| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1444636 | 363 (1.320) | 19 (0.070) | 9/274 | NT | 5.0% | coding (253/1530 nt) | PP_1263 | fusaric acid resistance protein |
| ? | NC_002947 | = 1444681 | 356 (1.300) | coding (298/1530 nt) | PP_1263 | fusaric acid resistance protein | |||||
Only 100 of 417 total aligned reads displayed.
AGACGCTGCAAGCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGT > NC_002947/1444487‑1444785 | aGACGCTGCAAGCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC > 1:9090771‑M1/1‑150 (MQ=255) gACGCTGCAAGCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCt > 1:96196/1‑150 (MQ=255) gCTGCAAGCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGc < 2:6220318/150‑1 (MQ=255) gCAAGCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCAt < 2:3173906/150‑1 (MQ=255) gCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGcc > 2:3411590/1‑150 (MQ=255) cTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGcgcg > 1:7811444/1‑150 (MQ=255) ttGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCgg > 1:7524686/1‑150 (MQ=255) ttGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCgg < 2:6936949/150‑1 (MQ=255) ttGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCgg < 2:6121551/150‑1 (MQ=255) ttGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCgg > 2:5604188/1‑150 (MQ=255) ccaccGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTgc < 2:7671729/150‑1 (MQ=255) ccaccGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTgc > 2:8134031/1‑150 (MQ=255) caccGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTgcg < 2:5320174/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAg < 2:415226/150‑1 (MQ=255) gcgGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGcc < 2:5215500/150‑1 (MQ=255) gcgGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGcc > 1:3916918/1‑150 (MQ=255) gCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAg < 1:5362075/150‑1 (MQ=255) cATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCtggccatggcttcgcgcacccgcgctgcggccatggc < 1:5263300‑M1/150‑38 (MQ=255) 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aCTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTc < 2:2354151/150‑1 (MQ=255) tGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGa < 1:6956878/150‑1 (MQ=255) tGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGa < 2:376217/150‑1 (MQ=255) cGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTc < 1:191291/150‑1 (MQ=255) tCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTcggc > 2:4827825/1‑150 (MQ=255) 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AGACGCTGCAAGCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGT > NC_002947/1444487‑1444785 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |