New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1838122 | 185 (0.670) | 16 (0.060) | 10/256 | NT | 7.2% | intergenic (+27/+77) | PP_1642/PP_1643 | hypothetical protein/membrane protein |
? | NC_002947 | = 1838184 | 240 (0.940) | intergenic (+89/+15) | PP_1642/PP_1643 | hypothetical protein/membrane protein |
ATCGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1837967‑1838122 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGCCCGCTCTC < NC_002947/1838184‑1838036 ATCGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCG > 2:5303618/1‑150 ATCGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCG > 2:5303533/1‑150 TCGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGC > 1:1149886/1‑150 TCGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGC > 1:1149769/1‑150 TCGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGC < 1:6673776/150‑1 GACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGG < 2:5457881/150‑1 GACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGG < 1:4960520/150‑1 GACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGG < 2:7953344/150‑1 ACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGG > 1:5276392/1‑150 AAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCA > 1:8282754/1‑150 AAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCA > 1:9020109/1‑150 AAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCA > 1:7850384/1‑150 AAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCA > 1:6023772/1‑150 TCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCC > 2:6273500/1‑150 AACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTAC < 1:6635131/150‑1 AACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTAC > 1:7058675/1‑150 AACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTAC < 1:7974025/150‑1 CAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGT < 2:6707889/150‑1 CAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGT < 2:6707670/150‑1 CAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGT < 1:6956983/150‑1 CAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGT < 1:6273500/150‑1 AGTGGCATGCAGAGCGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTG < 1:7404477/150‑1 TGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGG < 2:6749511/150‑1 GGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGTGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGC < 2:633085/150‑1 CGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTTGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA < 1:211682/150‑1 GCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGC > 1:4599093/1‑74 GCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGC < 2:4599093/74‑1 GCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGC < 2:4599267/74‑1 GCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGC > 1:4599267/1‑74 TCCCATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGC > 2:6953483/1‑150 CCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGT > 2:6587511/1‑64 CCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGT < 1:6587511/64‑1 TTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCGTAAGTGCGGTGCGCTTACGGTGGGCGCGGGCATTCCCGCGAAGGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCAACACCGACCACAGGCACACCGGCCc > 1:8863334/1‑149 TCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGC < 2:7308188/150‑1 TCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGC < 2:7308537/150‑1 TCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGC < 2:2745289/150‑1 TCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGC < 2:7308698/150‑1 GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGCCC < 1:4932016/150‑1 GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGCCC < 1:4932150/150‑1 GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAATGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGATCGGGCAAGCCCGCGAATGGGAGCAACACAACGCACAATGGTTTACGGTTTGCGCCAGCATCACCCACAACATGCACAGCGGCCGCCC > 2:3016626/1‑150 CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGCCCG > 2:1997711/1‑150 CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGCCCG > 2:6630442/1‑150 CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGCCCG > 2:6630337/1‑150 GGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGCCCGCT > 2:1156281/1‑150 GGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCACAATCGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACAGGCACACCGGCCGCCCGCT > 1:7078926/1‑150 CACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTGGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGGCGGCCGCTgt < 2:882894/150‑3 ACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGCCCGCTCTC > 2:4179894/1‑150 ACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGCCCGCTCTC > 2:4179175/1‑150 ATCGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1837967‑1838122 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCTTAAGTGCGGTGCGATTACTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGGAGCAACACAAGGCTCAATGGTTGACGGTGTGCGCCAGCATCACCGACAACTGGCACAGCGGCCGCCCGCTCTC < NC_002947/1838184‑1838036 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |