New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1811061 = | 14 (0.840) | 3 (0.190) | 3/270 | 1.8 | 22.1% | coding (334/708 nt) | ispD | 2‑C‑methyl‑D‑erythritol 4‑phosphate cytidylyltransferase |
? | NC_002947 | 1811088 = | 8 (0.510) | coding (361/708 nt) | ispD | 2‑C‑methyl‑D‑erythritol 4‑phosphate cytidylyltransferase |
ACCCGTACTGGCCTGGCCTGCGCTGCGCCAGCGACCCACGCATCCACTGCGCGGCGGGCGGGCGTGAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGCGGTGCCGGCGCGCGACACCCTCAAGCGTGCCGACAGCCATGGCCGGGTGAGTGCTACCGTG > NC_002947/1810912‑1811204 | aCCCGTACTGGCCTCGCCTGCGCTGCGCCAGCGACCCACGCATCCACTGCGCGGCGGGCGGGCGTGAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGAtg < 2:215566/150‑1 (MQ=255) aCCCGTACTGGCCTAGCCTGCGCTGCGCCAGCGACCCACGCATCCACTGCGCGGCGGGCGGGCGTGAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGTACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGAtg < 2:215561/150‑1 (MQ=255) tggcctggccTGCGCTGCGCCAGCGACCCACGCATCCACTGCGCGGCGGGCGGGCGTGAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCgg > 2:275134/1‑150 (MQ=255) tggcctgCGCTGCGCCAGCGACCCACGCATCCACTGCGCGGCGGGCGGGCGTGAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGaa > 2:167426/1‑150 (MQ=255) gcctgCGCTGCGCCAGCGACCCACGCATCCACTGCGCGGCGGGCGGGCGTGAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAAcc > 1:208260/1‑150 (MQ=255) tgcggtccacggtagcactcacccggccatggctgtcggcacgcttgagggtgtcgcgcgccggcaccgccagcaggccacccaccgggtcgtccgccagctccgacaacagcttgtccaggtcGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAg > 2:230510‑M1/125‑150 (MQ=255) gcCAGCGACCCACTCATCCACTGCGCGGCGGGCGGGCGTGAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGc < 2:51810/150‑1 (MQ=255) cgTGAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGgacgac > 2:319139/1‑150 (MQ=255) gAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCg < 1:319139/150‑1 (MQ=255) gACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGc < 1:98587/150‑1 (MQ=255) tCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCctg > 1:359093/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGCGGTg > 2:55471/1‑150 (MQ=255) gccagcaggccacccaccgggtcgtccgccagctccgacaacagcttgtccaggtcGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCt > 2:191753‑M1/57‑88 (MQ=255) gccagcaggccacccaccgggtcgtccgccagctccgacaacagcttgtccaggtcGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCt < 1:191753‑M1/32‑1 (MQ=255) ctgcATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGCGGTGCCGGCGCGCGACAcc < 2:335096/150‑1 (MQ=255) cATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGCGGTGCCGGCGCGCGACACCCTc < 1:167426/150‑1 (MQ=255) cACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGCGGTGCCGGCGCGCGACACCCTCAAGCGTGCCGACAGCCATGGCCGGGTGAGTGCTACCGTg < 1:275134/150‑1 (MQ=255) | ACCCGTACTGGCCTGGCCTGCGCTGCGCCAGCGACCCACGCATCCACTGCGCGGCGGGCGGGCGTGAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGCGGTGCCGGCGCGCGACACCCTCAAGCGTGCCGACAGCCATGGCCGGGTGAGTGCTACCGTG > NC_002947/1810912‑1811204 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |