| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_002947 | 3,827,189 | Δ438 bp | coding (385‑822/1020 nt) | ptxS ← | 2‑ketogluconate utilization repressor |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_002947 | 3827189 | 3827626 | 438 | 22 [0] | [0] 23 | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3827188 | 0 (0.000) | 20 (1.290) | 14/266 | 0.2 | 100% | coding (823/1020 nt) | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor |
| ? | NC_002947 | 3827627 = | 0 (0.000) | coding (384/1020 nt) | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor | |||||
ATGCGCCGGGCTGCGCCGCTGTCGCCGCGCAAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCGACATCGGCAACCAGGTTGCGCCCGGCCTCGAGCAGCGCCCGGGTGACCGCCAAGGTGGCAACGCCGTTGAAGGTGAAGATGGCTTGCGGACCATGACCACTGTGGGCAAGAAACGAAGCCAGTTGGCCCTGCAGCCCGGCGCCG > NC_002947/3827040‑3827333 | aTGCGCCGGGCTGCGCCGCTGTCGCCGCGCAAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCt > 2:237699‑M1/1‑149 (MQ=255) tGCGCCGCTGTCGCCGCGCAAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgta > 2:125069‑M1/1‑138 (MQ=255) tGCGCCGCTGTCGCCGCGCAAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgta > 2:125082‑M1/1‑138 (MQ=255) gcgcAAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccac > 1:211551‑M1/1‑123 (MQ=255) aaGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccagg < 2:353488‑M1/150‑32 (MQ=255) aaGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccagg < 2:160792‑M1/150‑32 (MQ=255) cACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggtt > 1:122469‑M1/1‑90 (MQ=255) cACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcatcgcggtt < 1:285844‑M1/150‑61 (MQ=255) gggcCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgt < 1:237699‑M1/150‑84 (MQ=255) gcCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgtaa < 1:263505‑M1/150‑86 (MQ=255) gcCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgtaa < 1:57531‑M1/150‑86 (MQ=255) cGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgtaaccatgct > 2:220774‑M1/1‑58 (MQ=255) ccTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgtaaccatgctgacggcag > 1:185907‑M1/1‑50 (MQ=255) cTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgtaaccatgctgacggcagg > 2:134631‑M1/1‑49 (MQ=255) cTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgtaaccatgctgacggcagg > 2:134624‑M1/1‑49 (MQ=255) acaacgtcgagggCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgtaaccatgc < 1:79510‑M1/110‑92 (MQ=255) acaacgtcgagggCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgtaaccatgc > 2:79510‑M1/5‑23 (MQ=255) gtcgAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgtaaccatgctgacggcaggcggtttccacgccgtgcatcacggccactga > 2:71207‑M1/1‑18 (MQ=255) gtcgAGGGCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgtaaccatgctgacggcaggcggtttccacgccgtgcatcacggccactga > 2:71213‑M1/1‑18 (MQ=255) gggCGATCAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgtaaccatgctgacggcaggcggtttccacgccgtgcatcacggccactgaatagg < 1:25484‑M1/150‑138 (MQ=255) cAGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgtaaccatgctgacggcaggcggtttccacgccgtgcatcacggccactgaataggggttgag < 2:211551‑M1/150‑145 (MQ=255) aGCCCttcgacgttgtagctctgcagggccaccaggtggtgacgctcctgctcgtcgtcgcggttggtgttgcacaccaccaggctgtaaccatgctgacggcaggcggtttccacgccgtgcatcacggccactgaataggggttgagg < 1:98075‑M1/150‑146 (MQ=255) | ATGCGCCGGGCTGCGCCGCTGTCGCCGCGCAAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCGACATCGGCAACCAGGTTGCGCCCGGCCTCGAGCAGCGCCCGGGTGACCGCCAAGGTGGCAACGCCGTTGAAGGTGAAGATGGCTTGCGGACCATGACCACTGTGGGCAAGAAACGAAGCCAGTTGGCCCTGCAGCCCGGCGCCG > NC_002947/3827040‑3827333 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |