New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 478293 | 91 (0.330) | 12 (0.060) | 8/216 | NT | 12.8% | intergenic (+38/+72) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
? | NC_002947 | = 478328 | 92 (0.430) | intergenic (+73/+37) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
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GCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCG > NC_002947/478180‑478477 | ggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGt > 1:1417064‑M1/84‑150 (MQ=255) aGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgta > 1:3728853‑M2/1‑147 (MQ=255) gcgcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCGgtaggagc < 2:7364251‑M2/150‑9 (MQ=255) tcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcccgcttgagcctgtatCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg > 2:5720803‑M1/76‑150 (MQ=255) ggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg > 1:1071142‑M1/76‑150 (MQ=255) ggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg > 1:5904286‑M1/76‑150 (MQ=255) ggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg > 1:5904152‑M1/76‑150 (MQ=255) ggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg > 1:3927978‑M1/76‑150 (MQ=255) 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gtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCggg > 1:5148644‑M1/75‑150 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGGTAAA‑CCC‑CGCCAACCAACGGCGGAGCCCAACCACAGAAGTGTTCCCCCCGGAGGAGCcgg > 1:5590602/1‑150 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggg > 1:6830848‑M2/1‑139 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggg > 1:8367910‑M2/1‑139 (MQ=255) aGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggt > 2:1556183‑M2/1‑138 (MQ=255) atcgatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggttt > 2:8512490‑M2/1‑136 (MQ=255) atcgatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggttt > 1:6340748‑M2/1‑136 (MQ=255) tcgatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggttta > 2:6412715‑M2/1‑135 (MQ=255) atcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTCCGGCGGGCGGTGCCCCACCTCTGATGTGTGCCCCCGgtaggagcgggtttaccc < 2:5009889‑M2/150‑19 (MQ=255) tcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGGAAA‑ACCCCGCCCACCACCGGGCGGGCCCCAACGCTGGAGTGTGGCCCCCGGGGGGGCGGGgtttggcg > 1:1025229/1‑145 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGTGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAC‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCAAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggttttacccgcgaa > 2:223274‑M2/1‑127 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtaaacccgctcc > 2:7666438‑M2/1‑127 (MQ=255) gaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctccCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGGGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga > 2:4519914‑M1/61‑150 (MQ=255) gCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCGgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcc < 2:8847999‑M2/150‑30 (MQ=255) cccccGTGGCCTGTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTGGCGCCTGTATCGGCCCCTCCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAGGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccg > 2:5168946‑M2/1‑120 (MQ=255) ggggCCTTTGCGGGGGGGGGGTTGCCGTGGCCGCCGGCTTGCGCCTGTATGGGCCTGTGCGG‑GGGTAAC‑CCCGCCCCTCCGACGGGCTGCGCCAAACCCCTGTTGTGGGCCCCCTGTTGGCGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAgg < 2:1973217/148‑1 (MQ=255) ccTTTGTGTGGCGGGGGTTGCAGTTGCCGCCCGCTTGAGCGTGTTCCGGCCTCTTCGC‑GGTTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCAACCCTCTTTTGTGTGCCCCCTGTTGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTa < 2:609723/150‑1 (MQ=37) tttGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTg > 1:2918285‑M2/1‑109 (MQ=255) tttGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAAc > 2:692440/1‑150 (MQ=255) tttGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCACCTAAGACGGGCTGAGCCCAACCACTGATGTGTGCCCCCGGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCGGTATGTCTAAc > 2:4258736/1‑150 (MQ=38) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |