New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 1419584 | 82 (0.300) | 17 (0.080) | 13/212 | NT | 20.0% | intergenic (‑67/+70) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1419614 | 73 (0.350) | intergenic (‑97/+40) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
TAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCA > NC_002947/1419465‑1419763 | aGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACc > 2:884105‑M2/1‑149 (MQ=255) aaGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcct > 1:2214120‑M2/1‑147 (MQ=255) gCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGATTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTAAGCGGGCCCGCCCGCTCCCACCGGGACGGTGCAGTGCGTGTAGGCTGTGGGGACccggt < 1:2912983‑M2/150‑6 (MQ=255) 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ggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTgg > 2:7385823‑M1/82‑150 (MQ=255) aGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgg > 1:5556805‑M2/1‑143 (MQ=255) gctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTggg > 1:198137‑M1/81‑150 (MQ=255) ctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGa > 2:4506135‑M1/80‑150 (MQ=255) ctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccgtgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGa > 1:7898020‑M1/80‑150 (MQ=255) 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> 2:2853025/1‑150 (MQ=38) gTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGTACGGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATg > 2:9067576/1‑150 (MQ=255) ggaaTTGTTTTTTGGCCCTGTTTTCTGGGTTGCCTGGGCGGGCCTCTTGGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGTACTGGGCAGTGGGTTCCGGCTGTGGTGACCCGGTGGGAGCGGGGGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCaa < 2:7275020/147‑1 (MQ=255) gaaattttttttttCACTGCATACTGCTTTCCCTGGCATCGCCTATTCCCCCCCACGCCCGAACACAAATTTACTTTGAAGTCCGTCACGCCTTTGCTCACCATGTGGTAGCCGCCGTCCCCGCCAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCaat < 2:4716856/144‑2 (MQ=255) gCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAg > 2:622303/1‑150 (MQ=255) gCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCCCTCCCACACGTACAGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGACCAGCTAATGCAAg > 2:858275/1‑150 (MQ=38) 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aCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGc < 2:4360302/150‑1 (MQ=255) | TAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCA > NC_002947/1419465‑1419763 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |