New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1025296 | 113 (0.410) | 13 (0.060) | 6/222 | NT | 11.9% | intergenic (‑147/+82) | opdP/dppA‑II | glycine‑glutamate dipeptide porin/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | = 1025335 | 102 (0.460) | intergenic (‑186/+43) | opdP/dppA‑II | glycine‑glutamate dipeptide porin/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1025121‑1025296 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcctcttcgcgggcaagcccgctcccACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCCGGCCCACAA < NC_002947/1025335‑1025187 GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTG > 1:8790550/1‑150 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> 1:8207764/1‑150 TCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGC > 2:5848625/1‑150 TCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGC > 1:3249526/1‑150 TCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGC > 2:5848601/1‑150 TCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGC < 2:354112/150‑1 AAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGG < 1:9040607/150‑1 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TGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAA < 2:1347156/150‑1 AATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGC > 2:8337498/1‑150 AATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGC > 1:527772/1‑150 ATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCC > 1:1035008/1‑150 TACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGGGAGCCC > 1:7761823/1‑150 TACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGGCAGCCC > 1:1924219/1‑150 TACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCC > 2:1351574/1‑150 TACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCC > 2:1351695/1‑150 TACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCC > 2:1236917/1‑150 TACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCC > 1:8058179/1‑150 TACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCC > 2:434213/1‑150 TACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGACAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCC > 2:1351570/1‑150 ACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCG < 1:8502115/150‑1 gTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCT < 1:8591058/149‑1 TTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGCCCGCg > 1:7058922/1‑149 TTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCCAGCCCccc > 1:71486/1‑147 TTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCCAGCCCGCT 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< 1:677664/150‑1 GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGCTTCTCGACAGGTTCGGACACGGCGCCCTACCTGCGGGAGGGGGCTCCCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAA < 1:677698/150‑1 GCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTCTCGCCAGGTTCGGACACTGCGCCCGACCGGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCGAACGGCCCACCCCACGCCCCGATTATGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCGGGCAcc > 2:310159/1‑148 CCTCTTCGCGGGCAACCCCGCTCCCACAGCATCACGACAGGTTCGCACACTGCGCCCTACCAGAGGGAGCGGCCTTCCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACA < 2:8834191/150‑1 TTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCAGGCAACACCGC > 2:1710690/1‑150 TCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCA < 2:8595026/150‑1 TCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCGACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGAATCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACCCCGCA > 2:6227028/1‑150 TCGCGGCCCAGCCCCCGCCCACAGGATCTCGCCAGGTTCGGACACTGCGCCCCACCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCA < 1:8859913/150‑1 GCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCAACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGC > 1:5099311/1‑150 GGCAAGCCCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAAT < 2:9156283/150‑1 GGCAAGCCCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAAT < 2:5646599/150‑1 GCAAGCCCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATC > 2:7847694/1‑150 GCAAGCCCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATC > 2:9166772/1‑150 ttGCCCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCAC > 1:8115612/3‑150 AAGCCCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCAC > 1:434213/1‑150 AAGCCCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCAC < 2:1571834/150‑1 GCCCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCC > 1:1365362/1‑150 GCCCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCC < 2:4340647/150‑1 CCGCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCCGG < 2:5859823/150‑1 CGCCCCCACCGGAGCGCGCCCGGGTCGGACACTGCGCCCGACCTGCGGGCGCGGGCTGCCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCCGGC < 1:591486/150‑1 GCTCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCCGGCC > 2:1810604/1‑150 TCCCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCCGGCCCA > 1:7362832/1‑150 CCCACCGGTTCTCGACCGGTTCGGACAGGGCGCCCTCCCTGTGGGAGGGGGCTGGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCCGGCCCAC < 1:8087190/150‑1 CCCACAGTATCTCGACAGGTCCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCCGGCCCAC < 1:5250242/150‑1 CCACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCCGGCCCACA > 2:6810638/1‑150 CACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCCGGCCCACAA > 1:5837450/1‑150 CACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCCGGCCCACAA > 1:4672122/1‑150 CACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCCGGCCCACAA > 2:2495200/1‑150 GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1025121‑1025296 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcctcttcgcgggcaagcccgctcccACAGGATCTCGACAGGTTCGGACACTGCGCCCTACCTGAGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGAACGGCCAACACAACGCCCCGATTCTGCCCGGCGATCCCGCGGCACCCCTGGCAACACCGCAGCAATCACCCGGCCCACAA < NC_002947/1025335‑1025187 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |