New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2052560 | 57 (0.210) | 19 (0.090) | 6/202 | NT | 31.5% | intergenic (‑88/+87) | PP_1824/PP_1825 | Smr domain‑containing protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2052596 | 41 (0.200) | intergenic (‑124/+51) | PP_1824/PP_1825 | Smr domain‑containing protein/hypothetical protein |
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
AACAGGGAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAG > NC_002947/2052447‑2052745 | aaCCGGGAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCGCCACGTTGGCGGCGTTGTTTCCGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTCCGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCt < 1:1546303/150‑1 (MQ=39) aaCAGGGAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCt < 2:4030302/150‑1 (MQ=255) aaCAGGGAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCGACGGGGATGTCACACAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCt > 2:8999189/1‑150 (MQ=255) aCAGGGAAAAAGCGTCGTCTTGCATGCTGCCGCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTGCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTg > 2:2139416‑M2/1‑149 (MQ=255) cAGGGAAAAATCGTCGTCGTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgt > 1:106838‑M2/1‑148 (MQ=255) gggAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTATTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtag > 1:3132216‑M2/1‑146 (MQ=255) gggAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtag > 1:9145092‑M2/1‑146 (MQ=255) gggAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtag > 2:9099592‑M2/1‑146 (MQ=255) cgcttgcgccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAg > 1:5632638‑M1/74‑150 (MQ=255) aaaaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagc > 2:5705934‑M2/1‑142 (MQ=255) aaaTCGTCGTCTGGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcg > 2:1138096‑M2/1‑141 (MQ=255) cgccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGagctg > 2:8564078‑M1/68‑148 (MQ=255) cgccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCgg > 2:352524‑M1/68‑150 (MQ=255) cgccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCgg > 2:3917818‑M1/68‑150 (MQ=255) cgccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCgg > 1:6033477‑M1/68‑150 (MQ=255) cgccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCgg > 1:4186450‑M1/68‑150 (MQ=255) cgccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCgg > 2:1753219‑M1/68‑150 (MQ=255) aaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgg > 2:5989471‑M2/1‑140 (MQ=255) aaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgg > 2:5440336‑M2/1‑140 (MQ=255) aaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgg > 1:6766711‑M2/1‑140 (MQ=255) aaTCGTCGTCTTGCATGAGGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgg > 1:7162845‑M2/1‑140 (MQ=255) aaTCGTCGTCTTGCACGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCTGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATTTCTCAGAGCCCTAAGACGGCGGGGTGCCTttagtagctg > 2:697332‑M2/1‑140 (MQ=255) gccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCggg > 2:933730‑M1/67‑150 (MQ=255) 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aTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcggg > 2:3312962‑M2/1‑139 (MQ=255) aTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcggg > 1:7313648‑M2/1‑139 (MQ=255) aTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcggg > 2:7583351‑M2/1‑139 (MQ=255) ccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGt > 2:7183597‑M1/66‑150 (MQ=255) tcgtcTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGTAACCGCTCCTAAGGGGCTGTCAAAGAGCCCGAAGACGGCGGGGGGGCTgtaggggcgggttaa < 2:1265132‑M2/150‑16 (MQ=255) 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2:7288652‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCACgcggcg < 1:5398887‑M1/150‑1 (MQ=255) gCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggctgcacaccgccccacagtcgcgtaaactccgccgcctacgtggaggcatcatgccagacgacgatttt < 1:6211836‑M2/150‑107 (MQ=255) GCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCa < 1:6997704‑M1/150‑1 (MQ=255) CTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCaa < 2:8311670‑M1/150‑1 (MQ=255) cTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggctgcacaccgccccacagtcgcgtaaactacgccgccgacgtggaggcatcatgcaagacgacgatttttccc < 1:21321‑M2/150‑111 (MQ=255) TACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTaa > 1:6975481‑M1/1‑127 (MQ=255) CGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCACGCGGAt < 1:8134475‑M1/150‑1 (MQ=255) ggggATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATa > 2:8113236/1‑150 (MQ=255) ggATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACg < 1:8762479/150‑1 (MQ=255) aTGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTaa < 1:5696448/120‑1 (MQ=255) tCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTgc > 1:1876936/1‑150 (MQ=255) acaGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTgcgc > 2:7496504/1‑150 (MQ=255) acaGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTgcgc > 1:1742308/1‑150 (MQ=255) acaGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTgcgc > 1:6021011/1‑150 (MQ=255) agagCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGcgccg > 1:3060877/1‑150 (MQ=255) agagCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGcgccg > 1:5431087/1‑150 (MQ=255) cGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGaa > 1:293745/1‑150 (MQ=255) cGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGaa > 1:220083/1‑150 (MQ=255) gAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGaaa > 2:3780685/1‑150 (MQ=255) ggggggggCCTGTTGGCGCGGGTCCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAacgcacgc < 1:3674206/148‑1 (MQ=255) ggttGCGTGTCGGAGCGTTATCCCCCTCGAAGTGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATATATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCTCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCa < 1:5059340/147‑1 (MQ=255) ggTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAg > 2:4937960/1‑150 (MQ=255) tgtccTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGc < 1:2817867/147‑1 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCAcag > 1:2353681/1‑150 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCAcag > 1:354094/1‑150 (MQ=255) | AACAGGGAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAG > NC_002947/2052447‑2052745 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |