| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,318,590:1 | +T | 5.4% | coding (480/1017 nt) | ilvC ← | ketol‑acid reductoisomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,318,590 | 1 | . | T | 5.4% | 1358.3 / 68.4 | 313 | coding (480/1017 nt) | ilvC | ketol‑acid reductoisomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (143/153); new base T (11/6); total (154/159) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 | |||||||||||
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
AAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAACCTGGTTGTAGTGGAT > NC_002947/5318441‑5318739 | aaaCCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTg < 2:2350029/150‑1 (MQ=255) aCCGGCTTGGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGGGGCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑Gc < 2:6798843/150‑1 (MQ=255) cGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGt > 1:6823843/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGt > 1:2292222/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGATTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGt > 2:2243868/1‑150 (MQ=255) gCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTg > 1:4134981/1‑150 (MQ=255) cTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGc > 1:5881945/1‑150 (MQ=255) cTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGc < 2:4134981/150‑1 (MQ=255) cTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGc < 1:2059179/150‑1 (MQ=255) cTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGc < 1:2019232/150‑1 (MQ=255) ttGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCg < 2:8909991/150‑1 (MQ=255) aCCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGaa < 1:1853530/150‑1 (MQ=255) aCCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGaa > 1:656620/1‑150 (MQ=255) ccAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTg‑g < 2:2608840/138‑1 (MQ=255) tCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTcc > 2:5331892/1‑150 (MQ=255) tCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTcc > 2:862639/1‑150 (MQ=255) gACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCAACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTg > 1:389344/1‑150 (MQ=255) accgcaaaGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGAAGGTGGTTTCAATAACGCCCGAACGACCGCCACCAACGCCCGAAGCGTAAGACAGAGCGA‑GATCATGTGCGTTGCCCGAAGCATCCTGATGGATCGc < 1:8959033/143‑1 (MQ=255) accgcaaaGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGAAGGTGGTTTCAATAACGCCCGAACGACCGCCACCAACGCCCGAAGCGTAAGACAGAGCGA‑GATCATGTGCGTTGCCCGAAGCATCCTGATGGATCGc > 2:761613/8‑150 (MQ=255) ccACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCg > 1:2657587/1‑150 (MQ=255) gcaaaGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGAAGGTGGTTTCAATAACGCCCGAACGACCGCCACCAACGCCCGAAGCGTAAGACAGAGCGA‑GATCATGTGCGTTGCCCGAAGCATCCTGATGGATCGCGAt < 2:4378650/146‑1 (MQ=255) cacaGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAtc < 2:4208197/150‑1 (MQ=255) cacaGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAtc < 2:8561076/150‑1 (MQ=255) caaaGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGAAGGTGGTTTCAATAACGCCCGAACGACCGCCACCAACGCCCGAAGCGTAAGACAGAGCGA‑GATCATGTGCGTTGCCCGAAGCATCCTGATGGATCGCGAta > 1:1357114/4‑149 (MQ=255) aGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGAAGGTGGTTTCAATAACGCCCGAACGACCGCCACCAACGCCCGAAGCGTAAGACAGAGCGA‑GATCATGTGCGTTGCCCGAAGCATCCTGATGGATCGCGAtaagg > 1:1124571/1‑150 (MQ=255) gAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGAAGGTGGTTTCAATAACGCCCGAACGACCGCCACCAACGCCCGAAGCGTAAGACAGAGCGA‑GATCATGTGCGTTGCCCGAAGCATCCTGATGGATCGCGAtaaggc < 2:1930986/150‑2 (MQ=255) gAACAACCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAtcaggt < 1:3760845/150‑1 (MQ=255) aaCAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAtcaggtc > 2:1564154/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAtcaggtcag > 2:5986932/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAtcaggtcag < 1:8421947/150‑1 (MQ=255) cAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGAAGGTGGTTTCAATAACGCCCGAACGACCGCCACCAACGCCCGAAGCGTAAGACAGAGCGA‑GATCATGTGCGTTGCCCGAAGCATCCTGATGGATCGCGAtaaggcaag < 2:7579734/150‑5 (MQ=255) gCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATgc > 2:4709858/1‑150 (MQ=255) gCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATgc < 1:4033021/150‑1 (MQ=255) cTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATgcc < 2:7452911/150‑1 (MQ=255) aCCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATgccgcc > 1:5546775/1‑150 (MQ=255) aCCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATgccgcc > 2:4608346/1‑150 (MQ=255) aaCAGGTCGGGTGCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCt < 2:9105279/150‑1 (MQ=255) aCAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCtt < 2:3438984/150‑1 (MQ=255) aGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTg < 2:5482988/150‑1 (MQ=255) gTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGAc > 2:1616071/1‑150 (MQ=255) cggtttcgTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCgg > 1:1440397/1‑150 (MQ=255) ggtttcgTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGa < 1:643372/150‑1 (MQ=255) ggtttcgTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGa < 2:2081808/150‑1 (MQ=255) ggtttcgTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGa < 1:4370708/150‑1 (MQ=255) gTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGa < 1:2427050/119‑1 (MQ=255) tCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACg > 1:3327899/1‑150 (MQ=255) tCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACg > 1:8676468/1‑150 (MQ=255) catGAAGGAGGTAACGATCAAACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCAAAGGACAGTGCGACGTTCTTC‑CCGTAGCCCGAAGCGACCTGCTAGAAAGCGATCAGGACAGGGAACCCGCCGCCATTGACGAACTCGGAGCGAACGgt > 2:3004767/3‑150 (MQ=255) cTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGgt < 2:3490103/150‑1 (MQ=255) ttGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGgtg > 2:6975777/1‑150 (MQ=255) tGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGgtgt < 1:4543161/150‑1 (MQ=255) tGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGgtgt < 1:3172296/150‑1 (MQ=255) tGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGgtgt > 2:2936300/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGtgtg < 1:639131/150‑1 (MQ=255) gAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGtgtg < 1:6215885/150‑1 (MQ=255) gAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGtgtg > 1:2188007/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGtgtg > 2:8070395/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGtgtg < 1:7506403/150‑1 (MQ=255) gAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGtgtg > 2:8294842/1‑150 (MQ=255) aggaggTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGc > 2:1151896/1‑150 (MQ=255) ggtggtTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGcc > 2:6463502/1‑150 (MQ=255) tggtTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCg < 2:5881945/150‑1 (MQ=255) tggtTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCg < 2:1292585/150‑1 (MQ=255) gtTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCggg < 1:1222721/150‑1 (MQ=255) tttCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCgggg < 1:7212291/150‑1 (MQ=255) gatgatACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATATGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCGTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCttt > 2:8727482/1‑150 (MQ=255) gatgatACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCttt > 2:7361320/1‑150 (MQ=255) tgatACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCg > 2:576568/1‑150 (MQ=255) tgatACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCg < 1:1003549/150‑1 (MQ=255) aCCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGgcgc < 2:6529701/150‑1 (MQ=255) ccGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGcgcg > 2:710402/1‑150 (MQ=255) ccGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGcgcg > 1:5111797/1‑150 (MQ=255) tACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCa < 2:1808748/150‑1 (MQ=255) tACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCa > 2:2799914/1‑150 (MQ=255) aCGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCAt < 1:4226541/150‑1 (MQ=255) caccacCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGTCGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCa < 2:1495100/150‑1 (MQ=255) caccacCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCa > 2:2884424/1‑150 (MQ=255) caccacCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCa > 1:3509714/1‑150 (MQ=255) accaccTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCAc > 1:928053/1‑150 (MQ=255) cTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGa < 1:2886072/150‑1 (MQ=255) cTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCAGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGa > 1:6592728/1‑150 (MQ=255) tACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAg < 1:1333718/150‑1 (MQ=255) tACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAg > 2:3702271/1‑150 (MQ=255) ccGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCgg > 2:801093/1‑150 (MQ=255) ccGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCgg < 1:8246953/150‑1 (MQ=255) cGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCgac < 2:6432954/150‑3 (MQ=255) tAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGa < 1:1698386/150‑1 (MQ=255) tAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGa > 1:6039335/1‑150 (MQ=255) tAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGa < 2:3288562/150‑1 (MQ=255) aGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGaa < 2:3977737/150‑1 (MQ=255) cAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGaacaac < 1:5831919/150‑1 (MQ=255) aGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAAcc < 2:5281164/150‑1 (MQ=255) aGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAAcc < 2:244211/150‑1 (MQ=255) tGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAACCTg < 2:4896833/150‑1 (MQ=255) tGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAACCTg > 2:4538638/1‑150 (MQ=255) tGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAACCTg < 1:7032417/150‑1 (MQ=255) tGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAACCTg < 1:7705771/150‑1 (MQ=255) tGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAACCTg > 1:7394963/1‑150 (MQ=255) gTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAACCTGGTTGTa < 1:6257002/150‑1 (MQ=255) tCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAACCTGGTTGTAGt < 2:5612122/150‑1 (MQ=255) | AAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAACCTGGTTGTAGTGGAT > NC_002947/5318441‑5318739 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |