| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 1970763 = | 213 (0.770) | 23 (0.100) | 13/236 | NT | 10.9% | intergenic (+14/‑252) | mtnA/PP_mr25 | methylthioribose‑1‑phosphate isomerase/gyrA regulatory region |
| ? | NC_002947 | 1970865 = | 195 (0.830) | intergenic (+116/‑150) | mtnA/PP_mr25 | methylthioribose‑1‑phosphate isomerase/gyrA regulatory region | |||||
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
TGTCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAACTGCC > NC_002947/1970614‑1970911 | tgtCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTc > 2:505195/1‑150 (MQ=255) tCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCAc > 2:751851/1‑150 (MQ=255) aatgagttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCAc < 2:3305681‑M1/3‑1 (MQ=255) ggTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGc < 2:3618981/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGc < 2:8375838/150‑1 (MQ=255) gttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgctggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGcc < 1:7967433‑M1/8‑1 (MQ=255) gttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGcc < 2:694660‑M1/8‑1 (MQ=255) ccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTcg < 2:2697140‑M1/14‑1 (MQ=255) catggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTcgc > 1:1772055‑M1/136‑150 (MQ=255) aCCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGTCCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTcgc < 2:6772668/150‑1 (MQ=255) aCCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTcgc < 2:4451601/150‑1 (MQ=255) aCCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTcgc < 2:2131514/150‑1 (MQ=255) atggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTcgcg > 2:5193683‑M1/135‑150 (MQ=255) 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tGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTAGCGGGGTTGCCCGCTCCCACTGGGCTATAGCATTGCCTTAGGGCCGTTGTGAACCACTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGCAGAGGCCGGTGCAGGCAATa > 1:5753099/1‑150 (MQ=255) attGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCAGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCCGGCAATACaa > 2:8448652/2‑150 (MQ=255) gCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACaaaaa < 2:7423194/150‑1 (MQ=255) ccGCAAGCGCCTGCACTGTTTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTCTGGGCGGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAAc < 1:9089456/150‑1 (MQ=37) cAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCGTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATGTCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAg < 2:5498977/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGGGTGCCCGCTCCCACCGGGGTATCGCATGGCCGTAGGGCCGTGGGGCACCGGGGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGGGCCGGCAATACACAAACCAGGtt > 1:3371074/1‑150 (MQ=255) gcCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGGGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTc > 2:4176051/1‑150 (MQ=255) cTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTCGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCaa < 2:8713519/150‑1 (MQ=255) cTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCaa < 2:4333136/150‑1 (MQ=255) cTGCACTGATTGTGTATCGCCTCCCCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCaa < 2:6526157/150‑1 (MQ=255) aCTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGCCCACTGGGATATCGCATGGCCGTAGGGCCGTGGGGTACCGGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAgcgc > 1:4473890/1‑150 (MQ=38) tGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAAACAGGTTTAAAGCGCgg > 1:2241781/1‑150 (MQ=255) gATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATAGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGGGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACACAAACCAGGTTTCAAGCGCGGc > 2:8085634/1‑150 (MQ=255) ttttTACCGCCTCCCCGGCCTCTTCGGGGGCTGGCCCGCTCCCCCGGGTATATCGCCTGGCCTTGGGGCGGTGGTGAACCGGGGGGGGCGGGCGACCCCGCTAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTga < 1:2785137/150‑1 (MQ=255) tttGTATCGCCTCCCCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCGGGGATATCGCAGGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTga < 2:4885378/150‑1 (MQ=255) tGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTgaga < 2:944162/150‑1 (MQ=255) tGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTgaga < 1:3731740/150‑1 (MQ=255) tGTATCGCCACACCGGCCTCTACGCGGGCTGGCCCGCTCCCACTGGTTTTTCGCATGGCCTGAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGGGGGCGAGCCCGCTAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTgaga < 1:3573621/150‑1 (MQ=255) gTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGAc < 2:1433075/150‑1 (MQ=255) cGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCAGGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAAc < 2:4737890/150‑1 (MQ=255) cTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATAGCATTGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCAGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAACTGc > 2:4017687/1‑150 (MQ=255) | TGTCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAACTGCC > NC_002947/1970614‑1970911 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |