| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1968074 = | 192 (0.700) | 16 (0.060) | 9/250 | NT | 7.6% | intergenic (‑42/+116) | yciK/gph | putative oxidoreductase/phosphoglycolate phosphatase |
| ? | NC_002947 | 1968159 = | 215 (0.860) | intergenic (‑127/+31) | yciK/gph | putative oxidoreductase/phosphoglycolate phosphatase | |||||
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
GGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCCTCTGGATGAATATAGCCGTAGCGCACTG > NC_002947/1968010‑1968308 | gggcgggcGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTAGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACa > 2:5501742/1‑150 (MQ=255) gcgggcggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGAATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACaaa < 1:7818413/150‑1 (MQ=255) gcgggcggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGT‑GGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACaaaa < 1:17506/150‑1 (MQ=255) 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gTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGccc > 1:5638019/1‑150 (MQ=255) gTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGccc > 1:2929335/1‑150 (MQ=255) gTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGccc < 1:6374834/150‑1 (MQ=255) aaCATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTc > 2:3673228/1‑150 (MQ=255) cATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCAt > 2:1387266/1‑150 (MQ=255) aTGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATc < 2:6001113/150‑1 (MQ=255) gTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGt < 1:5260057/150‑1 (MQ=255) tCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCt > 1:8804847/1‑150 (MQ=255) tggccTTCGTGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTgg < 1:4204520/147‑1 (MQ=255) tGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGACTGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGGCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTgg < 1:1252146/150‑1 (MQ=255) 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aaaaGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCCTCTGGATGAATATAGCCGTAGCGCActg > 1:3315598/1‑150 (MQ=255) | GGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCCTCTGGATGAATATAGCCGTAGCGCACTG > NC_002947/1968010‑1968308 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |