| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,863,154 | A→C | 9.4% | intergenic (‑138/+99) | ligA ← / ← PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,863,154 | 0 | A | C | 9.4% | 495.8 / 18.7 | 173 | intergenic (‑138/+99) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (95/56); new base C (2/18); total (99/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.07e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
TTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCG > NC_002947/4863005‑4863303 | ttCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTa < 1:3864449/150‑1 (MQ=255) tCGGCGGTCATGGGATGTGTCTTCTCTTGCCAAGCAAAAGAGCCGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACACGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTAc < 2:3006431/150‑1 (MQ=255) cggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTAcc < 1:387953/150‑1 (MQ=255) cggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTAcc < 1:387932/150‑1 (MQ=255) ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCt < 1:1916109/150‑1 (MQ=255) ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCt < 2:4211833/150‑1 (MQ=255) ggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTa < 2:3786584/150‑1 (MQ=255) gTCACGGGATGTGCCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAg < 1:4193231/150‑1 (MQ=255) cATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGa < 2:4387770/150‑1 (MQ=255) cATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTAATGTACCTGTAGGa < 1:3567663/150‑1 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCGCCCACAAGGGCG‑GCACAATCCCAACGGC‑GGGGTTGTAACCGTAGGAGc > 1:879090/1‑150 (MQ=255) gggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCACCCACAAGGGCG‑GCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGC‑g > 2:8889/1‑150 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑gg < 1:3781116/150‑1 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑gg < 2:1277005/150‑1 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCGTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑gg < 1:3930224/150‑1 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACA‑TCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑ggg < 1:2345999/150‑1 (MQ=14) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑ggg < 1:2924260/150‑1 (MQ=255) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACA‑TCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑GGGt < 1:3792041/150‑1 (MQ=14) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGt < 1:2739997/150‑1 (MQ=255) ttGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGttt > 2:1410432/1‑150 (MQ=255) tcttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGC‑GGGTTTAcc > 2:668239/1‑150 (MQ=255) tcttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGGAAACCCCACCCCCAACGGCG‑GCACAAGCCCCAGGGG‑GGGGGTGTTCCGGGGGGTGCGGGGTTTAc > 1:1880939/1‑150 (MQ=255) cttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTAccc < 1:3865729/150‑1 (MQ=255) cttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTAccc < 1:2362108/150‑1 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCCACAAGGGCG‑TCACAAGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGGTTACCcg > 1:1813766/1‑150 (MQ=255) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCcgc > 1:2560542/1‑150 (MQ=255) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCcgc < 1:375160/150‑1 (MQ=255) ctctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGC‑GGGGTTACCcccg > 1:2218156/1‑150 (MQ=255) ctctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGGACCGGTAGGAGC‑GGGTTTTCCcgcg > 2:4301207/1‑150 (MQ=255) ctTGCAAAGCAAATGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGaa < 2:3044669/150‑1 (MQ=255) ctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGaa < 2:3696969/150‑1 (MQ=255) ctTGAAAAGCAATAGAGCAGCTTGGGGTGGTGGGTGGGTTTCCTGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGTTAAACCCGCTCCCACAAGGGCT‑TCACTTGCCCTTGGGC‑GTTTATGTACCTTTTGGAGG‑GGGTTTACCCGCGaa < 2:1333197/150‑1 (MQ=255) tGCACAGCAAACGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAaga < 2:2660826/150‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGAAACCCCCGCCCCCAAGGGCG‑GCACCAGCCCGACGGC‑GGGGGTGTACCGGGGGGGGC‑GGGGTTTCCcccgccgag > 1:839456/1‑145 (MQ=255) caaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGCGCCCCAAAGGGCG‑GCACAAGCCCAAGGGC‑GGTGGTGTAACGGTATGAGC‑GGGTTTAACCCCGCAGAgg > 1:1986990/1‑150 (MQ=255) acagaaaatGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGTTAAACCCGCTCCCAAATGGGCG‑TCAATTGCCATAGGGC‑GGTTATGTACCTGTAGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGc < 2:4240634/145‑1 (MQ=255) aagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTAACCGCGAAGAGGcc > 2:2761889/1‑150 (MQ=255) gacgaaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑gg > 2:3755867/5‑130 (MQ=255) aaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCCACAACGGCG‑GCACAATCCCCAGGGC‑CGGGGTTTAACGGTAGGGGC‑CGGGTTAACCGCCAAGAGGCCGGcccc > 1:2277676/1‑147 (MQ=255) gagCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAgg > 2:822605/1‑150 (MQ=255) agcagcTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCCCCCACGGCG‑GCCCAAGCCCTAGGGC‑GGGGGTGTAGCGGTTGGCGC‑GGGTTTAACCGCGGAGATGCCCGCCCAGGc > 1:2751263/1‑150 (MQ=255) cgcTTGGGGTGTTGCGTGGGGTCCCCGGGTTCGGTTTACTGTGCCAGCCTCTTCGGGGGAAAACCCGCTCCCACAGGGGCG‑TCACCTGCCCTCGGGG‑GGTGATGTACCTGTAGGAGG‑GGGTTTCCCCGCTAAGAGGCCGGCACAGGCAac < 2:1976838/149‑1 (MQ=255) agcTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCTGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCACCCACACGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGACCCTGTAGGAGG‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAac < 2:3595882/150‑1 (MQ=37) gcTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTGGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAacg > 2:316867/1‑150 (MQ=255) gtggtgCGTGGGGTTCCTGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCGCTGCGCGGGTAACCCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCATCGGGG‑GTTGTTGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAc < 2:2959070/150‑1 (MQ=38) cGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTAGCGGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAAc > 2:1139460/1‑150 (MQ=255) gTTCCTGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTGCGCGGGTAACCCCGCTCCCACACGGGCG‑TCACCTGCCCTCGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCa < 2:2579889/150‑1 (MQ=38) gTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTAc > 2:2239081/1‑105 (MQ=255) gTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTAc < 1:2239081/105‑1 (MQ=255) tGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAg > 2:3366867/1‑150 (MQ=255) tGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAg > 2:3380983/1‑150 (MQ=255) ttGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCACCCCCAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGGGGTGTACCTGTAGGGGC‑GGGGTTTCCCGCGTAGAGGCCGGCACAGGCAACGTCGGTAACCGAACCCGCCCGCACGCCCGCAGgc > 1:1487434/1‑150 (MQ=255) aCTGGGCCCGCCCCTCCGCGGGTAACCCCGCCCCCCCCCGGCCG‑CCACAGCCCCTCGGGG‑GGTGTGGTCCCGTCCGGCGC‑GGGTTTCCCCGGGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGgctgc < 2:1976805/150‑1 (MQ=255) ccAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCTCCCACAAGGGCG‑TCACAAGCCCAAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCCCGAAGAGGCCGGCACCGGCAACGACGATACCCGAACCCGCCAGCACGCCCGCAGGCTGCTCTTTc > 2:1224950/1‑150 (MQ=255) aGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCCCATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGGAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGACGAGGCCGGCACCGGCCACGACGATACCCGAACCGGCCCGCACGCCCTCAGGCGGCTCTTGCgg > 2:297570/1‑149 (MQ=38) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACACGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTc < 2:4509289/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCCACACGGGCG‑TCACAGGCCCTAGGGC‑GGTGAGGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCt < 2:3743939/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCt > 2:3507849/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑gg > 1:1633984/1‑70 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑gg < 2:1633984/70‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACA‑TCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGAt > 2:4110121/1‑150 (MQ=11) gggTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTc > 2:1887487/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCCCCCACCCGGGGGTTCACCTCCCTTGGGGG‑GGTGTTGTCCGTGTGGGGGG‑GGTTTCCCCCGCGACGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGt < 2:20499/150‑1 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCa > 1:2355553/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATGCCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 1:31276/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCtt > 1:646161/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:642249/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 2:4257384/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 2:2440797/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:2503532/1‑150 (MQ=255) cGCTCCCACACGGGCG‑TCACTGCCCCTTGGGC‑GGTGTTTTACCTGTAGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCt < 2:3063247/150‑1 (MQ=38) cGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCt > 1:3155173/1‑150 (MQ=255) ccACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt > 1:594586/1‑150 (MQ=255) cacaCGGGCG‑TCACATGCCCTCGGGC‑GGTGTTGTCCCTGTTGGCGG‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTa < 2:2180008/150‑1 (MQ=38) cacaAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTa > 1:4125457/1‑150 (MQ=255) cacaAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGACGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTa > 2:1657540/1‑150 (MQ=255) acaAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAg > 1:446366/1‑150 (MQ=255) ggCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCAc > 2:3207339/1‑150 (MQ=255) gCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAACCGAACCGGCCAGCACGACCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACg > 2:2218294/1‑150 (MQ=255) g‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGgc > 1:540768/1‑150 (MQ=255) cacaTGCCCTTGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGgcgc < 2:1451176/150‑1 (MQ=255) cacaTGCCCTCGGGC‑GGTGCTGTCCCTGTCGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGgcgc < 2:2898594/150‑1 (MQ=39) cacaTGCCCTCGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGgcgc < 2:2590495/150‑1 (MQ=255) cacaGGCCCTTGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGgcgc < 2:2590382/150‑1 (MQ=255) cctggCCCTGGGGG‑GGTTTTGTACCTTTTGGTGG‑GGTTTCACCCGCTATGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCt < 1:1410432/146‑1 (MQ=255) acaTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCt > 1:1241654/1‑150 (MQ=255) acaTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCt > 1:982559/1‑150 (MQ=255) acaTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCt > 1:4276780/1‑150 (MQ=255) acaTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCt > 1:3492250/1‑150 (MQ=255) tggggg‑ggTGTTGTCCTTGTCGGCGG‑GTGTTCACCCGCTATGTGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcg < 1:4246520/148‑1 (MQ=255) tAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcg > 2:1154622/1‑150 (MQ=255) tgggg‑ggTGTTGTACCTGTCGGCGC‑GGGTTTACCCGCTAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcga < 2:2143117/149‑1 (MQ=39) c‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGAt > 2:568471/1‑150 (MQ=255) ggTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATa > 1:2238271/1‑150 (MQ=255) tttgcaCCTGTTGGCGG‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGc < 1:668239/145‑1 (MQ=255) gATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGc > 1:438946/1‑150 (MQ=255) aTGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCt > 2:2514233/1‑150 (MQ=255) aTGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCt > 1:1199462/1‑150 (MQ=255) aCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCg > 2:1203451/1‑150 (MQ=255) aCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCg > 1:2832746/1‑150 (MQ=255) | TTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCG‑TCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCG > NC_002947/4863005‑4863303 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |