New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6073600 = | 364 (1.320) | 5 (0.020) | 3/264 | NT | 1.4% | intergenic (‑45/+57) | phoU/pstB‑II | phosphate transport‑associated protein/phosphate ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 6073649 = | 352 (1.340) | intergenic (‑94/+8) | phoU/pstB‑II | phosphate transport‑associated protein/phosphate ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 416 total aligned reads displayed.
CTTTTCCACCAGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCC > NC_002947/6073451‑6073749 | ttttCCACCAGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcg > 2:7845595/1‑150 (MQ=255) tttCCACCAGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcgc > 2:1037538/1‑150 (MQ=255) tttCCACCAGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcgc > 1:8372686/1‑150 (MQ=255) cagcaagcggcgcgtgtttcggattacaccgcgttcatgtacatgggcaaactggtcgaattcggggataccgataccctgttcaccaacccggcgaagaagcagaccgaagactacatcaccggtcgctacggctaagcgccgctcgcg < 2:7290533‑M1/4‑1 (MQ=255) caccaGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAac > 2:8790324/1‑150 (MQ=255) caccaGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAac > 2:5233994/1‑150 (MQ=255) accaGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcgc < 2:6169844/145‑1 (MQ=255) accaGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaca > 2:4528/1‑150 (MQ=255) accaGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaca > 1:6545979/1‑150 (MQ=255) accaGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaca > 1:2931501/1‑150 (MQ=255) gcccgcccATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCgg > 2:7451569/1‑150 (MQ=255) gcccgcccATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCgg > 2:3233906/1‑150 (MQ=255) cgcccATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCaa < 2:755528/150‑1 (MQ=255) gcccATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAAc > 1:2361053/1‑150 (MQ=255) gcccATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAAc > 2:1637150/1‑150 (MQ=255) ccATTGACATCAGTTGTCTTCGAACCTCTTCGAGCTCGGCGTTTAACTGCTTGGAAATGTGATGTGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTACTTTGGTAGCGAGGCCCTTTAGGATAGTGTTCACCCGCGAACAAAGGCAAcac > 2:1861206/1‑148 (MQ=255) ccATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCGTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAAccc > 2:7005094/1‑150 (MQ=255) tGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCgg > 2:2183792/1‑150 (MQ=255) 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caaactggtcgaattcggggataccgataccctgttcaccaacccggcgaagaagcagaccgaagactacatcaccggtcgctacggctaagcgccgctCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAg > 1:4913930‑M1/100‑150 (MQ=255) cTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAgc > 1:5043574/1‑150 (MQ=255) tCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAgcg < 1:5620217/150‑1 (MQ=255) cGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAgcgg < 1:7046447/150‑1 (MQ=255) cGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAgcgg < 2:4061915/150‑1 (MQ=255) 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cTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAAc < 2:8456655/150‑1 (MQ=255) tttGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACa > 2:3500367/1‑150 (MQ=255) ttGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCACCCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGAGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAg < 1:4751001/150‑1 (MQ=255) tGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCTACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAgg < 1:5539876/150‑1 (MQ=255) tGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAgg < 1:2726798/150‑1 (MQ=255) tGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAgg < 2:3014253/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGTCAGTCACCACGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTAGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtatcg < 1:8935532/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtatcg < 1:1453832/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtatcg < 1:7216269/150‑1 (MQ=255) cccTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtatcggtatc > 1:7362279/1‑150 (MQ=255) cccTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtatcggtatc > 2:5480537/1‑150 (MQ=255) ccTTTAGTAGCGGTTTAACCCGCGAACACCGGAAACCCCGTTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCTAGCGGCGCTTAGCCTTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGTTATCGGTATcc < 1:1861206/150‑1 (MQ=255) ccTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATcc < 1:248641/150‑1 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATcccc < 1:3492627/150‑1 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATcccc > 1:4152456/1‑150 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATcccc < 1:5184303/150‑1 (MQ=255) aGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGaa < 1:804452/150‑1 (MQ=255) cGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGa < 2:2361053/150‑1 (MQ=255) gggTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGAc < 1:4528/150‑1 (MQ=255) gggTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCCTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGaa < 1:7931890/144‑1 (MQ=255) ggTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGAcc > 2:1967875/1‑150 (MQ=255) gTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCa < 1:7821322/150‑1 (MQ=255) ttCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAg < 1:8582049/150‑1 (MQ=255) tCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGt > 1:3444078/1‑150 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGa > 2:2668157/1‑141 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGc > 1:4036358/1‑150 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGc > 2:4340697/1‑150 (MQ=255) | CTTTTCCACCAGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCC > NC_002947/6073451‑6073749 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |