| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,670,019:1 | +T | 12.9% | intergenic (+72/‑95) | prpF → / → prpD | aconitate isomerase/2‑methylcitrate dehydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,670,019 | 1 | . | T | 12.9% | 534.9 / 79.5 | 139 | intergenic (+72/‑95) | prpF/prpD | aconitate isomerase/2‑methylcitrate dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (41/80); new base T (7/11); total (48/91) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.00e-01 | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CCAAGGCAATCATGAGCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGATTACGACCGGGTGCTACA > NC_002947/2669874‑2670166 | ccAAGGCAATCATGAGCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATca > 1:2122133/1‑150 (MQ=255) cAAGGCAATCATGAGCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCCCAGGTA‑ATcac > 1:3558987/1‑150 (MQ=255) aaGGCAATCATGAGCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATcaca < 2:2235717/150‑1 (MQ=255) aaGGCAATCATGAGCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATcaca < 2:6857755/150‑1 (MQ=255) aaGGCAATCATGAGCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATcaca > 1:107173/1‑150 (MQ=255) ggCAATCATGAGCCGTATTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTTAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAATAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGATCCCACAGGTA‑ATCACAgg < 2:2412211/150‑1 (MQ=255) ggCAATCATGAGCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGGATATCACAg > 1:6494570/1‑150 (MQ=255) aTCATGAGCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGttt < 1:7988753/150‑1 (MQ=255) aTCATGAGCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGttt < 2:4208774/150‑1 (MQ=255) aTGAGCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCTCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACGGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCTCTTTGCGGCCCTTCTCGGGCTTGACCGCTCCCTCAGGTT‑ATCACAGGGTTT‑Gaa < 2:4560140/150‑1 (MQ=255) aTGAGCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑Gaa < 1:5139203/150‑1 (MQ=255) gCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCt < 2:7854433/150‑1 (MQ=255) gCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCt < 1:7774743/150‑1 (MQ=255) ccGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCtg < 1:6748941/150‑1 (MQ=255) ccGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCtg < 1:8812577/150‑1 (MQ=255) ccGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCtg < 1:6613259/150‑1 (MQ=255) cGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCtgt < 2:5369033/150‑1 (MQ=255) cGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCtgt < 2:6992314/150‑1 (MQ=255) cGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCtgt < 1:4609112/150‑1 (MQ=255) gTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCtgtg < 1:5623093/150‑1 (MQ=255) gTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCtgtg < 1:5308489/150‑1 (MQ=255) gTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCtgtg < 1:1150761/150‑1 (MQ=255) gTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCtgtg < 1:735895/150‑1 (MQ=255) aGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGat < 1:4365499/150‑1 (MQ=255) aGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGat < 1:3690032/150‑1 (MQ=255) aGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGat < 1:1575272/150‑1 (MQ=255) cTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATcc < 2:107173/150‑1 (MQ=255) cTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATcc < 2:2311843/150‑1 (MQ=255) tCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACCGGGTGT‑GAATGCTGTGATATccc > 2:8855358/1‑150 (MQ=255) cgcgTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCt < 2:1684286/150‑1 (MQ=255) cgcgTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCt < 2:5767420/150‑1 (MQ=255) cgcgTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCt < 2:874999/150‑1 (MQ=255) gcgTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCtg < 2:3782190/150‑1 (MQ=255) gcgTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCtg < 2:4752530/150‑1 (MQ=255) cgTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCtgt < 1:3320515/150‑1 (MQ=255) cgTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCtgt < 1:3445542/150‑1 (MQ=255) cgTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCtgt < 2:5755069/150‑1 (MQ=255) cgTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCtgt < 2:4901230/150‑1 (MQ=255) cgTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCtgt < 1:3842530/150‑1 (MQ=255) cgTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCtgt < 2:625651/150‑1 (MQ=255) gTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCtgtg < 1:8719157/150‑1 (MQ=255) gTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCtgtg < 1:7331163/150‑1 (MQ=255) gCTGATGGAGGGCTGGGGTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGGA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGGGATATACCTGgggg > 1:2973270/1‑150 (MQ=39) cTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGGATATCACAGCATTC‑AAACCCTGTGAT‑TACCTGTGGGa < 2:1207065/150‑1 (MQ=18) cTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGGATATCACAGCATTC‑AAACCCTGTGAT‑TACCTGTGGGa < 2:1841683/150‑1 (MQ=18) gATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCCGGGA‑AACACACGGGTT‑GAAAGCAGAGATATACCAGTGGGAGc > 1:5138150/1‑150 (MQ=255) gATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCtg < 2:3145280/132‑1 (MQ=255) gATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCtg > 1:3145280/1‑132 (MQ=255) gATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGc < 2:8342836/150‑1 (MQ=255) gATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGGATATCACAGCATTC‑AAACCCTGTGAT‑TACCTGTGGGAGc < 2:5900703/150‑1 (MQ=18) tGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGCTAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGGATATCACAGCATTC‑AAACCCTGTGAT‑TACCTGTGGGAGCgg < 2:1310739/150‑1 (MQ=18) tGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCgg < 1:8142914/150‑1 (MQ=255) tGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGGATATCACAGCATTC‑AAACCCTGTGAT‑TACCTGTGGGAGCgg < 2:5298316/150‑1 (MQ=18) ggAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCggg < 2:907383/150‑1 (MQ=255) gAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCAGGGATATCACAGCATTC‑AAACCCTGTGAT‑TACCTGTGGGAGCGGGc < 2:6814019/150‑1 (MQ=18) gggCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCaa < 2:2578738/150‑1 (MQ=255) gggCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCaa < 2:2913745/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAg < 1:4693896/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCCCACGTA‑AACACACGGTTTGGAATG‑TGGGTTATCACGGGGGGAGCGGGCacg > 1:7034878/1‑148 (MQ=255) tGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGGTATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGccc > 2:1273294/1‑150 (MQ=255) tGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGccc < 2:4287624/150‑1 (MQ=255) gcgTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGGGGGCGCGGGCAAGCCCGCGAAgg > 2:8451293/1‑150 (MQ=255) tGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGcac > 2:5919184/1‑150 (MQ=255) ggCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACCGGGTTT‑GAATGCTGTTATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGcaca < 2:3749592/150‑1 (MQ=255) gctAGCTTCTACAGCACAAGTGGCGCTCGGCTTCCAGAGGGGCCGCTTTGCTCCCATTGGCGGGATTCACCGCTCCGACAGTTA‑ACCCATGTGTTT‑GATTGCTGTTATATACCTGGGGTAGCGGTCATGCCCGCGAAGGGCTGCAcagca < 2:7406123/148‑1 (MQ=255) aTAGCTTCTAACGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCGGCTTGGCGGCCCTTCGCGGGCTGGCCCGCTCCCCCAGGTA‑ATCACTGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCAcagcag < 2:6557346/150‑1 (MQ=38) tCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCgg > 2:4814877/1‑150 (MQ=255) gccgaGCGCCAGTGGTGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCACCCACAGGTA‑ATAACAGGGTTT‑GAATTCTGTGATATCCCAGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGc > 2:190250/5‑150 (MQ=37) caaaaGCACCACTGGCGCTCGGCTACAAGAGGGGCCGCTTGGCGGCCCTTCGGGGGCTTGCCCGCTCCCACAGTTA‑ACCACAGGTTTT‑GAATGCTGGGATAACCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGc < 2:5500684/148‑1 (MQ=37) aaaGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCCTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACCGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTTATACCCCGGTGGGCGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGcccttcgcg < 2:2747607/150‑7 (MQ=38) aaGCACCAGTGGCGCTCGGCTACAGGAGGGGCCGCTTGGCGGCCCTGCGGGGGGTTGCCCGCTCCCACTGGTA‑ATCACTGGGTTG‑GAAGGCTGTTATATCCGTGTGGGTGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCTGTGCAGcccttcgcgg < 2:7858575/150‑8 (MQ=255) aaGCACCACGGGCGCTCGGCTTCAAGTGGGGCCGCTTGGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACCGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCTGCTGTGCAGcccttcgcgg < 2:7858636/150‑8 (MQ=37) aGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACCGGGTTT‑GAATGCGGTGATATCCCGGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCaaat > 2:1540986/1‑148 (MQ=255) cacTGGCGCTCGGATTCATGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCACCCACCGTTA‑ATCACAGGTTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGaa < 2:2567575/150‑1 (MQ=37) tGGCTCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAggg < 2:5143410/150‑1 (MQ=255) tgggCTTCATGTGGGGCGGCTTTGCGGCCCTTGGCGGGGTTGCCGGCTCCCACTGGTA‑ATCACTGGTTTT‑GAATGCTGTGATTGCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTgg < 1:9024983/148‑1 (MQ=25) tCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTgg > 2:7459876/1‑150 (MQ=255) tttagagGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCCATTCTGAAGGGAGCTGGATATGa > 2:3641757/4‑150 (MQ=255) atgcggggCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCCCCCACAGTAA‑ATAACCGGTTTT‑GATTGCTGTCATATCCCGGGGGGCGGGGGCACGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAgc < 1:4466228/146‑1 (MQ=255) aatagGGGCAGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑AAAAAAGGGTTA‑GAATGCGGTGATATCCCTGTGGGACCCGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAgc > 2:5175912/4‑150 (MQ=37) agagGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTTCCCCCACCCACAGGTA‑ATAACAGGGTTT‑GGATGCTGTGATAAACCTGTGGGAGCGGGCCAGCCCGCGAAGGGCTGCACCGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGGgcg > 2:3185917/1‑150 (MQ=37) cGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTTCCCGCACCCAAAGGGA‑ATAACCGGGTTT‑TCATGCGGTGATAAACCTGGGGGTGCCGGCAAACCCGCGAACGGCCGCAAAGAAGCCACCGCCAATGTGTAGGGAGCTGGATATGCTCGcccaactg > 2:4058435/1‑144 (MQ=255) cTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGAt > 2:9026722/1‑150 (MQ=255) gggCTTGCCCGCTCCCACAGGGATATCACAGCATTC‑AAACCCTGTGAT‑TACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCg > 1:2800268/1‑150 (MQ=17) gCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGa > 1:817257/1‑150 (MQ=255) gCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGa > 2:705014/1‑150 (MQ=255) tGCCCGCTCCCACAGGTA‑ACCACCGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGGGGGCGGGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGATTa < 1:2210728/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGcccc < 2:4525817/86‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGcccc > 1:4525817/1‑86 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGGATATCACAGCATTC‑AAACCCTGTGAT‑TACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGATTACGa > 2:6774989/1‑150 (MQ=18) cagCTCCCACAGGGATATCACAGCATTC‑AAACCCTGTGAT‑TAACTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCACCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGACAACGAAGACCTCAACGATCGCACGGATTACGa > 2:2740586/3‑150 (MQ=17) gCTCCCACAGGGATATCACAGCATTC‑AAACCCTGTGAT‑TACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGATTACGAcc > 1:1294990/1‑150 (MQ=18) tCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGATTACGACCgg > 2:1616541/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTATGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGATTACGACCgg > 1:3083138/1‑150 (MQ=255) acccACCGTTA‑ATCACTGGTTTT‑GATTGGTTTTTTACCCCTGTGGTTGGGGGAAACCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGATTACGACCgg < 1:8773172/149‑1 (MQ=255) ccACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGATTACGACCGGGt > 2:6670781/1‑150 (MQ=255) acaGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGccc > 1:2697831/1‑133 (MQ=255) acaGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGATTACGACCGGGTGc > 2:6427687/1‑150 (MQ=255) cggTA‑CTCACAGGGTTT‑GAAGGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGATTACGACCGGGTGCTa < 2:8903177/149‑1 (MQ=255) gTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGATTACGACCGGGTGCTACa > 1:5521444/1‑150 (MQ=255) | CCAAGGCAATCATGAGCCGTAGTGCTCGCGTGCTGATGGAGGGCTGGGTTCGCGTGCCTGGCGATAGCTTCTAAAGCACCACTGGCGCTCGGCTTCAAGAGGGGCCGCTTTGCGGCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTA‑ATCACAGGGTTT‑GAATGCTGTGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCGGCAATTCTGAAGGGAGCTGGATATGAGCGCCAACGTAGACCTCAACGATCGCCCGGATTACGACCGGGTGCTACA > NC_002947/2669874‑2670166 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |