New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 353381 | 15 (0.900) | 4 (0.250) | 4/278 | 1.6 | 21.3% | coding (952/1179 nt) | cbcV | choline/betaine/carnitine ABC transporter ATP binding protein |
? | NC_002947 | = 353398 | 15 (0.930) | coding (935/1179 nt) | cbcV | choline/betaine/carnitine ABC transporter ATP binding protein |
ATCTGCAGTGCCTCACGCATGCCGATGTCGGCGTGCACCACGGTCGGCCTGCGCTCCAGCAGCTCCACATCTTGCCCCGGTGCCCATTTCTGCATGTCCAGCCCGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCTTGCAGTTGTCCAGGCTGCGCATCAGGCTGCGCCCGCACAGCACGTTCAGCGGGTTGGTATGGGCGACGAAGGTGCGCACG > NC_002947/353263‑353544 | aTCTGCAGTGCCTCACGCATGCCGATGTCGGCGTGCACCACGGTCGGCCTGCGCTCCAGCAGCTCCACATCTTGCCCCGGTGCCCATTTCTGCATGTCCAGCCCGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAgg < 1:333574/150‑1 (MQ=255) ccGATGTCGGCGTGCACCACGGTCGGCCTGCGCTCCAGCAGCTCCACATCTTGCCCCGGTGCCCATTTCTGCATGTCCAGCCCGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCt < 2:87098/150‑1 (MQ=255) tCCAGCAGCTCCACATCTTGCCCCGGTGCCCATTTCTGCATGTCCAGCCCGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCTTg > 1:309666/1‑150 (MQ=255) cacaTCTTGCCCCGGTGCCCATTTCTGCATGTCCAGCCCGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCt < 1:333869/137‑1 (MQ=255) cacaTCTTGCCCCGGTGCCCATTTCTGCATGTCCAGCCCGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCt < 1:58438/137‑1 (MQ=255) cacaTCTTGCCCCGGTGCCCATTTCTGCATGTCCAGCCCGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCt > 2:58438/1‑137 (MQ=255) cacaTCTTGCCCCGGTGCCCATTTCTGCATGTCCAGCCCGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCt > 2:333869/1‑137 (MQ=255) cTTGCCCCGGTGCCCATTTCTGCATGTCCAGCCCGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCTTGCAGTTGTCCAGGCTgc < 1:63635/150‑1 (MQ=255) tCCAGCCCGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCTTGCAGTTGTCCAGGCTGCGCATCAGGCTGCGCCCGCACAGCACg > 2:75480/1‑150 (MQ=255) cAGCCCGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCTTGCAGTTGTCCAGGCTGCGCATCAGGCTGCGCCCGCACAGCACGtt > 2:84976/1‑150 (MQ=255) cAGCCCGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCTTGCAGTTGTCCAGGCTGCGCATCAGGCTGCGCCCGCACAGCACGtt > 2:44364/1‑150 (MQ=255) ccGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGACTCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCTTGCAGTTGTCCAGGCTGCGCATCAGGCTGCGCCCGCACAGCACGTTCAGc < 2:286489/150‑1 (MQ=255) tGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCcgccttcgccaaggtcagaacgggctggacatgcagaaatgggcaccggggcaagatgtggagctgctggagcgcaggccgaccgtggtgcacgccgacatcggcatgcgtgaggcactgca < 2:287387‑M2/150‑123 (MQ=255) gCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCcgccttcgccaaggccagaacgggctggacatgcagaaatgggcaccggggcaagatgtggagctgctggagcgcaggccgaccgtggtgcacgccgacatcggcatgcgtgaggcactgcaga < 2:254884‑M2/150‑125 (MQ=255) gCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCTTGCAGTTGTCCAGGCTGCGCATCAGGCTGCGCCCGCACAGCACGTTCAGCGGGTTGGt < 1:75480/150‑1 (MQ=255) ttGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCcgccaaggccagaacgggctggacatgcagaaatgggcaccggggcaagatgtggagctgctgga > 1:98688‑M2/1‑23 (MQ=255) ttGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCcgccaaggccagaacgggctggacatgcagaaatgggcaccggggcaagatgtggagctgctgga < 2:98688‑M2/88‑66 (MQ=255) gCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCTTGCAGTTGTCCAGGCTGCGCATCAGGCTGCGCCCGCACAGCACGTTCAGCGGGTTGGTATGGGcgacg > 1:344206/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCTTGCAGTTGTCCAGGCTGCGCATCAGGCTGCGCCCGCACAGCACGTTCAGCGGGTTGGTATGGGCGACGAAGGTGCGCACg > 1:136489/1‑150 (MQ=255) | ATCTGCAGTGCCTCACGCATGCCGATGTCGGCGTGCACCACGGTCGGCCTGCGCTCCAGCAGCTCCACATCTTGCCCCGGTGCCCATTTCTGCATGTCCAGCCCGTTCTGGCCTTGGCGTGCACGCTTGAGCGCGCCGCCTTCGCCAAGGTCCAGCCACGAATCGATACCTGGGTCCAGGCACACCGAGCCATTGACCCGCTTGCAGTTGTCCAGGCTGCGCATCAGGCTGCGCCCGCACAGCACGTTCAGCGGGTTGGTATGGGCGACGAAGGTGCGCACG > NC_002947/353263‑353544 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |