| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,161,048 | 0 | A | G | 9.4% | 499.4 / 28.1 | 171 | intergenic (+30/‑179) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (61/91); new base G (8/8); total (72/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.94e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
GCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑‑‑GGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAA‑GGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAG > NC_002947/4160900‑4161197 | gCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGGAA > 2:4024546‑M1/1‑150 (MQ=255) ttCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAAC < 1:2337863‑M1/150‑1 (MQ=255) cAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCC < 1:4098217‑M1/150‑1 (MQ=255) 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TAAACCCGCTCCTACA‑‑‑GGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAA‑GGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAaagaa > 2:2025070‑M1/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTCCA‑‑‑GGTGGGTGCGGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAA‑GGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAaagaag < 1:2991758/150‑1 (MQ=255) | GCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑‑‑GGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAA‑GGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAG > NC_002947/4160900‑4161197 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |