New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4810146 | 0 (0.000) | 142 (0.570) | 47/252 | NT | 60.0% | intergenic (‑288/‑267) | PP_4234/dsbD‑II | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase/thiol/disulfide interchange protein 2 |
? | NC_002947 | 5990743 = | 189 (0.750) | intergenic (+59/‑487) | kefB‑III/PP_mr64 | glutathione‑regulated potassium/H+ antiporter/C4 ncRNA |
Only 100 of 373 total aligned reads displayed.
GCAAGTGCGTGATGACCGGGCCAAGGTGATGCAGACGGCCAAGGAGGCGCGGGTGGAGCTGGAGCGGTTGTTTGATTCGGATGCGGACTGAGGCCTTTTGGCGCGTGCCTTGAGGGTTGTAGTGCCTGTGAGATTGGGCGCCGCCCGCGCGGCGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGTTTGTTTCGGGCCAGTTATTCCTGTGGGACGCGCACGCGAGCCCCCTGGCGCACGCCTCGATATCGCGTCGTACAAACAAGGCGGTCGCGCGCGCCTGGCACAGGAGGGATTGGCCAGAA > NC_002947/5990594‑5990892 | gggcaatgggcggaattcgcgctttggcgggtaggtgtttggcgggaggttttcagcgcctgggaggtgttcgccgggggattttcagcgcctgggaggtgttcgccgggagagtttcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgcgg < 2:7397849‑M2/3‑1 (MQ=255) gggcaatgggcggaattcgcgctttggcgggtaggtgtttggcgggaggttttcagcgcctgggaggtgttcgccgggggattttcagcgcctgggaggtgttcgccgggagagtttcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgcgg > 1:4476530‑M2/148‑150 (MQ=255) aGTGCGTGATGACCGGGCCAAGGTGATGCAGACGGCCAAGGAGGCGCGGGTGGAGCTGGAGCGGTTGTTTGATTCGGATGCGGACTGAGGCCTTTTGGCGCGTGCCTTGAGGGTTGTAGTGCCTGTGAGATTGGGCGCCGCCCGCgcggc < 1:6902698/150‑1 (MQ=255) gCGTGATGACCGGGCCAAGGTGATGCAGACGGCCAAGGAGGCGCGGGTGGAGCTGGAGCGGTTGTTTGATTCGGATGCGGACTGAGGCCTTTTGGCGCGTGCCTTGAGGGTTGTAGTGCCTGTGAGATTGGGCGCCGCCCGCGCGGCGCt < 1:5690290/150‑1 (MQ=255) gCGTGATGACCGGGCCAAGGTGATGCAGACGGCCAAGGAGGCGCGGGTGGAGCTGGAGCGGTTGTTTGATTCGGATGCGGACTGAGGCCTTTTGGCGCGTGCCTTGAGGGTTGTAGTGCCTGTGAGATTGGGCGCCGCCCGCGCGGCGCt > 1:3199879/1‑150 (MQ=255) aatgggcggaattcgcgctttggcgggtaggtgtttggcgggaggttttcagcgcctgggaggtgttcgccgggggattttcagcgcctgggaggtgttcgccgggagagtttcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgCGGCGCt > 2:9117831‑M2/144‑150 (MQ=255) atgggcggaattcgcgctttggcgggtaggtgtttggcgggaggttttcagcgcctgggaggtgttcgccgggggattttcagcgcctgggaggtgttcgccgggagagtttcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgCGGCGCtt < 1:3066954‑M2/8‑1 (MQ=255) tgatgaCCGGGCCAAGGTGATGCAGACGGCCAAGGAGGCGCGGGTGGAGCTGGAGCGGTTGTTTGATTCGGATGCGGACTGAGGCCTTTTGGCGCGTGCCTTGAGGGTTGTAGTGCCTGTGAGATTGGGCGCCGCCCGCGCGGCGCTTcg < 1:7042926/150‑1 (MQ=255) 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cggaattcgcgctttggcgggtaggtgtttggcgggaggttttcagcgcctgggaggtgttcgccgggggattttcagcgcctgggaggtgttcgccgggagagtttcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgCGGCGCTTCGC‑gg < 1:7752695‑M2/13‑1 (MQ=255) ggaattcgcgctttggcgggtaggtgtttggcgggaggttttcagcgcctgggaggtgttcgccgggggattttcagcgcctgggaggtgttcgccgggagagtttcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgCGGCGCTTCGC‑ggg > 2:1262881‑M2/137‑150 (MQ=255) aCCGGGCCAAGGTGATGCAGACGGCCAAGGAGGCGCGGGTGGAGCTGGAGCGGTTGTTTGATTCGGATGCGGACTGAGGCCTTTTGGCGCGTGCCTTGAGGGTTGTAGTGCCTGTGAGATTGGGCGCCGCCCGCGCGGCGCTTCGC‑GGGt > 1:530445/1‑150 (MQ=255) aCCGGGCCAAGGTGATGCAGACGGCCAAGGAGGCGCGGGTGGAGCTGGAGCGGTTGTTTGATTCGGATGCGGACTGAGGCCTTTTGGCGCGTGCCTTGAGGGTTGTAGTGCCTGTGAGATTGGGCGCCGCCCGCGCGGCGCTTCGC‑GGGt < 2:5702154/150‑1 (MQ=255) ccGGGCCAAGGTGATGCAGACGGCCAAGGAGGCGCGGGTGGAGCTGGAGCGGTTGTTTGATTCGGATGCGGACTGAGGCCTTTTGGCGCGTGCCTTGAGGGTTGTAGTGCCTGTGAGATTGGGCGCCGCCCGCGCGGCGCTTCGC‑GGGTa < 2:6391425/150‑1 (MQ=255) 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ggcgggtaggtgtttggcgggaggttttcagcgcctgggaggtgttcgccgggggattttcagcgcctgggaggtgttcgccgggagagtttcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgCGGCGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTa < 1:4603712‑M2/28‑1 (MQ=255) ggcgggtaggtgtttggcgggaggttttcagcgcctgggaggtgttcgccgggggattttcagcgcctgggaggtgttcgccgggagagtttcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgCGGCGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTa < 2:109176‑M2/28‑1 (MQ=255) gtaggtgtttggcgggaggttttcagcgcctgggaggtgttcgccgggggattttcagcgcctgggaggtgttcgccgggagagtttcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgCGGCGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACgttt < 1:8884583‑M2/33‑1 (MQ=255) ggtgtttggcgggaggttttcagcgcctgggaggtgttcgccgggggattttcagcgcctgggaggtgttcgccgggagagtttcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgCGGCGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACgtttgtt < 1:924714‑M2/36‑1 (MQ=255) ggCCAAGGAGGCGCGGGTGGAGCTGGAGCGGTTGTTTGATTCGGATGCGGACTTAGGCCTTTTGGCGCGTGCCTTGAGGGTTGTAGTGCCTGTGAGATTGGGCGCCGCCCGCGCGGCGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACgtttgttt < 2:2232775/150‑1 (MQ=255) 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tttcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgCGGCGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGTTTGTTTCGGGCCAATTATTCCTGCGGGATTTGCGCGCGACCGCCTTGGGGCATGTCTCGATATCGCGTCGTACAAACAAGGCGGTc < 1:7192164‑M2/117‑1 (MQ=255) tttcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgCGGCGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGTTTGTTTCGGGCCAATTATTCCTGCGGGATTTGCGCGCGACCGCCTTGGGGCATGTCTCGATATCGCGTCGTACAAACAAGGCGGTc < 1:6674518‑M2/117‑1 (MQ=255) tttcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgCGGCGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGTTTGTTTCGGGCCAATTATTCCTGCGGGATCTGCGCGCGACCGCCTTGGGGCATGTCTCGATATCGCGTCGTACAAACAAGGCGGTc < 1:2574469‑M2/117‑1 (MQ=255) tcagcgcctgggagatcgagcgccgcccgcgCGGCGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGTTTGTTTCGGGCCAATTATTCCTGCGGGATTTGCGCGCGACCGCCTTGGGGCATGTCTCGATATCGCGTCGTACAAACAAGGCGGTcgc < 1:5143447‑M2/119‑1 (MQ=255) gTAGTGCCTGTGAGATTGGGCGCCGCCCGCGCGGCGCTTTGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGTTTGTTTCGGGCCAGTTATTCCTGTGGGACGCGCACGCGAGCCCCCTGGCGCACGCCTCGATATCGCGTCGTACAAACAAGGCGGTcgc < 2:8404951/150‑1 (MQ=255) 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gCGGCGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGTTTGTTTCGGGCCAGTTATTCCTGTGGGACGCGCACGCGAGCCCCCTGGCGCACGCCTCGATATCGCGTCGTACAAACAAGGCGGTc < 1:6806626‑M2/117‑1 (MQ=255) | GCAAGTGCGTGATGACCGGGCCAAGGTGATGCAGACGGCCAAGGAGGCGCGGGTGGAGCTGGAGCGGTTGTTTGATTCGGATGCGGACTGAGGCCTTTTGGCGCGTGCCTTGAGGGTTGTAGTGCCTGTGAGATTGGGCGCCGCCCGCGCGGCGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGTTTGTTTCGGGCCAGTTATTCCTGTGGGACGCGCACGCGAGCCCCCTGGCGCACGCCTCGATATCGCGTCGTACAAACAAGGCGGTCGCGCGCGCCTGGCACAGGAGGGATTGGCCAGAA > NC_002947/5990594‑5990892 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |