New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5384368 = | 61 (0.220) | 14 (0.070) | 6/206 | NT | 23.6% | intergenic (+18/+115) | smpB/pdhR | SsrA‑binding protein/DNA‑binding transcriptional regulator LldR |
? | NC_002947 | 5384466 = | 45 (0.220) | intergenic (+116/+17) | smpB/pdhR | SsrA‑binding protein/DNA‑binding transcriptional regulator LldR |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GGCTGTGCGGAACAAGGGCAAGGAAGAGTAACTACTCTTCAACCTGTTCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCGCCCTGCCCTCGACAATC > NC_002947/5384320‑5384615 | ggAACAAGGGCAAGGAAGAGTAACTACTCTTCAACCTGTTCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGCCCACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCCCATaa > 2:2860471/1‑150 (MQ=255) aaCAAGGGCATGTAAGCGTAACTCCTCTTCAACGTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGAAAGCCCGCCCCCCCCGTATTGGCACCAGTTTCACGCCCGGCGCCTAGCGTGTGGGCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATaaaa < 2:1995319/150‑1 (MQ=25) aaCAAGGGCAAGGAAGAGTAACTACTCTTCAACCTGTTCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGATTGGCACCAGTTTCAAGCCGGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATaaaa < 2:2227575/150‑1 (MQ=255) gggCAAGGAAGAGTAACTACTCTTCAACCTGTTCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGAAAGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCGGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCAAAAAAGCCTc > 2:6389760/1‑150 (MQ=255) gggCAAGGAAGAGTAACTACTCTTCAACCTGTTCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGCCCACAGGCATGGCACCCGATTCAAGCCCCGCGCCGATCCGGGGGGGGCGGGCGTGCCCGCGCAGGGGCCGGTGCTGCCCCGAAAAGCCTc > 2:6390159/1‑150 (MQ=255) gccacggAAGAGTAACGACTCTTCACCCGGTTCCGGCCTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCCCCGGATTGGCACCTGTGTCACGCCCGGCGCCTAACGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCa < 2:5603165/145‑1 (MQ=25) gCAAGGAAGAGTAACTACTCTTCAACCTGTTCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCCCTCCCACAGGAATGGCACCAAAATAAAGCCCGGCGCCAATACTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTAATGACCAAAAAAGACACAg > 2:1925722/1‑150 (MQ=25) gAAGTGTAACTACTCTTCAACGTGGTCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACCGTATTGGCACATGATTCAAGCCGGGCGCCTATCCTGTGGGCGGGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGccc < 2:4239804/150‑1 (MQ=37) agagTAACTACTCTTCAACCTGTTCCGGCCTCTTAGCGCGCAAGCCCGCTCCCACAGGAAAGGCACCAGATTAAATCCCGGCGCCGATCCGGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGCAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGc > 2:3031499/1‑150 (MQ=37) ctTCAACCTGTTCCGGCCTCTTCGCGGGGAAGCCCGCTCCCACAGGGATGGCCCCAGCTTCAAGCCCGGCGCCGATACGGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCAAAAAAGCCTCAGCGCCCGCGGGGCCGctcgg > 2:4800439/1‑148 (MQ=37) aCCTGTTCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGAATGGCACAAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCcgc < 2:1501642/150‑1 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCCCAACCACACGAAATGCACCACATAGAAGCCCCGCGCCGATCCAGTGGGTGCGGGCTTGGCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCCAAAAAAACAAAGCGCCCCCGGCCCCCCCCAGCCCCCCCCAcccc > 2:1277197/1‑149 (MQ=255) CCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTAAACTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCCCTGCGCCGCACTGCCCGCGCCACCCGCTg < 2:2119890‑M1/150‑1 (MQ=255) CTCTTCGCGGCCCCGCCCGCTCCCCCCGGATGGGCACCAGATCCAAGCCCGGCGCCCAGCCGGTGGGAGGGGGCTGGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTgg > 1:8200997‑M1/1‑150 (MQ=255) tcttcgcgggcaagcccgctcccacaggctaggcgccgggcttgaatctggtgccattcctgtgggagcgggcgtgcccccgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTggg > 2:8443635‑M2/93‑150 (MQ=255) AAGCCCGCTCCCACAGGATAGGCGCCGGGCTTGAATCTGGTGCCATTCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTgc < 2:4387649‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGCTCCCACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGcc < 2:9115444‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCt < 2:3078261‑M1/150‑1 (MQ=255) GCTCCCACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCa < 2:1533898‑M1/150‑1 (MQ=255) TCCCACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATg < 1:618821‑M1/150‑1 (MQ=255) TCCCACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATg < 1:618826‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgca < 2:3867334‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgca < 2:1222802‑M1/150‑1 (MQ=255) cacaggataggcgccgggcttgaatctggtgccattcctgtgggagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcag > 1:6105478‑M2/71‑150 (MQ=255) cacaggataggcgccgggcttgaatctggtgccattcctgtgggagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcag > 2:8203277‑M2/71‑150 (MQ=255) cacaggataggcgccgggcttgaatctggtgccattcctgtgggagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcag > 2:1116584‑M2/71‑150 (MQ=255) CACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcag < 1:8893452‑M1/150‑1 (MQ=255) acaggataggcgccgggcttgaatctggtgccattcctgtgggagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcagc > 2:7193467‑M2/70‑150 (MQ=255) acaggataggcgccgggcttgaatctggtgccattcctgtgggagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcagc > 2:3612502‑M2/70‑150 (MQ=255) acaggataggcgccgggcttgaatctggtgccattcctgtgggagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcagc > 1:1677418‑M2/70‑150 (MQ=255) acaggataggcgccgggcttgaatctggtgccattcctgtgggagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcagc > 1:8805276‑M2/70‑150 (MQ=255) acaggataggcgccgggcttgaatctggtgccattcctgtgggagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcagc > 1:85939‑M2/70‑150 (MQ=255) ACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcagc < 1:5533629‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcagc < 1:2305330‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcagc < 1:2664532‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcagc < 1:2739440‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcagc < 1:7209584‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCAGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATgcagc < 1:6382264‑M1/150‑1 (MQ=255) 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tATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGAGCCGCTCTGACCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGAGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGa > 2:4565890/1‑150 (MQ=255) aTCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGac > 1:8046148/1‑150 (MQ=255) tcctgtgggagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGaca > 2:3008921‑M2/36‑150 (MQ=255) tcctgtgggagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGaca > 2:3008891‑M2/36‑150 (MQ=255) tgtgggagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCt > 1:407951‑M2/33‑150 (MQ=255) gagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCcgc > 1:4695370‑M2/28‑72 (MQ=255) gagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCcgc < 2:4695370‑M2/45‑1 (MQ=255) gagcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCcgc < 2:4695318‑M2/45‑1 (MQ=255) agcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCcgcg > 1:2598890‑M2/27‑150 (MQ=255) agcgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCcgcg > 1:6224078‑M2/27‑150 (MQ=255) cgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCa > 2:1648083‑M2/25‑150 (MQ=255) cgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCa > 2:2816285‑M2/25‑150 (MQ=255) cgggcttgcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCa > 1:7440008‑M2/25‑150 (MQ=255) ggctggcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCAtc < 1:8750454‑M2/128‑1 (MQ=255) gcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCg > 2:226653‑M2/18‑150 (MQ=255) gcccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCg > 2:4695340‑M2/18‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCgcc > 1:1810357‑M2/16‑150 (MQ=255) cgcgaagaggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCgccc > 1:594094‑M2/15‑150 (MQ=255) aggccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCGCCCTGCCCTc > 1:6811626‑M2/8‑150 (MQ=255) gccggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCGCCCTGCCCTCGa > 1:3233581‑M2/6‑150 (MQ=255) cggTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCGCCCTGCCCTCGACa > 2:6965789‑M2/4‑150 (MQ=255) tACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCGCCCTGCCCTCGACAATc < 1:8443635/150‑1 (MQ=255) tACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCGCCCTGCCCTCGACAATc < 1:8443291/150‑1 (MQ=255) tACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCGCCCTGCCCTCGACAATc > 2:854863/1‑150 (MQ=255) tACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCGCCCTGCCCTCGACAATc < 1:4800439/150‑1 (MQ=255) tACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCGCCCTGCCCTCGACAATc < 1:4799889/150‑1 (MQ=255) | GGCTGTGCGGAACAAGGGCAAGGAAGAGTAACTACTCTTCAACCTGTTCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGAATGGCACCAGATTCAAGCCCGGCGCCTATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGCCCATAAAAGCCTCAGCGCCCGCTGCGCCGCTCTGCCCGCGCCACCCGCTGGGCTTCTTCGTGCGCCTCATGCAGCACCTCCTGCACATACAAAATGTGCCGGCTGGACACCTCCCGCGCATCCTCCGCCCTGCCCTCGACAATC > NC_002947/5384320‑5384615 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |