| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 863166 = | 317 (1.150) | 15 (0.060) | 8/256 | NT | 5.2% | coding (297/1017 nt) | hemH | ferrochelatase |
| ? | NC_002947 | 863207 = | 253 (0.990) | coding (338/1017 nt) | hemH | ferrochelatase | |||||
GCAACGGTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/863323‑863166‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggctggccgCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGAGC > NC_002947/863207‑863353 GCAACGGTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCG > 2:1553545/1‑150GCAACGGTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCG > 1:605032/1‑150GCAACGGTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCG > 1:4792015/1‑150 AACGGTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGC < 2:9028380/150‑1 AACGGTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGC > 1:7587106/1‑150 ACGGTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCT < 2:6304905/150‑1 CGGTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTG > 2:5251064/1‑150 CGGTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTG > 1:394866/1‑150 GGTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGG < 1:5966132/150‑1 GGTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGG < 1:7962277/150‑1 GGTAACTGGTGCTCGCTCACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTGGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGG > 2:5571002/1‑150 GTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGC > 1:9054062/1‑150 GTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGC < 1:897117/150‑1 GTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGC > 1:8524789/1‑150 TTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGG > 1:2219525/1‑150 CGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGA > 2:6488505/1‑117 CGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGA > 2:1886828/1‑117 CGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGA < 1:1886828/117‑1 CGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGA < 1:6488505/117‑1 CCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACC > 2:5374040/1‑150 CAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGTCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCG > 1:3331736/1‑150 CAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGTCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCG > 1:7947449/1‑150 CAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGTCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCG > 1:6383342/1‑150 CAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGTCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCG > 1:6383500/1‑150 AGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGT > 1:7743172/1‑150 GCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTT > 1:7354843/1‑150 CCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGTCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTG > 1:8431848/1‑150 CCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGTCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTG > 1:8534637/1‑150 CCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCGTCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTG > 1:241201/1‑150 CGGCTGGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTC < 1:36707/150‑1 GCTGGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTA > 2:195286/1‑150 CTGGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTAT < 2:884766/150‑1 CTGGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTAT < 2:509798/150‑1 TGGCCGTCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATG < 2:8534637/150‑1 TGGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATG < 1:8227215/150‑1 GGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGA > 1:1358684/1‑150 GGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGA > 1:8340091/1‑150 GGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGA < 2:8187645/150‑1 GGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGA < 1:7617781/150‑1 GGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGA < 1:345936/150‑1 GGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGA < 2:3174709/150‑1 GGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGA < 2:2658209/150‑1 GGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGA < 2:2121505/150‑1 GGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGA > 1:8033729/1‑150 GGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGA < 1:8642607/150‑1 GGCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAATTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGA < 2:6204020/150‑1 GCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGAG < 2:3254383/150‑1 GCCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGAG > 1:7439107/1‑150 CCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGAGC > 1:7916091/1‑150 CCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGAGC > 1:7351366/1‑150 CCGCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGAGC > 1:8575502/1‑150 GCAACGGTAACTGGTGCTCGCTGACCGTCTGTTTTGCCTGCTCGATCACAGTGGTCACCGTGCTGTCGGCGAACTGTGGATAAAGCGGTGCCAAAGTCACCTTGCGCACACCTTGGGCGGCCAGCCGCGCCAACACATCAGGCAAGGCCGGCTGGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/863323‑863166‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggctggccgCCCAAGGTGTGCGCAAGGTGACTTTGGCACCGCTTTATCCACAGTTCGCCGACAGCACGGTGACCACTGTGATCGAGCAGGCAAAACAGACGGTCAGCGAGCACCAGTTACCGTTGCAGATGCGCGTGCTGCAGCCGTTCTATGAGC > NC_002947/863207‑863353 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |