| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 478264 = | 84 (0.300) | 15 (0.070) | 5/216 | NT | 16.0% | intergenic (+9/+101) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
| ? | NC_002947 | 478359 = | 92 (0.430) | intergenic (+104/+6) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase | |||||
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CCGCTGTCGTTGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGT > NC_002947/478115‑478413 | ccgattacctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacc < 1:101298‑M1/1‑1 (MQ=255) cgattacctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCg < 1:4659709‑M1/2‑1 (MQ=255) cTGTCGTTGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGC < 2:4298226‑M1/150‑1 (MQ=255) ttacctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGcc > 2:888659‑M1/146‑150 (MQ=255) cctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCctct < 2:2829632‑M1/8‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTC > 2:3803868‑M1/1‑150 (MQ=255) tgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTc < 2:1971110‑M1/10‑1 (MQ=255) tgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTc < 2:8087306‑M1/10‑1 (MQ=255) gcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTcg < 1:3431715‑M1/11‑1 (MQ=255) gCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC < 2:5222861‑M1/150‑1 (MQ=255) cgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTcgc > 2:2820289‑M1/139‑150 (MQ=255) aggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCgg > 1:1840244‑M1/137‑150 (MQ=255) aggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCgg > 1:4926959‑M1/137‑150 (MQ=255) ggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaacgtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCggg > 1:5295355‑M1/136‑150 (MQ=255) ggCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGG < 2:5904201‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTGAAC > 1:3136512‑M1/1‑150 (MQ=255) ccGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAC < 1:5637671‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGGAAAa > 1:2343693‑M1/1‑149 (MQ=255) gACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCC > 1:2829626‑M1/1‑150 (MQ=255) gACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGACCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCC < 1:5515354‑M1/150‑1 (MQ=255) agcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg > 2:2280000‑M1/128‑150 (MQ=255) aCCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG > 2:759607‑M1/1‑150 (MQ=255) gcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 1:5058746‑M1/127‑150 (MQ=255) ccTTGTGCATCCGGTTGTGGGCTAGTGCATGGCTCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCATGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGC < 2:7149929‑M1/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGC < 2:1584620‑M1/150‑1 (MQ=255) tGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCGGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTC > 1:1494029‑M1/1‑150 (MQ=255) tGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA < 1:5528238‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA < 1:1995641‑M1/150‑1 (MQ=255) ggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 1:6416324‑M1/122‑150 (MQ=255) ggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 1:2846771‑M1/122‑150 (MQ=255) gCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < 2:645237‑M1/150‑1 (MQ=255) gggTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACggg < 2:2936376/150‑1 (MQ=255) gggTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACggg < 2:904066/150‑1 (MQ=255) 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ggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGt > 1:1417064‑M1/84‑150 (MQ=255) aGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTATACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgta > 1:3728855‑M2/1‑147 (MQ=255) gcgcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagc < 1:5154722‑M1/150‑44 (MQ=255) gcgcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagc > 2:5678428‑M2/1‑142 (MQ=255) gcgcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCGgtaggagc < 2:7364251‑M2/150‑9 (MQ=255) 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atcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttaccc > 1:7746195‑M2/1‑132 (MQ=255) atcAGGTACTGGCCCCCGAGGCCTTTGAGTGGAGCGGGTTGCATATGACGCCCGCTTGAGCCTGTATAGGCCTCATATCCGGTAAACCCGAAACTACGAATGCATGAGCCCAACCGCTGATGTGTGACCACTCTAGGAGAGGGATAAccc > 2:6799165/1‑150 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtaaacccgctcc > 2:7666447‑M2/1‑127 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCAgtaggagcgggtttacccgcgaa < 1:6090384‑M2/150‑24 (MQ=255) tgggCTTTTGGGTGGGGGGGTTTGCTTTTGACGCCGGTTTGAGCCTTTATCGGCCTCTGCGCGGTTAAACCCGCACCTACGCGGGGATTAGCCAACCCTCTTATGGGTGCCCCCTGTAGTTGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAgg < 2:6913478/148‑1 (MQ=255) cgtttGTGTGGCGGGGGTTGCTGTTGCCGCCCGCTTGCGCCTGTATCGGCCTCTCCGGGGGTAAACCCGCTCCTACGCGGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTCGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTa < 2:4965707/148‑1 (MQ=255) ccTTTGTGTGGCGGGGGTTGCAGTTGCCGCCCGCTTGAGCGTGTTCCGGCCTCTTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCAACCCTCTTTTGTGTGCCCCCTGTTGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTa < 2:609723/150‑1 (MQ=37) tttGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAAc > 2:692486/1‑150 (MQ=255) tttGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCACCAACCACCGGCAGATCCCCACCACCGATGTGTTCCCCCAGTAGGAGCCGGTTTACCCGCGAACAGGCCGGTAGGTCTaaa > 1:8756298/1‑149 (MQ=255) tttGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCAACTACGACGGGCTGAGCCCAACCACTGATGTGTTCCCCCAGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCCGTAGGTCTAAc > 2:3079837/1‑150 (MQ=255) 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ggTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCGTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCGACGGGCTGCGCCCACCCTCTGATGGGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGc < 2:6749745/150‑1 (MQ=39) tgcttttGACGCCCGTTTGCGCCTGTAGCGGCCTCTGCGGGGTTAACCCCGCCCCTCCGCGGGGCTGCGCCCACCCCGGGCGGTGGGCCCCGGGGCGGCGGGGTTTCCCCCGCGACGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTc < 2:4083259/145‑1 (MQ=255) ctgTTGCCGCCCGGTGCAGCCTGTATCGGCCTATTCGGGGTTAACCCCGCGCCTACGCCGGGCTGCGCCAACCCTCGGTTGTGTGCCCCCTGTCGGCGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGa < 1:7626900/148‑1 (MQ=255) gTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCGACGACGGGCGGAGCCCCACCTCGGCTGTGTGCCCCCGGGAGGGGCCGGGTTACCCGCCAAGAGGCCGGTCGGTCGAACCGCGCGGGTCAGCCgcgcgc > 2:4659709/1‑150 (MQ=255) cccGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCa < 2:7486893/150‑1 (MQ=255) 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aTCGGCCTCGGCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGa < 2:5588861/150‑1 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacctcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcggaggggccgatacaggcgccagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcacaggccacggggg > 2:5168946‑M1/1‑30 (MQ=255) | CCGCTGTCGTTGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGT > NC_002947/478115‑478413 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |