < 2:1248825/150‑1 (MQ=255) cGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGc > 2:314687/1‑150 (MQ=255) cGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGc > 1:1583990/1‑150 (MQ=255) ggACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCg > 2:1290663/1‑150 (MQ=255) gACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCgg > 1:1099979/1‑150 (MQ=255) acacCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGa < 1:3960618/150‑1 (MQ=255) accaccGACCTCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGACCCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCCTGACCGCAGCCTCCCCCACCCCGAGCCGGAAGCGGATg > 1:629566/1‑150 (MQ=255) ccaccGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGc < 1:539390/150‑1 (MQ=255) caccGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGcc > 2:1299813/1‑150 (MQ=255) caccGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGcc < 1:440500/150‑1 (MQ=255) 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CGCTCAGCCAAGCCACCTGGGCCGGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGT > NC_002947/3824548‑3824841 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |