| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,346,459 | Δ1 bp | 13.7% | intergenic (+64/‑114) | pgi‑II → / → acsA‑II | glucose 6‑phosphate isomerase/acetyl‑CoA synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,346,459 | 0 | G | . | 13.7% | 533.5 / 89.0 | 183 | intergenic (+64/‑114) | pgi‑II/acsA‑II | glucose 6‑phosphate isomerase/acetyl‑CoA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (95/60); new base . (19/6); total (114/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.85e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.81e-01 | |||||||||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
TTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCC > NC_002947/5346312‑5346608 | ttGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAg > 2:1335395/1‑150 (MQ=255) ggTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGGT‑ACCGCGGAGGAGCg > 2:6479559/1‑150 (MQ=255) gTCGGTAGCCTTGAATACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CACG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCTTAGGAGCgt < 1:1998867/150‑2 (MQ=255) gTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCACGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCgg < 1:8278745/150‑1 (MQ=255) gTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCgg < 1:3210408/150‑1 (MQ=255) gTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCgg < 2:5642077/150‑1 (MQ=255) gTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCgg < 1:4388715/150‑1 (MQ=255) gTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCgg < 2:1151135/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTAc < 2:6999016/150‑1 (MQ=21) gCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTAcc < 1:3075464/150‑1 (MQ=255) cTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCcg < 1:3579221/150‑1 (MQ=21) cTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCcg < 1:2161863/150‑1 (MQ=21) tGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGATTACCcgc < 2:87338/150‑1 (MQ=255) tGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCCGGTAAA‑ACCC‑‑CCAACCAGGCAACCCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTAccccc > 1:8942284/1‑148 (MQ=38) gAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTAGCGGGTAAA‑ACCC‑‑CCAACCACGCCACCCCTT‑ACCACGGGGGTGCGGGGTTAACCCCGa > 1:4786128/1‑150 (MQ=25) aaGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 1:7027948/150‑1 (MQ=255) aaGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:2101624/150‑1 (MQ=255) aaGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTAAACCcgctcc < 2:7297304/150‑4 (MQ=255) gACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 2:1918565/150‑1 (MQ=255) gACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 1:7571697/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACGACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAgg < 1:2426356/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCggg > 1:4895254/1‑133 (MQ=255) gcCGATGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGAAACGCTTT‑ACCCCGTAGGTGCGGGTTTACCCGCTAAGAggccgg < 2:3940734/150‑1 (MQ=39) gcCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCGCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCGACCAGGCACCGCGTT‑ACCGCGTTGGAGCGGGTTTAGCCGCGGCGAggccgg > 2:4953415/1‑150 (MQ=255) cGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCGTCGCGGGGAAA‑CCCG‑‑CCTACCCGGCCACGCGTT‑ACCGCGTAGGGGCGGGGTTTCCCGCCGAGAggccggcc > 2:4153048/1‑150 (MQ=255) aGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCACCGCGTT‑ACCTGGTAGGAGCGGGTGTTGCCGCGAAGCGGCCGGccccg > 2:5641661/1‑148 (MQ=39) gtaccaccaACGGCGTTATCAACTAGTTCCGGGGCCGTCACCGGGTTTGATCCGAGTTTGTGCCGGCCTCTTCGGGGTTAAA‑CCCC‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGGGGTTTTACCCGCTAAGAGGCCGGCCCAGGTTGa < 2:2958480/147‑1 (MQ=255) ttCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCC‑‑CCTAACAGGCAACGCGGT‑TCCTCGGTGGGGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGGTGaa > 1:9077370/1‑150 (MQ=38) ccAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCgg > 2:896636/1‑112 (MQ=255) ccAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCGTCGCGGGTAAA‑ACCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGGT‑AACACGGTGGGGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGGTGTACACCGc > 2:3367868/1‑150 (MQ=255) aGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTTGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTcc < 2:8313421/150‑1 (MQ=255) gCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑ACCC‑‑CCAAACAGGCAAAGCCTT‑AACACGTAGGAGCCGGTTTACCCCCGAAGAGGCCGGCCCAGGGTGTAAACCGCACCCa > 2:354088/1‑150 (MQ=255) gCCTGAACAACTAGTCCCGGGGCCGTCACCGGGGTGGCTCCGTGCTTGGGCCGGCCTCGGCGGGGGTAAC‑CCCG‑‑CCTCCCAGCAAACGGGTT‑CCCTGGTCGGCGGGTTTTTACCGGCTACGCGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCa < 2:6995495/150‑1 (MQ=255) taaaaaCTCCTTCCGCGCCCGACCCCGGGTTTGTCCCTTGCTTGTCCGGCCCTCTGCGCGGTAAAA‑CCCC‑‑CCACCCCGCAAACGGTTT‑ACCCCTTTGGCGGGGTTTCACCCGCCAAGCGCCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTa < 2:5354327/146‑1 (MQ=255) aaaaCTACTCCGGGGGCGGGCACGGGGGTTTAGCCGCGCTGGTGCGGCCCTCTCCGC‑GGTTAA‑CCCC‑‑CCCACCCCGCAACGGGTTAACCTCTTTGGTGGGGTTTTACCCGCTACGCGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTaca < 2:7823614/148‑1 (MQ=255) ctactTCGGCGGCCGTCACGGCGTTTGATCCTAGCTTGTGCCGGCATCTTGGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCCGGCAACGCGTT‑ACCTCTTTGGTGCGTTTTTACCCGCGAAGTGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGt < 2:2905382/150‑1 (MQ=255) ctactTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTAGCGGGTAAA‑ACCG‑‑CCAAACAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTATGTGCGGGTTTAAACGCGTAGTTGGCGGCCCAGGTTTAAAAACGCACCCAGCTACACTGt > 2:1654517/1‑150 (MQ=255) tactTCGGGGGCGGTCACGGGGGTTTATCGTTGCTTGTGCGGGCCTCTTCGGGGTTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGAAACGCGTT‑ACCTCGTTGGTGGGGTTTTACCGGCGATGTGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTc < 2:2018420/150‑1 (MQ=255) gcggcgGCCGTCACCGGGTTTGATCCTTGTTTGTGCCGGCCTGTTCG‑GGGTAAACCCCG‑‑CCAACCAGGAAACGGTTT‑ACCTCTTAGGCGGGGTTTTACCCGCGAATTGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTAt < 2:7062988/147‑1 (MQ=255) cccGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTAt < 2:9067523/149‑1 (MQ=255) ccGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTACGCGGTTAAA‑CCCG‑‑CCTCCCCGGCAACGCGTT‑ACCTGGTTGGCGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATc < 2:2916886/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCGTCGCGGGGCAA‑CCCG‑‑CCGCCCCCGCACCCCGGT‑ACCGCGGAGGCGCGGGGTTTCCCGCGCAGCGGCCGGCCCCGGGTGGACCCCGCTCCCCGCGACCCGGTCGTagag > 2:7976670/1‑147 (MQ=255) gggCCGTCACCGCGGTTTATCCGTGCTTGTGCGGGCCTCTTGGGGGGTAAA‑CCGG‑‑CCTACCCGGCAACGCGTT‑ACGTGTTTGGAGCGGGTTTACCCGCGATGTGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGaa < 2:1398947/149‑1 (MQ=255) cgGCCGTCACCGCGGTTGATCCGCGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGaa < 2:6002238/150‑1 (MQ=255) tCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGGTAA‑CCCC‑‑CCGACCAGGCAACCCCGT‑ACCGAGTAGGGGCGGGGTTAGCCCCGCAGCGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCACCGACACTGTCTTATCGAAAAGCCg > 2:1049996/1‑150 (MQ=255) ccGGGGTTTATCCGCGCTTGTGCCGGCCACTTGGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTg < 2:5945185/150‑1 (MQ=38) gcGAGCTTGTGCCGGCCTTTTGGGGGTTAAA‑GCCG‑‑GGTACCCGGCATGGGTTT‑TCGTGGTTGGTGGGGTTTTACGGGGGATGTGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGATTAGCCGTTGCAGTGCATCGc < 2:4352314/149‑1 (MQ=255) ctaGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTCGGCGCGGGTTTACCCGCGATGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGcc < 2:8896146/148‑1 (MQ=255) cGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTCCCAGGCACCGCGTT‑ACCTCGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGcc < 2:6848568/150‑1 (MQ=255) tgCCGCCCAATTCGCGTTTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGCAAACGCTTA‑ACCTCCTAGTAGCGGTTTTACCCGCTAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACaa < 2:2841934/150‑1 (MQ=255) ggcgggCGTCTTCGCGGGTAAC‑CCCG‑‑CCTACCCGGAAACGGGTC‑ACCTCGTCGGTGGGGTTTTACCGGCGACGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACaa < 2:8450775/146‑1 (MQ=255) ggCCGGCCCCGGCGGGGGTAAC‑CCCG‑‑CCTCCCCGCCACCGGTTA‑ACCTCGTTGGTGGGGTTTTACCCGCTAAGTGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACaa < 1:3004137/149‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAC‑CCCG‑‑CCTACCCGGAAACGGTTT‑ACCTCGTAGTTGGGGGTTTACCCGCTATGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCa < 2:6442008/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAC‑CCGG‑‑CCTACCCGGCAAGGCGTT‑ACCTCGTCGGTGGGGTTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAgg < 2:626341/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGTTGAACACCGCACCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAgg > 2:864308/1‑150 (MQ=18) ctctTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAAAGCGTT‑AACTCGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATAGAATATCCGTTTCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAgg > 1:6512030/1‑150 (MQ=39) tctTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCTGGCAACGCGTT‑ACCTCGTTGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGa < 2:2407737/150‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGa > 2:2521544/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGacc > 1:8221165/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCCCCCCTTACAAGAGCAGGacc > 1:1833297/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGaccacc > 2:7663086/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGaccacc > 2:7662497/1‑150 (MQ=255) cgGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCAccc > 2:656104/1‑150 (MQ=255) gggTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCg > 2:6909262/1‑150 (MQ=255) gggTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCg > 2:3171784/1‑150 (MQ=255) tAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCa > 1:2803396/1‑150 (MQ=255) acccgctccTACGAGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGt > 2:5151721/8‑150 (MQ=25) cccG‑‑CCTCCCCGCCACCGCGAC‑ACCCCGTAGGTGCGGGTTTACCCGCCAAGCGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGtt < 1:6075920/150‑1 (MQ=255) cccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGtt > 1:3790164/1‑150 (MQ=255) ccgctccTACGAGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAGGGGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGt > 1:1986146/6‑150 (MQ=38) ccG‑‑CCTCCCCGTCAACGGGTT‑CCCTCGTAGGAGGGGTTTTACCCGCGACGAGCCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc < 2:2614315/150‑1 (MQ=255) ccG‑‑CCTACCCGCCACGGGGTC‑ACCTGGTTGGTGGGGTTTTCCCCGCGATGCGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc < 2:3055696/150‑1 (MQ=255) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 2:2312216/1‑150 (MQ=255) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 2:770208/1‑150 (MQ=255) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 2:2786340/1‑150 (MQ=255) cG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCg > 1:7228926/1‑150 (MQ=255) cG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCg > 2:6700983/1‑150 (MQ=255) g‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCAGGTGCGgta > 2:7348702/1‑150 (MQ=38) g‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCCGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGa > 2:7079748/1‑150 (MQ=255) g‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGa > 2:5877981/1‑150 (MQ=255) tACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGatat > 1:8142246/1‑150 (MQ=255) aCCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGcc < 1:5020408/97‑1 (MQ=255) cgaGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGc > 1:5995614/3‑150 (MQ=38) ccAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATcc > 1:417350/1‑150 (MQ=255) gaGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCa > 2:6599877/2‑150 (MQ=38) cAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACAACGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCg > 1:3304204/1‑150 (MQ=255) aGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGc > 1:106118/1‑150 (MQ=255) ggCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCa > 1:6902063/1‑150 (MQ=255) aaCGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAAt > 2:6317933/1‑150 (MQ=255) aaCGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAAt > 2:1717717/1‑150 (MQ=255) aaCGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAAt > 1:6762040/1‑150 (MQ=255) gcgTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGACCATCGCCCCTTACAAGAGCACGACCACCCGCCAACTTCGAAATCCGCAAATAcc > 2:8083652/1‑150 (MQ=39) tt‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATAccccc > 2:5081219/1‑150 (MQ=255) cTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGc > 2:4268943/1‑150 (MQ=255) tCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCGGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGCTATCCGCACATACCCCCAGGcc > 2:5551339/1‑150 (MQ=255) tCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGcc > 1:4961512/1‑150 (MQ=255) tCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGcc > 2:4755076/1‑150 (MQ=255) tCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGcc > 1:7788625/1‑150 (MQ=255) tCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGcc > 1:1713693/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCTGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCCTGGTCGATCTCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGcc > 2:6809476/1‑150 (MQ=255) | TTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCC > NC_002947/5346312‑5346608 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |