New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1925768 | 116 (0.420) | 10 (0.040) | 7/228 | NT | 8.2% | intergenic (‑25/+75) | PP_1725/PP_1726 | hypothetical protein/ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | = 1925785 | 128 (0.560) | intergenic (‑42/+58) | PP_1725/PP_1726 | hypothetical protein/ABC transporter substrate‑binding protein |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
TCGGCCTCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTCCCAGGCTTCGGC > NC_002947/1925619‑1925917 | cGGCCTCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAt < 1:4847753/150‑1 (MQ=255) gCCTCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGt < 2:6931688/150‑1 (MQ=255) cTCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTGTAt > 2:7422531/1‑150 (MQ=255) gACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATcgc < 2:9122301/150‑1 (MQ=255) gACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATcgc < 2:6724744/150‑1 (MQ=255) gACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAAACCGCTACTACATGTATcgc > 2:2822898/1‑150 (MQ=255) cGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGt < 2:5464747/150‑1 (MQ=255) gTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTa < 2:6978948/150‑1 (MQ=255) cGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCt < 1:7232752/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGtgt > 2:802822‑M2/1‑147 (MQ=255) ggTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGATGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGtgtag > 1:1796574‑M2/1‑145 (MQ=255) ggTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGtgtag > 1:4641499‑M2/1‑145 (MQ=255) tGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCTCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGtgtagga > 1:2033313‑M2/1‑143 (MQ=255) tGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGtgtagga > 2:2081820‑M2/1‑143 (MQ=255) cccATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTG‑CACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGtgtaggagcgg > 1:6223126‑M2/1‑139 (MQ=255) cccATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTG‑CACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGtgtaggagcgg > 1:6223079‑M2/1‑139 (MQ=255) cATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGtgtaggagcggg > 2:8044473‑M2/1‑138 (MQ=255) cATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGACGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAcagggatacgcgatacatgtaggagcggg < 1:106476‑M1/150‑30 (MQ=255) cATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAcagggatacgcgatacatgtaggagcgggtttac < 1:1485780‑M1/150‑35 (MQ=255) aTGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGACACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGtgtaggagcgggtttacc > 1:8386908‑M2/1‑132 (MQ=255) ggCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCGGtgtaggagcgggtttacccgcgaa < 2:9124336‑M2/150‑25 (MQ=255) cttaTAGTTGAGGCCGTCGAGCCGGACCAGGATGACGTTGTGTTGAATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTAACCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGcc < 1:7629404/147‑1 (MQ=255) cTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTTGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGcc < 1:7629418/150‑1 (MQ=255) cTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTAACCGCGAAAGGGcc > 2:8255855/1‑150 (MQ=255) tGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGtgtaggagcgggttta > 2:2571502‑M2/1‑119 (MQ=255) tGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCg < 2:7613955/150‑1 (MQ=255) tGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAAACCCCAACAAAAAGTATAGCGGAAACCAAGGTAGGGGC‑GGGTGTTACCC‑CGAAAAGGCCg > 1:5850316/1‑150 (MQ=255) gTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCa < 2:2944302/150‑1 (MQ=255) tGAGGCCGTCGTGCTGGACCTGTTTGACGTTGTGTTGCATTTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGTTAAACCCGCTCCTAAATGTATCGCTTATCCCTGTGTTGGTGG‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAgg < 1:7422531/150‑1 (MQ=255) gAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTTAAAACCCTCCAAAAATTATCGCGTAAGCCCGGGGTGGTGC‑GGGG‑TTTCCCGCCGCAGGGCCCGAtaccgc > 1:8797439/1‑145 (MQ=255) gCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTTAAACCCCACCGACCAGTAAAGCGTATACCAGGGTTGGAGCGGGGT‑TTACCC‑CCAAAGGGCCCGGTCACGCAca > 1:2030418/1‑149 (MQ=255) ctaGCAGGACATTGTTGACTTTGTTTTGCATGTTTTCTCAAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCTGTTAAACCCGCTCCTACATTTATCGCGTATCCCTTTTTTGGAGC‑GGTT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACaaa < 2:4051067/148‑1 (MQ=255) aGGACCAGGAGGACGTGGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTGGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAagccca < 2:5719290/150‑1 (MQ=255) ggACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAagcccag < 2:3495857/150‑1 (MQ=255) gACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACTTGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAagcccagc < 2:634643/150‑1 (MQ=255) aCCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCCCCCCGAAAAGTATAGCGTATCCCAGGGTAGGAGC‑GGGT‑TTAAACGCGAAAGGGCCCGATCAGGGACAACAAagaccaccc > 1:3001110/1‑150 (MQ=255) aGGATGAGGTTGTGTTGCTTGTTTTCTCCAGTCATGAACCGGGTTGGCACCTTCGGGGTTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCGTGTTTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCt < 2:449784/150‑1 (MQ=255) ggATGTCGTTGTGTTGATTGTTTTCTCCATTAATGAACGGGTTTGGCACCTTGGCGGTTAAACCCGATCCTACATGTATCGCGTTTCCCTGTGTAGGTGG‑GGTT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCtt < 1:6930068/150‑1 (MQ=255) 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ggagcgggtTTACCCGCTCCTACAcagggatacgcgatacatgtaggagcgggtttacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgactggagaaaacatgcaacacaacgtcatcctggtcctgctcgacggcctcaactatcaggtcgcc > 1:8218729‑M1/4‑24 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAg > 2:3438338/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAcagggatacgcgatacatgtaggagcgggtttacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgactggagaaaacatgcaacacaacgtcatcctggtcctgctcgacggcctcaactatcaggtcgcccacca > 2:881230‑M1/1‑19 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACATGTAGCGCGTACCCATGTGTAGGAGC‑GGTT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGt < 1:1068206/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTgg > 1:8091898/1‑150 (MQ=255) 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aaaCCCGCTCCTACAcagggatacgcgatacatgtaggagcgggtttacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgactggagaaaacatgcaacacaacgtcatcctggtcctgctcgacggcctcaactatcaggtcgcccaccatgcg > 2:3877255‑M1/1‑15 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCtt > 1:8269091/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACATGTACCGCGTAGCCCTGTGTAGGCGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTc < 1:6914416/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTcc > 1:2135605/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTcc > 1:1754923/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCGGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTcc > 2:4599631/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACTTTTATCGCTTATCCGTGTTTAGGAGC‑GGTT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTccc < 1:6352433/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGtgtaggagcgggtttacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgactggagaaaacat > 2:6768032‑M2/1‑28 (MQ=255) ccGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAg > 2:1393822/1‑140 (MQ=255) cGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGtgtaggagcgggtttacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgactggagaaaacatgcaacacaacgtcatcctggtcctgctcgacggcctcaactatcaggtcgcccaccatgcgatggg < 1:4528556‑M2/150‑124 (MQ=255) gCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTCCCAg > 2:6039004/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTCCCAg > 1:7481004/1‑150 (MQ=255) caccaacaccgggatccgcgatccttgttggagcgggttgacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgactggagaaaacatgcaacacaacgtcatcctggtcctgctcgacggcctcaactatcaggtcgcccaccatgcgatgggcc < 1:2900925‑M1/145‑143 (MQ=255) tCCTACAcagggatacgcgatacatgtaggagcgggtttacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgactggagaaaacatgcaacacaacgtcatcctggtcctgctcgacggcctcaactatcaggtcgcccaccatgcgatgggcca > 2:1976222‑M1/1‑7 (MQ=255) tCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTCCCAgga > 2:5273421/1‑149 (MQ=255) cTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCCTCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTCCCAGGCtt > 2:3884180/1‑150 (MQ=255) cTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTCCCAGGCtt > 2:1608782/1‑150 (MQ=255) tACAccgggatacgcgatacatgtaggagcggttttacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgactggagaaaacatgcaacacaacgtcatcctggtcctgctcgacggcctcaactatcaggtcgcccaccatgcgatgggccacct < 2:6723026‑M1/150‑147 (MQ=255) tACAcagggatacgcgatacatgtaggagcgggtttacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgactggagaaaacatgc < 2:6922197‑M1/80‑77 (MQ=255) aCATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCCCTACAAAGCCCCGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTCCCAGGCTTCg > 2:8994967/1‑150 (MQ=255) aCATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTCCCAGGCTTCg > 1:5417388/1‑150 (MQ=255) aCATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTCCCAGGCTTCg > 2:4341331/1‑150 (MQ=255) cacagggatacgcgatacatgtaggagcgggtttacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgactggagaaaacatgcaacacaacgtcatcctggtcctgctcgacggcctcaactatcaggtcgcccaccatgcgatgggccacctgc > 2:4820247‑M1/1‑2 (MQ=255) acagggatacgcgatacatgtaggagcgggtttacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgactggagaaaacatgcaacacaacgtcatcctggtcctgctcgacggcctcaactatcaggtcgcccaccatgcgatgggccacctgca > 2:159080‑M1/1‑1 (MQ=255) acagggatacgcgatacatgtaggagcgggtttacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgactggagaaaacatgcaacacaacgtcatcctggtcctgctcgacggcctcaactatcaggtcgcccaccatgcgatgggccacctgca > 1:1247882‑M1/1‑1 (MQ=255) aTGTATCGCGTATCCCTGtgtaggagcgggtttacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgagtggagaaaacatgcaacacaacgtcatcctggtcctgctcgacggcctcaactatcaggtcgcccaccatgcgatgggccacctgca < 1:1380889‑M2/150‑133 (MQ=255) aTGTATCGCGTATCCCTGtgtaggagcgggtttacccgcgaaggtgccaacgcggttcatgactggagaaaacatgcaacacaacgtcatcctggtcctgctcgacggcctcaactatcaggtcgcccaccatgcgatgggccacctgca < 1:1380665‑M2/150‑133 (MQ=255) aTGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTCCCAGGCTTCGGc > 2:5264961/1‑150 (MQ=255) aTGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCAGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTCCCAGGCTTCGGc > 1:3862811/1‑150 (MQ=255) | TCGGCCTCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGC‑GGGT‑TTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTTCGAGGTGGCTTCCCAGGCTTCGGC > NC_002947/1925619‑1925917 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |