| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3930305 = | 154 (0.560) | 14 (0.060) | 11/242 | NT | 10.8% | intergenic (+15/‑125) | peaE/PP_3464 | phenylacetaldehyde dehydrogenase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 3930386 = | 96 (0.400) | intergenic (+96/‑44) | peaE/PP_3464 | phenylacetaldehyde dehydrogenase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
TGGGTCAACTGCCACAGCGCGCTGGACCCGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACA > NC_002947/3930156‑3930453 | gaggtcggcgttgagggtggtgccatcgtggttgtacagctcgtaggcttggctggcgggggcggttaacagcagggccaatgtgcaggcgagtgtgtgcctcatggggttgctccatggtttttattgttgtttttttgttgcctgtgc > 2:6575681‑M1/150‑150 (MQ=255) tcggcgttgagggtggtgccatcgtggttgtacagctcgtaggcttggctggcgggggaggttaacagcagggccaatgtgcaggcgagtgtgtgcctcatggggttgctccatggtttttattgttgtttttttgttgcctgtgCCGGc > 1:6784402‑M1/146‑150 (MQ=255) tCAACTGCCACAGCGCGCTGGACCCGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGc < 1:1128993/150‑1 (MQ=255) tCAACTGCCACAGCGCGCTGGACCCGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGc < 1:5431895/150‑1 (MQ=255) tCAACTGCCACAGCGCGCTGGACCCGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGc > 2:6560608/1‑150 (MQ=255) tCAACTGCCACAGCGCGCTGGACCCGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGc < 1:1127970/150‑1 (MQ=255) cggcgttgagggtggtgccatcgtggttgtacagctcgtaggcttggctggcgggggcggttaacagcagggccaatgtgcaggcgagtgtgtgcctcatggggttgctccatggtttttattgttgtttttttgttgcctgtgCCGGcc < 1:6339399‑M1/6‑1 (MQ=255) cAACTGCCACAGCGCGCTGGACCCGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTGCCTGTGCCGGcc > 1:3269540/1‑150 (MQ=255) aCTGCCACAGCGCGCTGGACCCGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCctc < 2:3162217/150‑1 (MQ=255) agggtggtgccatcgtggttgtacagctcgtaggcttggctggcgggggcggttaacagcagggccaatgtgcaggcgagtgtgtgcctcatggggttgctccatggtttttattgttgtttttttgttgcctgtgCCGGCCTCTTcgcg > 1:3679055‑M1/137‑150 (MQ=255) gggtggtgccatcgtggttgtacagctcgtaggcttggctggcgggggcggttaacagcagggccaatgtgcaggcgagtgtgtgcctcatggggttgctccatggtttttattgttgtttttttgttgcctgtgCCGGCCTCTTCGCgg > 2:6339399‑M1/136‑150 (MQ=255) gggtggtgccatcgtggttgtacagctcgtaggcttggctggcgggggcggttaacagcagggccaatgtgcaggcgagtgtgtgcctcatggggttgctccatggtttttattgttgtttttttgttgcctgtgCCGGCCTCTTCGCgg > 2:665216‑M1/136‑150 (MQ=255) gggtggtgccatcgtggttgtacagctcgtaggcttggctggcgggggcggttaacagcagggccaatgtgcaggcgagtgtgtgcctcatggggttgctccatggtttttattgttgtttttttgttgcctgtgCCGGCCTCTTCGCgg > 2:6975981‑M1/136‑150 (MQ=255) gggtggtgccatcgtggttgtacagctcgtaggcttggctggcgggggcggttaacagcagggccaatgtgcaggcgagtgtgtgcctcatggggttgctccatggtttttattgttgtttttttgttgcctgtgCCGGCCTCTTCGCgg > 2:772797‑M1/136‑150 (MQ=255) caGCGCGCTGGACCCGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCgg < 2:1872286/150‑1 (MQ=255) cgcgcTGGACCCGGCGCTGCCGTGTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTAGCGGGTa > 1:604506/1‑150 (MQ=255) gcTGGACCCGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 2:1484951/150‑1 (MQ=255) gcTGGACCCGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:2794496/150‑1 (MQ=255) 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aCCCGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt < 2:8406313/150‑1 (MQ=255) aCCCGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt < 2:3396129/150‑1 (MQ=255) cccGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 2:6794090/150‑1 (MQ=255) cccGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:8111255/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 2:7220129/150‑1 (MQ=255) 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gCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAg < 1:4974019/150‑1 (MQ=255) gCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAg < 1:400238/150‑1 (MQ=255) ccGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAgg < 2:8666806/150‑1 (MQ=255) cGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGt < 2:2234853/150‑1 (MQ=255) ggtggCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATcac < 1:2944555/150‑1 (MQ=255) 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> 2:5093688/1‑150 (MQ=255) aaaTCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga < 1:5944939/113‑1 (MQ=255) aTCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCGCCACCCGGGATCCCAAGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGCAGAGGCCGGCCCAGGCAACAAAAAAACACCAAGAAAAACCAt > 2:4818103/1‑150 (MQ=37) tCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATg < 1:6034988/150‑1 (MQ=255) ggTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGa < 2:2971823/150‑1 (MQ=255) gtgtTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAg > 2:4338908/1‑150 (MQ=255) tGATAAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAAc < 1:7493114/150‑1 (MQ=255) gATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATAGatcggac > 2:8104620/1‑144 (MQ=255) tGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGca > 2:8201803/1‑150 (MQ=255) tGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGGATCACAAGCCCGGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGCAGAGGCCGGCACAGGCCACAAAAAAAAAACAATAAAAACCAAGGAGCAACCCCATGAGGca > 1:4478334/1‑150 (MQ=37) taTCCTTTTTCCGGTACCGTCCTCTTCGCGTGTAACCCGGCTCCTACACCTGGTTTCACATGGCCTGTTGTAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGcac < 2:7983530/149‑1 (MQ=38) 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TGGGTCAACTGCCACAGCGCGCTGGACCCGGCGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACA > NC_002947/3930156‑3930453 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |