| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 3,823,892:1 | +G | 33.2% | coding (1257/1293 nt) | kguT ← | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,823,892 | 1 | . | G | 33.2% | 667.8 / inf | 476 | coding (1257/1293 nt) | kguT | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (157/161); new base G (94/64); total (251/225) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.09e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 490 total aligned reads displayed.
CATCGGGCTGGGTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCA > NC_002947/3823743‑3824040 | cATCGGGCTGGGTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCttt > 2:5791248/1‑150 (MQ=255) aTCGGGCTGGGTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑g > 2:9157855/1‑150 (MQ=255) tCGGGCTGGGTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑gg > 1:2294183/1‑149 (MQ=255) cGGGCTGGGTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑Gcc < 1:3605010/150‑1 (MQ=255) tGGGTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCGTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGcc > 2:2078008/1‑150 (MQ=255) gggTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCa < 2:3348559/150‑1 (MQ=255) tggtgTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTCCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCagag > 2:7926064/1‑150 (MQ=255) gtgtCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAgg > 2:8770098/1‑150 (MQ=255) gtgtCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGt < 1:5873725/150‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTg > 1:1746601/1‑150 (MQ=255) tCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTg < 1:8820536/150‑1 (MQ=255) aCCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCAT‑GCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGaa < 2:7497215/150‑1 (MQ=255) aCCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCGAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGa > 1:4195093/1‑150 (MQ=255) cccAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGaa < 2:320619/150‑1 (MQ=255) aGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTa > 2:6605036/1‑150 (MQ=255) aGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTa < 1:6355541/150‑1 (MQ=255) gTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTAtt < 2:5621402/150‑1 (MQ=255) tCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGGCTGGGACGTAtt > 2:6317101/1‑150 (MQ=255) cACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGa < 1:3691363/150‑1 (MQ=255) aCCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGa < 2:2161564/150‑1 (MQ=255) aCCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGa > 1:5515756/1‑150 (MQ=255) aCCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGa < 1:6825849/150‑1 (MQ=255) tCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAgcg > 2:1806001/1‑150 (MQ=255) tCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAgcgc > 1:3832891/1‑150 (MQ=255) gACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTATTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTC‑TTGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGc < 1:8361524/150‑1 (MQ=255) aCGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGc < 1:491428/150‑1 (MQ=255) cgcgATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGc > 1:1239005/1‑150 (MQ=255) cgcgATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCg < 1:4521673/150‑1 (MQ=255) cgATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGt < 2:6059494/150‑1 (MQ=255) gATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGt < 1:7927942/150‑1 (MQ=255) cTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAg < 1:352266/150‑1 (MQ=255) cTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAg < 1:654335/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAgc > 2:372677/1‑150 (MQ=255) 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cTAATGGTTCTTGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAg < 1:6086020/150‑1 (MQ=255) cTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGa > 1:2710695/1‑150 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAg > 1:5121602/1‑150 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAg > 2:2601936/1‑150 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAg > 2:6473111/1‑150 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAg > 1:1949198/1‑150 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAgg > 1:4883996/1‑150 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAgg > 1:2641396/1‑150 (MQ=255) aaTGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGt > 1:1599105/1‑150 (MQ=255) tGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAg < 1:603778/150‑1 (MQ=255) 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cAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTGGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGcc < 2:2294294/150‑1 (MQ=255) cAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGcc > 1:4844964/1‑150 (MQ=255) aaGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCa > 2:3103421/2‑150 (MQ=255) aGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCAc < 1:5697968/150‑1 (MQ=255) aCGCGAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACg > 2:8992751/1‑150 (MQ=255) gcgAGCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAg > 1:7022116/1‑150 (MQ=255) gCTATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGATGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgccgc > 2:1114275/1‑150 (MQ=255) tATCGCGCTTTGGCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCa > 1:7630520/1‑150 (MQ=255) tATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGTGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCaa > 1:2081906/1‑150 (MQ=255) tCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAAc < 1:6605036/150‑1 (MQ=255) ttt‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGccc > 2:2962334/1‑150 (MQ=255) | CATCGGGCTGGGTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTT‑GCCCGGCCAGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCA > NC_002947/3823743‑3824040 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |