| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
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aGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCC‑GG‑AATCACCCTTTGGGGTGAG‑C‑GGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GG‑TGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGAcgcaccgcac > 1:7703530/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCC‑GG‑AATCACCCTTTGGGGTGAG‑C‑GGACACAGCCCTTGCCCGGCACACCCCAAAGGGTGATTCC‑GG‑TGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACt < 2:5423165/150‑1 (MQ=255) tGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCC‑GG‑AATCACCCTTTGGGGTGAG‑C‑GGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GG‑TGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGcgtc < 2:8778378/150‑4 (MQ=255) tCCCACACCCTGCAGGCACCC‑GG‑AATCACCCTTTGGGGTGAG‑C‑GGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GG‑TGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGaa > 2:1040976/1‑150 (MQ=255) ccACACCCTGCAGGCACCC‑GG‑AATCACCCTTTGGGGTGAG‑C‑GGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GG‑TGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGaaaa > 1:6058763/1‑150 (MQ=255) 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CC‑GG‑AATCACCCTTTGGGGTGAG‑C‑GGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GG‑TGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGa < 1:2633903‑M1/150‑1 (MQ=255) CC‑GG‑AATCACCCTTTGGGGTGAG‑C‑GGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GG‑TGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGa > 2:4703955‑M1/1‑150 (MQ=255) | GTTGTTGTATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCC‑GG‑AATCACCCTTTGGGGTGAG‑C‑GGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GG‑TGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGA > NC_002947/2956449‑2956746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |