| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 3,824,717 | C→T | 82.4% | M144I (ATG→ATA) | kguT ← | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_002947 | 3,824,717 | 0 | C | T | 82.4% | 449.2 / 79.3 | 187 | M144I (ATG→ATA) | kguT | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (16/17); new base T (71/83); total (87/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 | |||||||||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGT > NC_002947/3824571‑3824863 | ggCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCa < 1:1731698/150‑1 (MQ=255) gTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGaa < 2:1761966/150‑1 (MQ=255) gTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGaa < 1:2693231/150‑1 (MQ=255) gTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGaa < 1:3552291/150‑1 (MQ=255) gTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACACCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGaa < 1:4301941/150‑1 (MQ=255) gTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCATTCGATTATGAACATCCATCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATTGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAggta < 1:796618/150‑3 (MQ=255) tCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAg < 2:157061/150‑1 (MQ=255) tCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAg < 1:1447010/150‑1 (MQ=255) tCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGgtg > 1:4430916/1‑150 (MQ=255) ccaccaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGgtgt > 2:3420833/1‑150 (MQ=255) caccaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGtt > 2:3335854/1‑150 (MQ=255) caccaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGtt < 1:3661396/150‑1 (MQ=255) caccaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGtt < 1:468973/150‑1 (MQ=255) accaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTCATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTg > 2:3553488/1‑150 (MQ=255) aGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGgcg > 2:2744628/1‑150 (MQ=255) ggCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGgcgc < 2:4121672/150‑1 (MQ=255) ggCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGgcgc < 1:1182404/150‑1 (MQ=255) ggCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACACAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGgcgc < 1:2527897/150‑1 (MQ=255) 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GGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGT > NC_002947/3824571‑3824863 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |