New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1025270 = | 108 (0.390) | 16 (0.070) | 7/222 | NT | 14.5% | intergenic (‑121/+108) | opdP/dppA‑II | glycine‑glutamate dipeptide porin/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 1025363 = | 102 (0.460) | intergenic (‑214/+15) | opdP/dppA‑II | glycine‑glutamate dipeptide porin/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTGCGCCCAAACG > NC_002947/1025121‑1025418 | gCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTG > 1:8790386‑M1/1‑150 (MQ=255) agcggctcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccg > 1:6396244‑M1/150‑150 (MQ=255) cAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGC < 1:898126‑M1/150‑1 (MQ=255) gTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTAGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCT > 2:5575876‑M1/1‑150 (MQ=255) ctcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCctc < 2:8063441‑M1/6‑1 (MQ=255) aagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTc < 2:6881975‑M1/9‑1 (MQ=255) tCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGC < 2:354112‑M1/150‑1 (MQ=255) agcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTcg > 1:5818097‑M1/141‑150 (MQ=255) cagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTcgcg > 1:8082304‑M1/139‑150 (MQ=255) agcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCgg > 1:1636692‑M1/138‑150 (MQ=255) agcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCgg > 2:3020014‑M1/138‑150 (MQ=255) tGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAA < 2:3405042‑M1/150‑1 (MQ=255) tGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAA > 2:2382515‑M1/1‑150 (MQ=255) tGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAA > 2:1531169‑M1/1‑150 (MQ=255) tGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAA < 1:917228‑M1/150‑1 (MQ=255) gtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCgggccag < 1:4340647‑M1/18‑4 (MQ=255) aaTACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGC > 1:527772‑M1/1‑150 (MQ=255) taccgatgacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGcgggcttgc > 1:3027854‑M1/132‑146 (MQ=255) aTACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCC > 1:1035008‑M1/1‑150 (MQ=255) tACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGGCAGCCC > 1:1924219‑M1/1‑150 (MQ=255) tACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCC > 2:1351574‑M1/1‑150 (MQ=255) tACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCC > 1:3746076‑M1/1‑150 (MQ=255) ccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccg < 1:3426999‑M1/1‑1 (MQ=255) ccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCAAGccc < 2:5878886‑M1/21‑1 (MQ=255) aCTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCG < 1:8502115‑M1/150‑1 (MQ=255) tttCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGGAAGGCCGgt > 1:7747354‑M1/1‑148 (MQ=255) tttCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGCCCGCg > 1:7058922‑M1/1‑149 (MQ=255) tttCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCCAGCCCGCg > 1:5048246‑M1/1‑149 (MQ=255) tttCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCT > 2:2117800‑M1/1‑150 (MQ=255) gttcAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCT < 1:8591058‑M1/149‑1 (MQ=255) ttCAAGGTTAATGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGGTC > 2:1724229‑M1/1‑150 (MQ=255) ttCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTC > 2:1968515‑M1/1‑150 (MQ=255) ttCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTC > 2:6131904‑M1/1‑150 (MQ=255) 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cGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCacaggatctcgacaggttcggacactgcgccctacctgagggagcggg < 1:3858775‑M1/150‑49 (MQ=255) cGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGCGTTAGCCAGTACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCacaggatctcgacaggttcggacactgcgccctacctgagggagcgg < 1:4018760‑M1/150‑48 (MQ=255) gggTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTgggagcgggc < 2:4340647‑M2/150‑11 (MQ=255) gTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTgggagcgggcaa > 1:8115612‑M2/1‑138 (MQ=255) gATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTgggagcgggcttgc > 2:9166772‑M2/1‑136 (MQ=255) gATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTgggagcgggcttgc > 2:7847694‑M2/1‑136 (MQ=255) gctgcGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTTGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTgggagcgggcttgcccgc > 1:5099311‑M2/1‑132 (MQ=255) tgcGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTgggagcgggcttgcccgcga < 2:8595026‑M2/150‑21 (MQ=255) tgcGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTGGGGCGCAGTGTCCGAACCTGGCGAGATCCTGTgggcgggggctgggccgcga < 1:8859913‑M2/150‑21 (MQ=255) tgcGGGGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGATTCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTCGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTgggagcgggcttgcccgcga > 2:6227028‑M2/1‑130 (MQ=255) tgtTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGGAAGGCCGCTCCCTCTGGTAGGGCGCAGTGTGCGAACCTGTCGTGATGCTGTgggagcggggttgcccgcgaagagg < 2:8834191‑M2/150‑26 (MQ=255) ttGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCCAGCCCCCTCCCGCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGCTCCTGTgggagcgggcttgcccgcgaagaggcc < 1:677664‑M2/150‑28 (MQ=255) ccAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCggg > 2:7013232/1‑149 (MQ=255) cAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGCCCTCAGGGAGGGCGCCGTGTCCGAACCGGGCGAGATCCGGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGACGAGGCCGGTa > 2:2546327/1‑150 (MQ=38) ggATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCCGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCGGTCGAGATCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACAGGCCGGGACAGGCGAACGCta > 1:6033235/1‑149 (MQ=38) 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ttCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCACCCTCACGTAGGGGGCCGTGTCCGCACCGGGCGAGAAACGGTGGGGGCGGGCTTGCCCCCGAAGCGGCCCGTACTGGCTAACGCGTAAAAAACCCACACACCGCAAAAAACAGTTCGCCCaa > 2:830418/1‑150 (MQ=255) | GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCC‑GTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTGCGCCCAAACG > NC_002947/1025121‑1025418 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |