New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5290364 = | 82 (0.300) | 13 (0.060) | 4/216 | NT | 13.1% | intergenic (‑75/+109) | PP_4660/mdaB | LysR family transcriptional regulator/drug activity modulator B |
? | NC_002947 | 5290458 = | 109 (0.510) | intergenic (‑169/+15) | PP_4660/mdaB | LysR family transcriptional regulator/drug activity modulator B |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
CTGTGCAAGGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGC > NC_002947/5290309‑5290604 | cAAGGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCAAAACTACAGCAAAGTACATGTAACAGGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCCCCAAGAGGCCGGTACa > 1:7427231/1‑150 (MQ=255) agtaTTCGATAACCGCTGGTCGTGGCCAAGTCCTGCGGCGCCTGTTGGGGCCTGTTCGCGGGGTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGGTTACTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGa < 2:1405241/147‑1 (MQ=25) ggATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGAc < 2:7540778/150‑1 (MQ=255) ttAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGGGTTCCCCCGCCCACAAGTACTGCAAAGTACGTTAAAACAGCGTAAAAACAGTGGGAGCGGGCAAGCCCCCCAAGAGGCCCGgacagacaga > 1:4513067/1‑148 (MQ=255) gATACCCGCTGGCCGCGGCCACGCCCAGCGGGGCCTGTATGGGCCTCTGCGGGGGGTTGCCCGCGCCCACACGAACTGCAAAGGCCTTGAACCCTGCGAAATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATaaaa < 2:8707692/150‑1 (MQ=21) gATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGCCCACAAGTACGGCAAAGTCCATGAAAACTGGGTAATACCAGTGGGGGCGGGCCAGCCCGCGAAGAGGCCGGGTCAGACATaaaa > 1:4436308/1‑150 (MQ=255) aTAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCGTGGCCGCTACCACAAGTACTGCAAATTCCTTTTAACCTGCGTAAAAACTGTGGGGGCGGGCAAGCCCCCGCAGAGGCCGGTACACACaaaaaaa > 2:1548252/1‑149 (MQ=255) aTAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCACCCACAAGTACAGCAAAGTGCGTGAAACCGGCGGAATAACAGTGGGAGCGGGCAAGACCGCGAAGAGGCCGGGGCAGACAAAAAAt > 1:5317233/1‑150 (MQ=255) cggtttGTCGTGGCCACGCCCTGGGGCGCCTGTTTGGGCCTCTGCGCGGGGTTGCCCGACCCCACATGTCGTGAACCGTCCTTGAACCTTGCGTAATCCGGGTGGGAGGGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACt < 2:4924363/146‑1 (MQ=16) ccGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACt > 2:7496320/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGCCCACAAGTACTGCAAATGCCTTGAAAACAGCGTAATACCAGTGGGGGCGGGCAAGCCCCCGAAGAGGCCGGTGCAGACATAAAAATaaa > 2:2368886/1‑148 (MQ=255) ccGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCCCTCCCCCCAGTACGGCAAAGTACATGAAAACAGCGTGATAACATTGGGAGCGGGCAACCCCCCCAACAGGCCGGTACAGAACTAAAATTaaa > 1:8989581/1‑148 (MQ=255) ccGCTGGTCGCGGCCATTTCCAGCGGCGCCTTTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCCCCCACAAGTACACAAATGCCCTGGAAACCGGCTTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACt < 2:3392162/150‑1 (MQ=25) cGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCGTGAAACCAGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACCGACATAAAATTACtg > 2:5285503/1‑150 (MQ=255) cGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTAATGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACtg > 2:708496/1‑150 (MQ=255) gCTTGTCGTGGCCACGGCCTGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCGGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGGGGGTGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACtgt < 2:8877545/150‑1 (MQ=38) gCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTTCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCAGCGTAATACCAGTGGGAGCGGGCAAGCCCCCGGAGAGGCCCGGACAGACATAAAATTAAtgt > 1:642535/1‑150 (MQ=255) aaGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAAAACCAGTGGGAGCGGGCCAGCGCGCGAAGAGGCCGGTACAGACAAAAAATTACATTTCCATGCCAAaca > 2:4079808/1‑150 (MQ=37) 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ccgctcccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg > 1:7183933‑M2/76‑150 (MQ=255) ccgctcccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg > 1:2303505‑M2/76‑150 (MQ=255) ccgctcccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg > 1:1449885‑M2/76‑150 (MQ=255) CCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg < 2:52484‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg < 1:2421077‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg < 1:4741800‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACATGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAATCACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg < 2:8553131‑M1/150‑1 (MQ=255) GCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGca < 1:7746727‑M1/150‑1 (MQ=255) CACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATcc < 2:4036388‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCg < 1:4162437‑M1/150‑1 (MQ=255) 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ctcttcgcgggcttgcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAgg > 1:3881091‑M2/30‑150 (MQ=255) tgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGc > 2:738380‑M2/29‑150 (MQ=255) gagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCAGAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCgg > 2:3040412‑M2/26‑150 (MQ=255) ggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATg > 1:2218582‑M2/21‑150 (MQ=255) aagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTGCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGccc > 1:2522099‑M2/18‑150 (MQ=255) ccccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAg < 1:1660539‑M2/135‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTGATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGa > 2:587645‑M2/14‑150 (MQ=255) cgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGaa > 1:574877‑M2/13‑150 (MQ=255) gcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCAAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAAc > 1:1780870‑M2/12‑150 (MQ=255) cgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACt < 1:6956912‑M2/140‑1 (MQ=255) gaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTg > 2:6345296‑M2/10‑150 (MQ=255) gaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTg > 2:6344779‑M2/10‑150 (MQ=255) gaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTg > 2:6279132‑M2/10‑150 (MQ=255) acgaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTgg < 1:3977978‑M2/142‑1 (MQ=255) gaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGtt < 2:7981405‑M2/144‑1 (MQ=255) gccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAg < 2:69582‑M2/135‑1 (MQ=255) gccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAg > 1:69854‑M2/4‑138 (MQ=255) | CTGTGCAAGGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGC > NC_002947/5290309‑5290604 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |