| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 2273163 = | 148 (0.540) | 17 (0.070) | 12/244 | NT | 11.2% | intergenic (+19/‑201) | PP_2002/PP_t31 | oxidoreductase/tRNA‑Val |
| ? | NC_002947 | 2273245 = | 140 (0.580) | intergenic (+101/‑119) | PP_2002/PP_t31 | oxidoreductase/tRNA‑Val | |||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
GGGCAGGGTAGGGACCGTGGAAGATGTCGCGGCCATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAACGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCTTTTTGAAAAAAATTCAATGGGGCTATTGACTTAGCTTCGCCA > NC_002947/2273015‑2273310 | agatgctctcccggctgagctaatcaccctcgcgatgttgcttgttgcgtttgcttcgctgaggccgcgaaatttacgcaggtggcgaagctaagtcaatagccccattgaatttttttcaaaaaggcaacgtgatgtgattgcctgtGc < 1:6696190‑M1/2‑1 (MQ=255) cAGGGTAGGGACCGTGGAAGATGTCGCGGCCATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCgg < 1:3895298/150‑1 (MQ=255) tcccggctgagctactcaccctcgcgaggttgcttgttgcgtttgcttcgctgaggccgcgaaatttacgcaggtggcgaagctaagtcaatagccccattgaatttttttcaaaaaggcaacgtgatgtgattgcctgtGCCGGCctct > 2:5969362‑M1/141‑150 (MQ=255) tcccggctgagctaatcaccctcgcgatgttgcttgttgcgtttgcttcgctgaggccgcgaaatttacgcgggtgtcgaagctaagtcaatagccccattgaatttttttcaaaaaggcaaagtgaagtcattgccagtGCCGGCctct < 1:7364661‑M1/10‑1 (MQ=255) tcccggctgagctaatcaccctcgcgatgttgcttgttgcgtttgcttcgctgaggccgcgaaatttacgcaggtggcgaagctaagtcaatagccccattgaatttttttcaaaaaggcaacgtgatgtgattgcctgtGCCGGCctct < 1:3617069‑M1/10‑1 (MQ=255) tAGGGACCGTGGAAGATGTCGCGGCCATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCctct > 2:2713031/1‑150 (MQ=255) tAGGGACCGTGGAAGATGTCGCGGCCATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCcact > 2:3028269/1‑150 (MQ=255) ggctgagctaatcaccctcgcgatgttgcttgttgcgtttgcttcgctgaggccgcgaaatttacgcaggtggcgaagctaagtcaatagccccattgaatttttttcaaaaaggcaacgtgatgtgattgcctgtGCCGGCCTCTTcgc > 2:778475‑M1/137‑150 (MQ=255) 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2:877778/150‑1 (MQ=255) ccGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAACGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGCggg > 1:3564319/1‑101 (MQ=255) ccGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACAACGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCttttt < 2:5658764/150‑1 (MQ=255) cGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAACGGTTAATGTCCGACGGTAGGAGCGGGTGTACCCGCGCCGAGGCCGGCACAGGCCATCACATCACGGTGCCTTTTTg > 2:7024208/1‑150 (MQ=39) cGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCCCTCCGACAACGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACAGCCCGTTGCCtttttt > 2:2405971/1‑149 (MQ=255) gCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAACGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCTTTTTGa < 2:2886027/150‑1 (MQ=255) tttttttcaaaaaggcaacgtgatgtgattgcctgtGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAACGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGc < 1:4832497‑M1/58‑1 (MQ=255) tttttttcaaaaaggcaacgtgatgtgattgcctgtGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAACGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGc > 2:4832497‑M1/37‑94 (MQ=255) aGATGATCTTTACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACACCGGTTAATGTCCGACTGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCTTTTTGaaaa < 2:2748916/150‑1 (MQ=255) tataCCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAACGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCTTTTTGAAAAAAATTaaa > 2:8389792/1‑150 (MQ=255) tataCCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTAGCGGCTAAACCCCCTCCTACAACGGTTAATTTCCGACTGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCAAGTTTCCTTTTTTAAAAAAATTCaa > 2:2334938/1‑150 (MQ=38) cTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTAGCGGCTAAACCCGCTACTACAAAGGTTAATGTGCGAGTGTTGGTGCGGGTTTGACCCCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATAAAGTTTCCATTTTGTCAAAAATTAAAAGGGGGTaattac > 2:853865/1‑145 (MQ=255) cTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTAGCGGCTAAAACCGCTACTACAACGGTTAATGTCCGACGGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCTTTTTGAAAAAAATTCAATGGGGCTATTGAc > 2:4639388/1‑150 (MQ=39) gTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAACGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCTTTTTGAAAAAAATTCAATGGGGCTATTGACTTa < 2:3137226/150‑1 (MQ=255) accggcgcGGGCCCCTTCGGGGCTAAACCCGCCCCTAAAACTGTTATTGCCCTACTGTTGGTGCGGTTTTACCGGCGATGTGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCTTTTTGAAAAAAATTCAATGGGGCTATTGACTTAGCTTc < 1:813853/146‑1 (MQ=255) gcgcCGGCCTCTGGGCGGCTACCCCCGCTCCACCACGGGTTCTTGGCCGAGTGTCGGTGGGGGTTTCCCCGCGAAGCGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCTTTTTGAAAAAAATTCAATGGGGCTATTGACTTAGCTTCGCCa < 1:8693245/150‑1 (MQ=255) | GGGCAGGGTAGGGACCGTGGAAGATGTCGCGGCCATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAACGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCTTTTTGAAAAAAATTCAATGGGGCTATTGACTTAGCTTCGCCA > NC_002947/2273015‑2273310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |