| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2052524 = | 62 (0.230) | 17 (0.080) | 6/202 | NT | 28.3% | intergenic (‑52/+123) | PP_1824/PP_1825 | Smr domain‑containing protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2052634 = | 41 (0.200) | intergenic (‑162/+13) | PP_1824/PP_1825 | Smr domain‑containing protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
AGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTGGACAACG > NC_002947/2052495‑2052783 | tgttgccgcgTCGGTGGGGCGGTGTGCCGCCTGGGCGGGCCTCTTGGCGGGTGAACCCGCTCCTCCGGGGATGTCACAGAGCCCGCAGACGGGGGGGTGCCTGTTGGTGCGGGTTCACCCGCGACGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAAc < 2:8204874/144‑1 (MQ=255)ggatcccgcgCCGGTGGGGGGGGGGGCCGCGTGGGCGGGCCTCCCGGGGGGTGACCCCGCCCACCGGGGGATGGCACCGCGCCCTATTCGGGGGGGGTGCGGGTTGCTGGGGGTCCCCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAAc < 2:1258662/144‑1 (MQ=255) tgCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGTAACCCCTCCCACGGGGATGTCACAGAGCCCCAAGACGGCGGGGGGCCGGTTGGAGCGGGGTCAACCCCGCAGGGGCCCCCCCACGGTACGCCACACCATCAATCGTGCGTCTTGATCggg > 2:6302579/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCAACGGGGTTGTCAAAGATCCCCCAGACCGCGGGGTGCCGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACACGTTACCCAAAAACAACAAACGGGCTTCTTAATAAgggg > 2:6594031/1‑148 (MQ=25) gCCTCTTGGGGTGTGAACCCGCCCCTCGGGGGAGGTCCCTGCCCCCGACGCGGGGGGGGCGCCTGTCGGTGGGGTTCCCCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGtt < 1:8288678/150‑1 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCGGGAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGACGCCCCCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCAGCAGGTGCGGCGACAGGtt < 2:9040180‑M1/150‑1 (MQ=255) CCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTCCGGGGATGTCACAGAGCCCGACGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTa > 2:6818301‑M1/1‑150 (MQ=255) TCTTCGCGGGTGGACCCGCTCCTACGGGGTTGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCGGGAGGAGCGGGTTCACCCGCCAAGAGGCCCGCACACGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGGGCGGCGACAGGTTAAg < 2:2264383‑M1/150‑1 (MQ=255) CTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCAGCAGGTGCGGCGACCGGTTAAGc < 2:6784517‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCGCGGGTTAACCCGCTGCTACGGGGATTTCAAAGAGCCCGAATACGGCGGGGTGGCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGTCAGGGTAAGCt < 2:378425‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGATCCCGAAGACGGCGGGGTGCCGGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCAACAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAgca < 2:6311054‑M1/150‑2 (MQ=255) TTCGCGGGTGAACCCGCTCCTAAGGGGATGTCACAGAGCCCGAATACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCt < 2:3784875‑M1/150‑1 (MQ=255) ccgcgGGTCAACCCGCACCACCCGGTATCACACACCCCCCCAAGCCGCCGGGGCCCCATTAGCAGCGGGTACACCCCCGAAGAGCCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTc < 2:8668791/149‑1 (MQ=255) GCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGCCAGGTTAAGCTccc < 1:8263188‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTccc < 2:4178539‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTGAACCCGCTACTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATAGTGCTTATTCATAAGGTTCGGCGACAGGTTAAGCTccc < 1:8693898‑M1/150‑1 (MQ=255) GTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTcccgccc < 1:110226‑M1/150‑1 (MQ=255) acccgctcctacaggcaccccgccgtcttcgggctctgtgacatccccgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCgcgg > 2:7183597‑M2/86‑150 (MQ=255) 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gctcctacaggcaccccgccgtcttcgggctctgtgacatccccgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCa > 1:4386913‑M2/82‑150 (MQ=255) gctcctacaggcaccccgccgtcttcgggctctgtgacatccccgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCAGCCCGCGGCGCa > 1:938254‑M2/82‑150 (MQ=255) GCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCa < 2:8762479‑M1/150‑1 (MQ=255) GCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCa < 1:6997704‑M1/150‑1 (MQ=255) TACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTaa > 1:6975481‑M1/1‑127 (MQ=255) ACGGGGATGTCCCAGAGCCCGAAGACGGCGGGGGGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGa > 2:8226401‑M1/1‑150 (MQ=255) aTGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTaa < 1:5696448/120‑1 (MQ=255) tCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTgc > 1:1876936/1‑150 (MQ=255) tCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTgc > 2:8923574/1‑150 (MQ=255) tCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTgc > 2:5431971/1‑150 (MQ=255) 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ccccccgccaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAagcca < 1:7906581‑M2/125‑1 (MQ=255) ccaccccccaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAagcca < 1:1265129‑M2/125‑1 (MQ=255) acccgcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAagccagc > 2:2959210‑M2/24‑150 (MQ=255) acccgcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAagccagc > 1:1924188‑M2/24‑150 (MQ=255) cccgcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAagccagcc > 2:8559705‑M2/23‑150 (MQ=255) cccgcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAagccagcc > 2:8559749‑M2/23‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAgccagcca > 1:1662559‑M2/22‑150 (MQ=255) aagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTg > 1:1363673‑M2/17‑150 (MQ=255) agaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGa < 2:3648456‑M2/135‑1 (MQ=255) agaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGa < 2:3577441‑M2/135‑1 (MQ=255) gcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGAt > 2:1862661‑M2/12‑150 (MQ=255) gcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGAt > 1:4892330‑M2/12‑150 (MQ=255) ccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCCCGGTGAGGATGc > 2:8309327‑M2/10‑150 (MQ=255) ccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGc > 1:80909‑M2/10‑150 (MQ=255) ccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGc > 1:3524409‑M2/10‑150 (MQ=255) ccgcacaggTTACGAAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGc > 2:980088‑M2/10‑150 (MQ=255) cgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCt > 2:5507475‑M2/9‑150 (MQ=255) cgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCt < 1:146006‑M2/142‑1 (MQ=255) gcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTg < 2:1985833‑M2/143‑1 (MQ=255) gcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTg < 1:6302579‑M2/143‑1 (MQ=255) acaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTGGa > 2:4426167‑M2/6‑150 (MQ=255) acaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTGGa > 2:1752950‑M2/6‑150 (MQ=255) acaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTGGa < 1:5517203‑M2/145‑1 (MQ=255) gTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTGGACAAc > 2:7989477‑M2/2‑150 (MQ=255) gTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTGGACAAc > 2:2235991‑M2/2‑150 (MQ=255) gTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTGGACAAc > 2:2235939‑M2/2‑150 (MQ=255) ttACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTGGACAACg > 2:6846158/1‑150 (MQ=255) | AGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTGGACAACG > NC_002947/2052495‑2052783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |