New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5423135 | 229 (0.830) | 14 (0.050) | 4/256 | NT | 6.0% | intergenic (‑67/+98) | PP_4760/PP_4761 | alcohol dehydrogenase/haloacid dehalogenase‑like family hydrolase |
? | NC_002947 | = 5423197 | 227 (0.890) | intergenic (‑129/+36) | PP_4760/PP_4761 | alcohol dehydrogenase/haloacid dehalogenase‑like family hydrolase |
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TGGGGGGCCTGGGCCTCGCAGGTGCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCTTCAACGCCCGGCAATCCGCCGCATGCCAATCCACC > NC_002947/5422986‑5423284 | tGGGGGGCCTGGGCCTCGCAGGTGCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCA > 2:5659796‑M1/1‑150 (MQ=255) ggcctgggcctCGCAGGTGCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCAcgccc < 1:2873954/150‑1 (MQ=255) tgggcctCGCAGGTGCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACgcccgccc > 2:7996358/1‑150 (MQ=255) ggcctCGCAGGTGCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCGtgcccgcgaaa < 2:5872571‑M1/150‑12 (MQ=255) cctCGCAGGTGCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCGtgcccgcgaaagg < 2:2697430‑M1/150‑14 (MQ=255) cctCGCAGGTGCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCcac > 2:4292806/1‑150 (MQ=255) tCGCAGGTGCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAg > 2:5884409/1‑150 (MQ=255) tCGCAGGTGCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAg > 2:4460477/1‑150 (MQ=255) cGCAGGTGCCGACATCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCGGTATCAGAGCAAAGAATGTGGTTGAGCATAGACAGATCCTGCCGTTTCGCGGGCACGGCCGCCCCCACAgt < 2:540397/150‑2 (MQ=255) gCAGGTGCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAggg < 2:4073441/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAggg < 1:3116273/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAgggg > 1:4863571/1‑150 (MQ=255) gCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGcacca > 2:1731560/1‑150 (MQ=255) 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gccgccgccGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCaa < 2:3351884/150‑1 (MQ=255) ccgccgccgGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAAt > 1:8675787/1‑150 (MQ=255) gccgccgGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATAc < 2:5996217/150‑1 (MQ=255) gccgccgGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATAc < 2:1393482/150‑1 (MQ=255) ccgccgGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATAcc < 2:1552094/150‑1 (MQ=255) cgccgGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCCCCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCt > 2:1155246/1‑150 (MQ=255) ccgGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCtgt < 1:5699753/150‑1 (MQ=255) ccgGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCtgt < 1:1112461/150‑1 (MQ=255) ccgGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCtgt < 1:4197401/150‑1 (MQ=255) ccgGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCtgt < 2:5250885/150‑1 (MQ=255) ccgGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCtgt < 2:5778992/150‑1 (MQ=255) tGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGc < 2:1065221/150‑1 (MQ=255) tACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCAtgcccgcttccacaggtattgcgcacgtctcggggcctgtggtgcccctgtgggggcgg < 2:8574735‑M1/150‑60 (MQ=255) gATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCAtgc > 2:4539736‑M2/1‑147 (MQ=255) tGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCAtgccc > 1:7499625‑M2/1‑145 (MQ=255) 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gggTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCAcc < 1:2084009/150‑1 (MQ=255) gggTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCAcc < 2:6354953/150‑1 (MQ=255) gTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCtt > 2:6128853/1‑150 (MQ=255) tGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCTTCa < 2:7686734/150‑1 (MQ=255) gAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGGGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCAAGCCCGCGCAGAGGCCCGCATTGCCCACACACGCGTCACCCCAGCATCACCGTCaa > 1:6205637/1‑150 (MQ=39) aGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCATTACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCTTCAAc < 1:6232796/150‑1 (MQ=255) aGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCTTCAAc < 2:3318228/150‑1 (MQ=255) cATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCTTCAACGc < 1:5978400/150‑1 (MQ=255) aTAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCACTACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCCTCACCTTCAACGcc > 1:6416144/1‑150 (MQ=255) aTAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTACGCCCAGCATCACCTTCAACGcc > 2:3834312/1‑150 (MQ=255) aTAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGAAGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCTTCAACGcc > 1:4389827/1‑150 (MQ=255) tAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCTTCAACGccc > 2:8306300/1‑150 (MQ=255) aCAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCAtgcccgc < 1:1138483‑M2/93‑8 (MQ=255) aCAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCAtgcccgc > 2:1138464‑M2/1‑86 (MQ=255) cAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCTTCAACGCCCGGCa > 2:5490138/1‑150 (MQ=255) tCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGcc > 2:4680108/1‑122 (MQ=255) tCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGcc < 1:4680108/122‑1 (MQ=255) ccTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCATCAACGCCCGGCAATCCGCCGCa > 1:8478106/1‑150 (MQ=255) tttCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCTTCAACGCCCGGCAATCCGCCGCATg > 2:7413003/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCAtgcccgcttccacaggtattgcgcacgtctcggggcctgtggtgcccctgtgggggcgggcgtgcccgcgaaagggccggatctgtctatgctcaaccccattctttgctctgatacggagacccacccaggagatcgca > 1:5485474‑M1/1‑10 (MQ=255) ggggcgGGCGTGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCTTCAACGCCCGGCAATCCGCCGCATGc > 2:6967536/4‑150 (MQ=255) tCGCGGGCAtgcccgcttccacaggtattgcgcacgtctcggggcctgtggtgcccctgtgggggcgggcgtgcccgcgaaagggccggatctgtctatgctcaaccccattctttgctctgatacggagacccacccatgagcagcaag < 2:3216929‑M1/150‑142 (MQ=255) tCGCGGGCAtgcccgcttccacaggtattgcgcacgtctcggggcctgtggtgcccctgtgggggcgggcgtgcccgcgaaagggccggatctgtctatgctcaaccccattctttgctctgatacggagacccacccatgagcagcaag < 2:7833116‑M1/150‑142 (MQ=255) gcgGGCAtgcccgcttccacaggtattgcgcacgtctcggggcctgtggtgcccctgtgggggcgggcgtgcccgcgaaagggccggatctgt < 1:1138464‑M1/93‑87 (MQ=255) ggCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCAtgcccgcgaaagggccggatctgtctatgctcaaccccattctttgctctgatacggagacccacccatgagcagcaaggccat < 1:6531557‑M2/150‑85 (MQ=255) gCAtgcccgcttccaccggtattgcgcacgtctcggggcctgtggtgcccctgtgggggcgggcgtgcccgcgaaagggccggatctgtctatgctcaaccccattctttgctctgatacggagacccacccatgagcagcaaggccatc < 2:5528824‑M1/150‑148 (MQ=255) cACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCTTCAACGCCCGGCAATCCGCCGCATGCCAATccac < 1:7660467/150‑1 (MQ=255) | TGGGGGGCCTGGGCCTCGCAGGTGCCGACCTCGACCTTGTCGTAGCCGCCGCCGGGTTGTACGTAGATGGCCTTGCTGCTCATGGGTGGGTCTCCGTATCAGAGCAAAGAATGGGGTTGAGCATAGACAGATCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGCACCACAGGCCCCGAGACGTGCGCAATACCTGTGGAAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCATTGCCAACACACGCGTCAGCCCAGCATCACCTTCAACGCCCGGCAATCCGCCGCATGCCAATCCACC > NC_002947/5422986‑5423284 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |