| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,152,000 | 0 | A | T | 6.6% | 444.0 / 7.8 | 143 | intergenic (+33/‑364) | PP_3654/PP_3655 | leucine‑responsive regulatory protein/cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (61/70); new base T (6/4); total (68/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.18e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
CGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCCT > NC_002947/4151855‑4152149 | cGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACC < 2:3341078‑M1/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCC > 1:3689101‑M1/1‑150 (MQ=255) cGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGC < 1:3323776‑M1/150‑1 (MQ=255) 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cAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTTACCcgcgaagg < 1:4082548/150‑5 (MQ=255) gagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGc < 2:562416‑M1/24‑1 (MQ=255) aGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCAGc > 2:1968866/1‑150 (MQ=255) gtaggtGTATGAGGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGGTTGAGCTCGAGGTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGGTCCCCTTGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCGGGCCCCTTCGCGGGTTTAGCCGCGCCTggg > 2:1908920/6‑148 (MQ=255) gAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTAACCCGCGCCTGCa > 2:146134/1‑150 (MQ=255) 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gCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGccc < 1:453076/150‑1 (MQ=255) ccTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTc < 2:111387/150‑1 (MQ=255) aCCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAg < 1:3648228/150‑1 (MQ=255) ccAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCCCGCCAGCAAAGGTGACGTAGCCCCTCGCAgg > 1:2545470/1‑150 (MQ=255) aGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAg > 2:3952723‑M2/1‑149 (MQ=255) 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cgcgGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacttttgcaggcgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttc < 2:3479090‑M1/150‑136 (MQ=255) GGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCgccgcc < 2:1803505‑M1/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggacacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacatg < 2:3721181‑M2/150‑110 (MQ=255) gTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacatt < 2:2155313‑M2/150‑110 (MQ=255) GTAAACCCGCGCCTGCAACGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGccc > 2:776802‑M1/1‑150 (MQ=255) 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CGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCCT > NC_002947/4151855‑4152149 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |