| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 3385530 | 201 (0.730) | 97 (0.350) | 58/274 | NT | 28.0% | coding (501/546 nt) | PP_2985 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 3925187 | 300 (1.100) | coding (161/324 nt) | peaC | quinohemoprotein amine dehydrogenase subunit gamma | |||||
Only 100 of 430 total aligned reads displayed.
GGAACACGGTGCCGAGGTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATGCGCGCCTTGTTGTTCAGGGGCTTC > NC_002947/3925038‑3925336 | aaCACGGTGCCGAGGTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGc < 2:8211374/150‑1 (MQ=255) acacGGTGCCGAGGTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAggg > 2:7147777‑M2/1‑147 (MQ=255) acacGGTGCCGAGGTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAggg > 2:1061133‑M2/1‑147 (MQ=255) acacGGTGCCGAGGTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAggg > 2:2564188‑M2/1‑147 (MQ=255) acacGGTGCCGAGGTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCg > 2:7848473/1‑150 (MQ=255) gTGCCGAGGTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAggggtcat > 2:3163740‑M2/1‑142 (MQ=255) gCCGAGGTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCAc < 1:1509850/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCAc < 1:3202969/150‑1 (MQ=255) ccGAGGTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAggggtcatgcc < 2:4232695‑M2/150‑12 (MQ=255) cGAGGTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCAGACAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAggggtcatgccg < 2:1708465‑M2/150‑13 (MQ=255) gAGGTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCAcgcc > 2:5493313/1‑150 (MQ=255) ggTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCAcgccgc < 2:277873/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACgccgcc > 2:2053338/1‑150 (MQ=255) 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ctGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCt > 1:6872895/1‑150 (MQ=255) tGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTc > 1:3624352/1‑150 (MQ=255) cGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCa < 1:4971171/150‑1 (MQ=255) cGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCa > 1:7039840/1‑150 (MQ=255) aGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCAACTcggcag > 2:751133/1‑145 (MQ=255) 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cTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAggggtcatgccgagataaggcaaaaattaggacattcgttctctaa > 2:8480715‑M2/1‑104 (MQ=255) cTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAggggtcatgccgagataaggcaaaaattaggacattcgttctctaa > 2:5647004‑M2/1‑104 (MQ=255) cTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGt > 2:6287821/1‑150 (MQ=255) tGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAggggtcatgccgagataaggcaaaaattaggacattcgttctctaag < 1:2951884‑M2/150‑48 (MQ=255) tGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAggggtcatgccgagataaggcaaaaattaggacattcgttctctaag > 1:8529379‑M2/1‑103 (MQ=255) 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accaGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGt > 1:6751099/1‑150 (MQ=255) caGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAggggtcatgccgagataaggcaaaaattaggacattcgttctctaagctattgtatttaaacgagtagattagaagccctgctcagcaaagactgcttcgc > 2:137924‑M2/1‑49 (MQ=255) gCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTc > 1:1053588/1‑150 (MQ=255) gCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTc < 2:4140600/150‑1 (MQ=255) gCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTc > 1:4614960/1‑150 (MQ=255) aGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTcggc < 1:6659178/150‑1 (MQ=255) gggTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTcggcg > 2:8777835/1‑150 (MQ=255) tCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAggggtcatgccgagataaggcaaaaattaggacattcgttctctaagctattgtatttaaacgagtagattagaagccctgctcagcaaagactgcttcgcgcccaatcg > 1:2212577‑M2/1‑40 (MQ=255) gtaacaacCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCggcggcggc < 1:5663997/148‑1 (MQ=255) gAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGcc > 1:8957813/1‑150 (MQ=255) gAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGcc > 2:5839905/1‑150 (MQ=255) aacCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCt > 1:2701006/1‑150 (MQ=255) cATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAggggtcatgccgagataaggcaaaaattaggacattcgttctctaagctattgtatttaaacgagtagattagaatccctgctcagcaaagactgcttcgcgcccaatcgcttcagccat < 1:4873862‑M2/150‑121 (MQ=255) cATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCa > 1:277097/1‑150 (MQ=255) aTAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGGTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAg > 2:6717466/1‑150 (MQ=255) aaaGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGa < 1:3043833/150‑1 (MQ=255) tCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGTCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATgcgc > 1:7741946/1‑150 (MQ=255) tCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATgcgc < 2:9068855/150‑1 (MQ=255) ccTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATGCGCGCCt < 2:7698094/150‑1 (MQ=255) ccTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATGCGCGCCt > 1:1383372/1‑150 (MQ=255) cTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATGCGCGCCtt > 2:7256390/1‑150 (MQ=255) cATCGGCTGGCACAggggtcatgccgagataaggcaaaaattaggacattcgttctctaagctattgtatttaaacgagtagattagaagccctgctcagcaaagactgcttcgcgcccaatcgcttcagccatccattgaggaaggttt > 2:4404793‑M2/1‑14 (MQ=255) cATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATGCGCGCCttgtt < 1:5155559/150‑1 (MQ=255) aTCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATGCGCGCCttgttg > 1:3144801/1‑150 (MQ=255) cGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATGCGCGCCTTgttgtt < 2:5154741/150‑1 (MQ=255) tGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATGCGCGCCTTGTTGTTCAgg < 2:6619782/150‑1 (MQ=255) ggCACAggggtcatgccgagataaggcaaaaattaggacattcgttctctaagctattgtatttaaacgagtagattagaagccctgctcagcaaagactgcttcgcgcccaatcgcttcagccatccattgaggaaggtttgatctatg < 1:1777972‑M2/150‑145 (MQ=255) gCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATGCGCGCCTTGTTGTTCAgggg > 1:583631/1‑150 (MQ=255) cacaGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATGCGCGCCTTGTTGTTCAGGGGc < 2:2708068/150‑1 (MQ=255) aGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATGCGCGCCTTGTTGTTCAGGGGCTTc < 2:6872895/150‑1 (MQ=255) aGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATGCGCGCCTTGTTGTTCAGGGGCTTc < 1:7181193/150‑1 (MQ=255) | GGAACACGGTGCCGAGGTTGCGCCAGTCCTCTGCCGAGTTGGACGCCTGGGCGTTCCAGTCCTGGTAGGTGCTCATCATGTCCGGCACCTGGGCCGGCCACCAGCAAGGGTCGGAACAACCATAAAGGTCAGCCTCCATCGGCTGGCACAGCGAGCTCACGCCGCCAAAGGCGTCCACCTCCCAGCCTGGGTCGGTAGTGGCCGTGCAGCCTGCCACCGCGCTCATTGCCATCACTTCTTCGACACGGTCTTCGGCGGCGGCCTGCTCCAGGATGCGCGCCTTGTTGTTCAGGGGCTTC > NC_002947/3925038‑3925336 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |