New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2297734 = | 205 (0.740) | 30 (0.110) | 7/266 | NT | 13.2% | intergenic (+15/+118) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
? | NC_002947 | 2297831 = | 197 (0.740) | intergenic (+112/+21) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
GCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2297887‑2297734 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggaccCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCA > NC_002947/2297831‑2297979 GCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGACGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAG < 2:6272749/150‑1 GCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGACGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAG < 2:6272759/150‑1 TTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCCCCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGA > 2:2980608/1‑150 TTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGAGGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCAGGA > 2:5747539/1‑150 TCGGAGCTGTTCACGGCAATCAGGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGACGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGAC < 1:6617214/150‑1 TCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACTTGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGAC < 1:6617565/150‑1 CCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGCAGCGGGCCCCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAG > 2:2437244/1‑150 CCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTAAACAGCTCCGAAG > 2:3924441/1‑150 GCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCC > 1:8457273/1‑150 GCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGAGGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCC > 1:1903024/1‑150 GCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCC > 2:4362721/1‑150 GCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCC > 2:721198/1‑150 ATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAG > 2:1997155/1‑150 ATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAG > 2:1526349/1‑150 ATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCTATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAG > 2:4276181/1‑150 TGCCCGCGAAGCGGGCCCCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGC > 2:6099141/1‑150 TGCCCGCGAAGCGGGCCCCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGC > 2:1497227/1‑150 TGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGC > 1:8870082/1‑150 TGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGC > 2:494724/1‑150 TGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGC > 2:4123473/1‑150 GCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCCTGCCCGCTCCCACACGGCCCCAGGTGCCGCCCGAGGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCGTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCC > 1:4807846/1‑150 GCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCCTGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCCTGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCCCCCCTCCAGCC > 1:4808352/1‑150 GCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCC > 1:1073613/1‑150 GCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGACACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCC > 1:1023499/1‑150 aCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAG > 1:545787/2‑150 CCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCCTGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAG > 1:6587703/1‑150 CCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAG > 1:8182220/1‑150 CCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAG > 1:6819436/1‑150 CCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAG > 1:226230/1‑150 CCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCACCAGCCAG > 1:2798759/1‑150 CCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGAGTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAG > 2:3976731/1‑150 GCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCA > 1:4009600/1‑150 GCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAG > 1:3683217/1‑63 GCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAG < 2:3683217/63‑1 cCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACG < 1:1997155/149‑1 GCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGAC < 1:6099141/150‑1 GCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGAC < 1:1497227/150‑1 CGCTCCCACAAGGACCTATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAACTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACT > 2:8551591/1‑150 GGACCCATGTGCAGCCCGATTTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGTCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGG < 1:8193007/150‑1 GGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACCGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGG < 1:8192275/150‑1 GGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGG < 1:8801220/150‑1 GGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGG < 1:2516010/150‑1 GACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGG < 1:5347526/150‑1 ACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAATAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGG < 1:3350177/150‑1 CCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGTCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCA > 2:538492/1‑150 CCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCA < 2:1795029/150‑1 CCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCA < 2:4414578/150‑1 CCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCA > 1:8897944/1‑150 CCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCA < 2:8451249/150‑1 GCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2297887‑2297734 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggaccCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCA > NC_002947/2297831‑2297979 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |