| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,346,431:1 | +C | 6.4% | intergenic (+36/‑142) | pgi‑II → / → acsA‑II | glucose 6‑phosphate isomerase/acetyl‑CoA synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,346,431 | 1 | . | C | 6.4% | 753.9 / 41.5 | 171 | intergenic (+36/‑142) | pgi‑II/acsA‑II | glucose 6‑phosphate isomerase/acetyl‑CoA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (65/95); new base C (4/7); total (69/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.45e-01 | |||||||||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
AGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATA > NC_002947/5346283‑5346582 | aggagctgggcaaggGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑c < 2:3765388/150‑1 (MQ=255) gagctgggcaaggGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCt < 2:5959980/150‑1 (MQ=255) gagctgggcaaggGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCt < 1:4298917/150‑1 (MQ=255) ctgggcaaggGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTAcc < 1:8265464/150‑1 (MQ=255) ctgggcaaggGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTAcc < 2:5291917/150‑1 (MQ=255) ggcaaggGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAgg < 1:153057/150‑1 (MQ=255) ggcaaggGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAgg < 1:153050/150‑1 (MQ=255) aacatggCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCGCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGc > 2:6075920/6‑150 (MQ=255) caaggGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCa > 2:4641322/1‑146 (MQ=255) aaggGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCaa > 1:87338/1‑150 (MQ=255) aaggGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCaa < 2:2163299/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAAcgc < 1:8353238/150‑1 (MQ=255) ttACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCTCGGCCGTCTCCGCGGTTGATCCGAGCTTTTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑Ac < 1:4757535/150‑1 (MQ=255) ttACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑Ac < 1:5865095/150‑1 (MQ=255) ttACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑Ac > 2:1543666/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTc < 1:2001152/150‑1 (MQ=255) cAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCC‑‑CCTACCAGGCCACGCGTT‑ACCTCg > 2:5350676/1‑150 (MQ=255) aGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGATAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGt < 1:2615578/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGAGAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCTATCTTGTGCCGGCCTCTTCGAGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCTACGCGTT‑ACCTCGTa < 2:3055130/150‑1 (MQ=37) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTa < 1:3417947/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTa < 2:7913039/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTa < 1:5544311/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTa < 2:5008055/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTa < 1:6254287/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTa < 1:734902/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGCGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTa > 2:7423197/1‑150 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGGAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTa < 2:4325877/150‑1 (MQ=255) cgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAg < 2:3942780/150‑1 (MQ=255) ttGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAg > 2:1335395/1‑150 (MQ=255) tGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGc < 2:7028910/150‑1 (MQ=255) ggTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGGT‑ACCGCGGAGGAGCg > 2:6479559/1‑150 (MQ=255) gTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCgg < 1:1861128/150‑1 (MQ=255) gTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCgg < 1:4388715/150‑1 (MQ=255) gTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCgg < 2:5642077/150‑1 (MQ=255) gTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTG‑ACCTCGTAGGAGCgg < 2:5739784/150‑1 (MQ=255) tCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGCGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAggcggg < 2:2222413/150‑5 (MQ=25) gTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑Acc > 2:4575623/1‑134 (MQ=255) gTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑Acc < 1:4575667/134‑1 (MQ=255) gTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGttt < 1:4633392/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTAc < 2:6998814/150‑1 (MQ=21) gCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTAcc < 1:3075475/150‑1 (MQ=255) cTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCcg < 1:3579221/150‑1 (MQ=21) cTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCcg < 1:2161863/150‑1 (MQ=21) tGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGATTACCcgc < 2:87338/150‑1 (MQ=255) tGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCC‑‑CCAACCAGGCAACGCGGT‑ACCGCGGAGGAGCGGGGTTACCcgc > 2:5431319/1‑150 (MQ=38) ggAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCcgcg < 1:7025334/150‑1 (MQ=255) gAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTAGCGGGTAAAACCC‑‑CCAACCACGCCACCCCTT‑ACCACGGGGGTGCGGGGTTAACCCCGa > 1:4786128/1‑150 (MQ=25) aaGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:7301027/150‑1 (MQ=255) aaGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 1:2255953/150‑1 (MQ=255) aaGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:4546623/150‑1 (MQ=255) aaGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTAAACCcgctcc < 2:7297304/150‑4 (MQ=255) gACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 2:1918565/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCggg > 1:4895254/1‑133 (MQ=255) gcCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCGCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCGACCAGGCACCGCGTT‑ACCGCGTTGGAGCGGGTTTAGCCGCGGCGAggccgg > 2:4953415/1‑150 (MQ=255) cGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCGTCGCGGGGAAACCCG‑‑CCTACCCGGCCACGCGTT‑ACCGCGTAGGGGCGGGGTTTCCCGCCGAGAggccggcc > 2:4153048/1‑150 (MQ=255) aCGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTAACCCG‑‑CCGACCAGGCAACGCGTT‑ACCGCGTAGGCGCGGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCCGGt > 2:8684940/1‑150 (MQ=39) aCGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGt > 2:6939951/1‑150 (MQ=255) gtaccaccaACGGCGTTATCAACTAGTTCCGGGGCCGTCACCGGGTTTGATCCGAGTTTGTGCCGGCCTCTTCGGGGTTAAACCCC‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGGGGTTTTACCCGCTAAGAGGCCGGCCCAGGTTGa < 2:2958480/147‑1 (MQ=255) ccAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCgg > 2:896636/1‑112 (MQ=255) ccAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCgg < 1:896636/112‑1 (MQ=255) ccAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCGACCACGCAACCCGGT‑ACCGCGGAGGAGCGGGGTTACCCCCCAAGAGGCCGGCCCCGGGTTAACAcccc > 2:3370767/1‑148 (MQ=255) tGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCGACCACGCCACGCGGT‑AACACGTATGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCCGGTTGTACACCGCGCCCAGcg > 1:6744529/1‑149 (MQ=37) taTCAACTACGTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTa < 2:3777942/149‑1 (MQ=255) aaaaCTACTCCGGGGGCGGGCACGGGGGTTTAGCCGCGCTGGTGCGGCCCTCTCCGC‑GGTTAACCCC‑‑CCCACCCCGCAACGGGTTAACCTCTTTGGTGGGGTTTTACCCGCTACGCGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTaca < 2:7823614/148‑1 (MQ=255) ctactTCGGCGGCCGTCACGGCGTTTGATCCTAGCTTGTGCCGGCATCTTGGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCCGGCAACGCGTT‑ACCTCTTTGGTGCGTTTTTACCCGCGAAGTGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGt < 2:2905382/150‑1 (MQ=255) tactTCGGGGGCGGTCACGGGGGTTTATCGTTGCTTGTGCGGGCCTCTTCGGGGTTAAACCCG‑‑CCTACCAGGAAACGCGTT‑ACCTCGTTGGTGGGGTTTTACCGGCGATGTGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTc < 2:2018420/150‑1 (MQ=255) cccGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTAt < 2:9067523/149‑1 (MQ=255) ccGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTACGCGGTTAAACCCG‑‑CCTCCCCGGCAACGCGTT‑ACCTGGTTGGCGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATc < 2:2916886/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCGTCGCGGGGCAACCCG‑‑CCGCCCCCGCACCCCGGT‑ACCGCGGAGGCGCGGGGTTTCCCGCGCAGCGGCCGGCCCCGGGTGGACCCCGCTCCCCGCGACCCGGTCGTagag > 2:7976670/1‑147 (MQ=255) gggCCGTCACCGCGGTTTATCCGTGCTTGTGCGGGCCTCTTGGGGGGTAAACCGG‑‑CCTACCCGGCAACGCGTT‑ACGTGTTTGGAGCGGGTTTACCCGCGATGTGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGaa < 2:1398947/149‑1 (MQ=255) cgGCCGTCACCGCGGTTGATCCGCGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGaa < 2:6002238/150‑1 (MQ=255) tCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGGTAACCCC‑‑CCGACCAGGCAACCCCGT‑ACCGAGTAGGGGCGGGGTTAGCCCCGCAGCGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCACCGACACTGTCTTATCGAAAAGCCg > 2:1049996/1‑150 (MQ=255) tCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGGAAAACCC‑‑CCAACCACGCCACCCGGT‑AACTCGGATGAGCGGGTTTTACCCCGAAGAGGCCCGCCCACGGTGAACACCCCGCCCACCAAAAAAGTCTTATAGaaaatacc > 2:3207049/1‑144 (MQ=255) aCCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCGCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGGT‑ACCGCGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCACCCCGCGCCACGGTCTTATCGACTAGCCggt > 2:2847969/1‑148 (MQ=37) ctaGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTCGGCGCGGGTTTACCCGCGATGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGcc < 2:8896146/148‑1 (MQ=255) cGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTCCCAGGCACCGCGTT‑ACCTCGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGcc < 2:6848568/150‑1 (MQ=255) ggcgggCGTCTTCGCGGGTAACCCCG‑‑CCTACCCGGAAACGGGTC‑ACCTCGTCGGTGGGGTTTTACCGGCGACGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACaa < 2:8450775/146‑1 (MQ=255) ggCCGGCCCCGGCGGGGGTAACCCCG‑‑CCTCCCCGCCACCGGTTA‑ACCTCGTTGGTGGGGTTTTACCCGCTAAGTGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACaa < 1:3004137/149‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAACCCCG‑‑CCTACCCGGAAACGGTTT‑ACCTCGTAGTTGGGGGTTTACCCGCTATGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCa < 2:6442008/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGTTGAACACCGCACCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAgg > 2:864308/1‑150 (MQ=18) tctTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGa > 2:2521544/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGacc > 1:8221165/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGGT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCCAAGAGGCCGGCCCCGGTTGAACACCGCTCCCCGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTGCCGCCCCCCGTACAAGAGCCGGgcc > 1:1833063/1‑150 (MQ=37) gcgGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGaccacc > 2:7663085/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGaccacc > 2:7663246/1‑150 (MQ=255) cgGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCAccc > 2:656104/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCg > 2:3171784/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTT‑GCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCa < 2:6235532/115‑1 (MQ=17) gTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGcc > 2:1737897/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGcc > 1:8096876/1‑150 (MQ=255) tAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCa > 1:3223601/1‑150 (MQ=255) cccG‑‑CCTCCCCGCCACCGCGAC‑ACCCCGTAGGTGCGGGTTTACCCGCCAAGCGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGtt < 1:6075920/150‑1 (MQ=255) ccG‑‑CCTCCCCGTCAACGGGTT‑CCCTCGTAGGAGGGGTTTTACCCGCGACGAGCCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc < 2:2614315/150‑1 (MQ=255) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 2:2312216/1‑150 (MQ=255) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 2:2786340/1‑150 (MQ=255) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCCTGTTc > 2:5896204/1‑150 (MQ=255) cG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCg > 1:7228926/1‑150 (MQ=255) cG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCg > 2:6700983/1‑150 (MQ=255) g‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCCGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGa > 2:7079748/1‑150 (MQ=255) g‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGa > 2:7845848/1‑150 (MQ=255) | AGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTT‑ACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATA > NC_002947/5346283‑5346582 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |