| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 100443 = | 195 (0.710) | 11 (0.050) | 7/242 | NT | 5.4% | intergenic (‑35/+87) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 100525 = | 218 (0.900) | intergenic (‑117/+5) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
GGTCCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGC > NC_002947/100294‑100592 | gTCCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTT > 1:6358495‑M1/1‑150 (MQ=255) cGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGC > 1:713983‑M1/1‑150 (MQ=255) ctacctgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTcgcg > 1:3671387‑M1/145‑150 (MQ=255) gTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGG > 2:2932190‑M1/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGG < 1:3994213‑M1/150‑1 (MQ=255) ttCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGG < 2:8945106‑M1/150‑1 (MQ=255) cctgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGc < 1:7299073‑M1/9‑1 (MQ=255) tgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttgtctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCAt > 2:3993744‑M1/140‑150 (MQ=255) gtcgATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCAT > 2:6623254‑M1/1‑150 (MQ=255) tacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCATGc > 2:2224244‑M1/138‑150 (MQ=255) tacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCATGc > 1:5558247‑M1/138‑150 (MQ=255) acaggggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCATGcc > 2:8505655‑M1/137‑150 (MQ=255) catgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCATGccc > 1:9037587‑M1/136‑150 (MQ=255) atgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCATGCCCg < 2:7655578‑M1/16‑1 (MQ=255) gCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGC > 2:8295479‑M1/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTc > 1:2042153/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCcac < 1:1537130/150‑1 (MQ=255) ttGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCcaca > 2:9034767/1‑150 (MQ=255) tGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAg < 2:4586049/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAg < 1:7662763/150‑1 (MQ=255) ccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAg > 1:8502846‑M1/126‑150 (MQ=255) ccAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTa > 1:3799557/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGtga > 2:701238/1‑148 (MQ=255) 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tGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGcc > 1:2765237/1‑150 (MQ=255) ggATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTAGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCt > 1:2547556/1‑150 (MQ=255) gATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCtt > 2:6276346/1‑150 (MQ=255) gATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCtt > 2:8634354/1‑150 (MQ=255) cgagcgagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCTCAGGTAAAGCGCAGGCCTTGaa < 2:1114790/150‑1 (MQ=255) gagcgagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAg > 1:8405795/1‑150 (MQ=255) agcgagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAgg < 2:1766953/150‑1 (MQ=255) agcgagTGAAGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAgg > 2:7728782/1‑150 (MQ=255) gagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGc < 1:3183646/150‑1 (MQ=255) gagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGc < 1:1963231/150‑1 (MQ=255) gagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGc < 2:7836338/150‑1 (MQ=255) gagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGc < 2:1402434/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAAcc > 2:559776/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAAcc > 2:5731169/1‑150 (MQ=255) cAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCt > 1:1094582/1‑150 (MQ=255) 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accgggTTCCACTTGTGTGCTGGGTGGCCTTCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAgg < 1:8872800/147‑1 (MQ=255) gggTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGc > 1:6675715/1‑150 (MQ=255) ttCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTgg > 1:5822023/1‑150 (MQ=255) ttCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTgg > 1:3404441/1‑150 (MQ=255) cACTTGTGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTcc < 1:5160112/150‑1 (MQ=255) aCTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCt > 1:8045850/1‑150 (MQ=255) aCTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCt < 1:8284520/150‑1 (MQ=255) cTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCtt > 2:325059/1‑150 (MQ=255) tGAGTGCTGGGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGa < 1:7393239/150‑1 (MQ=255) tGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCCTGCCCGCGCCCACAGGTAACGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGa < 2:468730/150‑1 (MQ=255) 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ttcGCGGGCATGCCCGCccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacg < 1:8190627‑M1/150‑134 (MQ=255) | GGTCCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGC > NC_002947/100294‑100592 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |