New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5673588 = | 114 (0.410) | 17 (0.070) | 9/228 | NT | 15.5% | intergenic (+34/‑136) | PP_4978/PP_4979 | hypothetical protein/substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 5673673 = | 91 (0.400) | intergenic (+119/‑51) | PP_4978/PP_4979 | hypothetical protein/substrate‑binding protein |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
GCGCATCTGCTGCGATCCACCCAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCA > NC_002947/5673525‑5673822 | tgcGATCCACCCAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGGTGGCCCCGGCTTCGCCGGGGGTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAatgcat > 2:7417814/1‑150 (MQ=255) gcGATCCACCCAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCCTTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAatgcatg < 2:8504790/150‑1 (MQ=255) gcGATCCACCCAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGGCAACCCCATCGTTGGCACCGGCGTCGCCGGTGGTCGCGGGGACGCCCCCTCCCACATCGATGatgcatg > 1:727590/1‑150 (MQ=37) cccAAGCCTGATGTGCCCGAAAAACTATTTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGTGGGGGGGTGCCCGCGAATAGCGCAACCGGTGGGTTGGCACCGGCTGCGCGGGTGTCCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTAcc < 1:2485430/150‑1 (MQ=25) ccAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAACGATAATGCCTGCCATTACCg > 2:1273223/1‑150 (MQ=255) aaGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCTTTGTGTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTa < 1:8890052/150‑1 (MQ=255) gctgggCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGGGGTCTTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCgg < 1:8535104/145‑1 (MQ=255) gATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCGAAGAGAGCAACCCCAACGTTGGCACCCGCTTAGCCGGTGGTCGCGGGCACCCCCCCGCCCACAACCAGAAAGCATTCCTATAACCTGCAcccg > 1:585180/1‑148 (MQ=255) tgCCCGAAAAACTCTTTGTCTGGGGGGGTGTTGTGGGCGCGGGCGGGCCCGCGAATAGAGCACCCCGAGGGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGa < 1:8638377/150‑1 (MQ=25) cGCAAAACACATTGTCTTGCGCGGTGTTGGGGGAGCGGGCGGGCCCGCGACGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAgcgc < 1:7270838/150‑1 (MQ=38) gCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGcgcg < 2:3763919/150‑1 (MQ=255) aaCTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAACGATAATGCAAGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAAt > 2:7285588/1‑150 (MQ=255) tCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCCGGCCCCCGAAGAGAGCAACCCCATCGGTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCACCCACCTCGATAATGCAAGCCGTTACCGAACACCCGCCGAGCGCGTAAtaac > 2:2429452/1‑147 (MQ=25) tCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCCGGCGGGCCCCCCAAGAGAGCAACCCCATAGTTGGCACCCGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCACCCACAACGAAAAAGCAAGCCGTTAACCTACACCCGCCCCGCGCGGAAtctc > 2:1159832/1‑150 (MQ=21) cATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCAGCGAGCAACCCCAACGGTGGCACCCGCTTCCCCGGTGGTCGCGGGCCCCCCCGCTCCCACATCGCTAAAGCAGGCCTTTACCGTACACCCGCCCCGCGCGGAATCTcc > 2:3206193/1‑150 (MQ=25) aTTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCg < 2:8789637/150‑1 (MQ=255) aTTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGAGCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCg < 1:1232027/150‑1 (MQ=255) tggTCTTGCGCGGTCTTGTGGGTGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGGGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCgg < 1:6386814/148‑1 (MQ=255) 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ccGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGaa < 1:3831309/150‑1 (MQ=255) cGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAAc > 2:5634014/1‑150 (MQ=255) tgtTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCt > 2:3097891/1‑150 (MQ=255) tcttcgcgggcacgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCt > 2:3649745‑M2/27‑150 (MQ=255) ttcgcgggcacgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTg > 1:6049352‑M2/25‑150 (MQ=255) gcgggcacgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTgcgc > 2:7044440‑M2/22‑150 (MQ=255) cgggcacgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCTCATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGcc < 2:1521187‑M2/130‑1 (MQ=255) cgggcacgcccgctcacacaTCGATCATGCATGCCTTGACCGTTCACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGaactctttctcc < 2:5587913‑M2/130‑6 (MQ=255) gggcacgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCt > 2:2600769‑M2/20‑150 (MQ=255) ggcacgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTg < 2:3542371‑M2/132‑1 (MQ=255) acgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTa > 1:2649915‑M2/16‑150 (MQ=255) gcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAAc < 1:7710952‑M2/137‑1 (MQ=255) cccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCCTCTGTTCt < 1:1073407‑M2/76‑1 (MQ=255) cgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACcga > 2:9030377‑M2/11‑150 (MQ=255) cgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACcga > 2:3941594‑M2/11‑150 (MQ=255) cgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACcga < 1:6552275‑M2/140‑1 (MQ=255) gctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACcgac < 2:2608961‑M2/141‑1 (MQ=255) ccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACt < 1:4081005‑M2/145‑1 (MQ=255) acaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTgg > 2:1032767‑M2/4‑150 (MQ=255) aTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGc > 2:6824653‑M2/2‑150 (MQ=255) aTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGc > 2:4975417‑M2/2‑150 (MQ=255) aTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGc > 2:4975256‑M2/2‑150 (MQ=255) aTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGc > 2:8552719‑M2/2‑150 (MQ=255) tCGATCATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACCTCTCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCGGCTCGTTTGCCTGAGCCCGGTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCa < 1:5694722/150‑1 (MQ=255) tCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCa > 1:4254247/1‑150 (MQ=255) tCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCa > 1:4254537/1‑150 (MQ=255) | GCGCATCTGCTGCGATCCACCCAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCA > NC_002947/5673525‑5673822 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |