| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5515210 = | 129 (0.470) | 13 (0.050) | 8/274 | NT | 7.3% | intergenic (+18/‑136) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 5515322 = | 204 (0.750) | intergenic (+130/‑24) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
CATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGA > NC_002947/5515061‑5515359 | cATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTgg < 2:5849937/150‑1 (MQ=255) tGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCG > 1:942009‑M1/1‑150 (MQ=255) tGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCG > 1:1206331‑M1/1‑150 (MQ=255) cATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCT < 1:7388829‑M1/150‑1 (MQ=255) aTGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTG > 1:8434062‑M1/1‑150 (MQ=255) tcgGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTC > 2:8352940‑M1/1‑150 (MQ=255) caTTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCACGTCGCGG > 1:630197‑M1/1‑150 (MQ=255) ttGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT < 1:4052412‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AAc > 2:5491762/1‑150 (MQ=255) ccGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCGTGGCGGGgtac > 1:4628305‑M1/1‑146 (MQ=255) ccGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCGCGTCGCGGGggac > 1:4627963‑M1/1‑146 (MQ=255) gACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTGGCGGGggaccc > 1:3334956‑M1/1‑144 (MQ=255) gACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AAccc < 2:2788437/150‑1 (MQ=255) cATGTGACCGTGCTGCACCAGTGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTTGTCGAGTTGTATCTTGGCCGCTGACCTGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGACTCTTCGCGGGT‑AACCCCGt < 2:8084239/150‑1 (MQ=255) cATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGt < 2:2892422/150‑1 (MQ=255) tgtgACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AAacccgctc < 2:6697722‑M1/150‑9 (MQ=255) tgtgACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTc < 1:8982105/150‑1 (MQ=255) tgtgACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTc < 2:552370/150‑1 (MQ=255) tgtgACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTc < 2:9011156/150‑1 (MQ=255) gtgACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCGCTTCGCGGGTGAACCCCGtga > 1:2244361/1‑148 (MQ=255) tgACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCt > 2:8325276/1‑150 (MQ=255) tgACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCt < 1:543774/150‑1 (MQ=255) ttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAg < 2:2321285‑M1/42‑1 (MQ=255) 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cAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAAt > 2:1383695/1‑150 (MQ=255) cAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCGCTTCGCGGGT‑AACCCCCGTCCTCCAGTGGGCGTCAt > 2:397213/1‑150 (MQ=255) aGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATg < 2:2448721/150‑1 (MQ=255) gtgtGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATgg < 2:7414893/150‑1 (MQ=255) gtgCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATgggg < 1:7522186/150‑1 (MQ=255) tgCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGG‑TACCCCGTTCCGACAGTGGGCGGAATGCCATGGGGc > 1:7246739/1‑150 (MQ=255) tgCGGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGc < 1:8477312/150‑1 (MQ=255) tGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGt > 2:630670/1‑150 (MQ=255) cGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCCGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTcc < 2:7160174/150‑1 (MQ=255) cGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTcc < 2:4240814/150‑1 (MQ=255) 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tGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGGTATTCCATTGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGGTTAGCCGCGAAGAGGCCGGGCCAGGCACCGccacccgt > 2:6530663/1‑143 (MQ=37) gggCCGCTGACCGGTTTTTAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTGTTCGCGGGT‑AACCCCTTTCCTACTGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCttt < 2:3375735/150‑1 (MQ=39) gCCGCTGCCCGTATTTGATTGTGTGGCGCGTGGGCCGGCCTCTGCGCGGGT‑ACCCCCGTTCCTACAGTGGGCGTACGGCCAGGGGGCGGGCCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCa < 2:335297/150‑1 (MQ=25) gCCGCTGCCCGGTTTTGAATTTTGGGGGCCTGTGCCGGCCTCTTGGGGGGT‑AACCCGGTTCCTACAGTGGGCGTATTGCCTTGGGGCGGTTCCCGTGGTTGGAGGGGGTTTACCGGCGATGCGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCa < 2:875112/150‑1 (MQ=255) ccGCTGACCTTATTTTAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCACTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAg < 2:3844682/150‑1 (MQ=39) ccGCTGACCGGATTTGAATTTTGGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCAGGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAg < 2:7262173/150‑1 (MQ=255) cGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTGTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGATCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTAAGGAACtatc > 2:7354553/1‑150 (MQ=255) cGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGGTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCAACCCATTAAGGAACtctc > 2:6120226/1‑150 (MQ=255) cGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCATCGCGGGT‑ACCACCCGTACTAAAGTGGGCGTAAAGCCATGGGGCGGTTACCGTAGTAGGAGCCGGGTTTCCCGCGCAGTGGCCCGCACAGGCCCAACATCCCTATCAGGAAAtctc > 2:6546631/1‑150 (MQ=255) cGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCACTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAAAGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTATGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACtctc > 2:9081534/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) tGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTGGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACTGTGGGCGTATTGCCATGGGGCGGTTCCCGTCTTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATc < 2:1033717/150‑1 (MQ=39) | CATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGA > NC_002947/5515061‑5515359 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |