| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 139,740 | T→G | 5.9% | Q255P (CAG→CCG) | kinB ← | alginate biosynthesis sensor protein KinB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 139,740 | 0 | T | G | 5.9% | 724.1 / 5.4 | 248 | Q255P (CAG→CCG) | kinB | alginate biosynthesis sensor protein KinB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (141/87); new base G (2/18); total (143/105) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.99e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
CAGGGCTTCGACCAGGCTGCTGCCCAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAATTGCCCTTGCCCAACTGGTCGGCC > NC_002947/139592‑139889 | ggtttCGACCAGGCTGCTGCCCAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTggcc > 2:1863702/4‑150 (MQ=255) gCTTCGACCAGGCTGCTGCCCAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTAGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACCCTGCTggccg > 2:5909680/1‑150 (MQ=255) cTTCGACCAGGCTGCTGCCCAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTggccgg > 1:4052344/1‑150 (MQ=255) tCGACCAGGCTGCTGCCCAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTggccggcc < 1:8196402/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTGCTGCCCAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCcagca < 1:587334/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTGCCCAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCt > 2:4058762/1‑150 (MQ=255) gctgctGCCCAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCtc < 1:2993561/150‑1 (MQ=255) gctgcCCAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGGCGGCCAGCCGCtcgtc > 1:6479509/1‑150 (MQ=255) tgcCCAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCCGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAAAGCTGCTGGCCGGCCagcagcgtttaca < 2:765407/150‑8 (MQ=255) cccAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGTGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCTGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCGCGTCGACg > 1:1468652/1‑150 (MQ=255) cAAGCGGCTGTCGTTCCGGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGtt > 1:2077912/1‑150 (MQ=255) cAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGtt > 2:8764930/1‑150 (MQ=255) cAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCGCGTCGACGtt > 1:5777957/1‑150 (MQ=255) gCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTtggt < 2:5099042/150‑1 (MQ=255) gCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTtggt > 1:6700673/1‑150 (MQ=255) tGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGccg > 1:1133845/1‑149 (MQ=255) tGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCCGCCAGCAGCACGTCGACGGTGGTGGccg > 1:7111757/1‑149 (MQ=255) gTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCt > 1:2280546/1‑131 (MQ=255) gTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTg < 2:108301/150‑1 (MQ=255) gTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCCGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTg > 1:7945509/1‑150 (MQ=255) gTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTg > 2:5148296/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGc > 1:6849216/1‑150 (MQ=255) tCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCt > 1:6275047/1‑150 (MQ=255) ccagcccagcTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAATCGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCtt < 1:3669116/150‑1 (MQ=255) agcccagcTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCCGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCGGGTGCTTgc > 1:6203680/1‑150 (MQ=255) agcccagcTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCCGCAGCGCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTgc > 1:1851534/1‑150 (MQ=255) agcccagcTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCGCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCtagg > 1:4112801/1‑147 (MQ=255) cagcTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCaa < 2:7742478/150‑1 (MQ=255) agcTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAg < 2:2875291/150‑1 (MQ=255) agcTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAg > 1:4554501/1‑150 (MQ=255) gcTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGCTGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCCGCAGCTCGTCGACGGTGGTGGCCGGGTGCTTGCGCAAGGCCTCgg > 2:8149406/1‑150 (MQ=255) gcTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCgg > 2:2802764/1‑150 (MQ=255) gcTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCgg > 1:7880240/1‑150 (MQ=255) 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ccGGGTTGCGGGGCTCGCGGCGGCCCTGCCGGGCGATGATCCGCAGGCCGTCGTCGATGCTGACGAGCCCCGCCTGGAACCGCGGCGGGCCGGCCCGCAGCTCGTCGACGTGGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGAc < 1:4122370/150‑1 (MQ=255) ccGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTATCCGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGAc < 2:2304896/150‑1 (MQ=255) gTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCaaa > 2:6769280/1‑150 (MQ=255) aGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAAcgg < 2:334144/150‑1 (MQ=255) gTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAAcggcg > 2:2648441/1‑150 (MQ=255) 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gcCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGtt < 1:7581370/150‑1 (MQ=255) gcCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTATAAACGCTGCTGGCCGGCCCGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGtt < 1:3612811/150‑1 (MQ=255) cccTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTg > 2:6247387/1‑150 (MQ=255) cctgcgggTCTATTATCAGCCGGCGGTCGTCGTTGCTGTCGTGCACCGCCTGTAACCGCGGCGGGCCGGCCCGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATTGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGa < 1:4819819/144‑1 (MQ=255) ccTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCCGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCCGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGGTGa > 2:5645394/1‑150 (MQ=255) 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cagGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGAc < 2:1237801/150‑1 (MQ=255) agGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGAcc < 2:2180541/150‑1 (MQ=255) ccGTCTTCGATGCTGCCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCAAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGc < 1:4685541/150‑1 (MQ=255) ccGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGc < 2:7916369/150‑1 (MQ=255) tggtcgTTGCTGCCGTGTACCGCCGGAAACGGCTGCGGCCCGGCCCGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAg < 1:8742981/148‑1 (MQ=255) tcgtcgATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAg > 2:6993028/1‑150 (MQ=255) gtcgATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGt > 1:6817086/1‑150 (MQ=255) tcgATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCCTCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTc > 1:7362455/1‑150 (MQ=255) gATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTcac > 2:8074530/1‑150 (MQ=255) tGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGa > 2:405418/1‑150 (MQ=255) tGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCAACAGACCAAAACGGCGGGTCCGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCGGGGTGACCGGCACGGGCACATCGa > 1:5865774/1‑150 (MQ=255) gTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCACAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGaa < 2:9100374/150‑1 (MQ=255) tCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGaaa > 2:3743389/1‑150 (MQ=255) cgtcccGCCTGTAACCGCGGGGGGCCGGCCCGCCGCTCGTCGCCGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAAttg < 1:5654275/146‑1 (MQ=255) ccGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGtt < 2:6193645/103‑1 (MQ=255) ccGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAAttgccct > 2:5198200/1‑150 (MQ=255) ccGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAAttgccct > 1:2288478/1‑150 (MQ=255) tGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAAtcgcccttgccc < 2:7788057/150‑1 (MQ=255) tAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAATTGCCCTTGCCCaa > 1:7533388/1‑150 (MQ=255) aaatcGCTGCGGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAACCGGTGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAATTGCCCTTGCCCaa < 1:3145461/146‑1 (MQ=255) aaCGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTTACCGGCAAGGTCACATCGAAATTGCCCTTGCCCAACt > 1:6109457/1‑150 (MQ=255) aaCGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAATTGCCCTTGCCCAACt > 2:5216593/1‑150 (MQ=255) gctgctGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAATTGCCCTTGCCCAACTGGt > 2:3454758/1‑150 (MQ=255) ctgctgGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAATTGCCCTTGCCCAACTGGTc > 1:8316093/1‑150 (MQ=255) tgctgGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAATTGCCCTTGCCCAACTGGTCg > 1:7885692/1‑150 (MQ=255) ctgGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAATTGCCCTTGCCCAACTGGTCGgc > 1:5325875/1‑150 (MQ=255) tgGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAATTGCCCTTGCCCAACTGGTCGgcc > 2:225494/1‑150 (MQ=255) | CAGGGCTTCGACCAGGCTGCTGCCCAAGCGGCTGTCGTTCCAGCCCAGCTGGCGCTGCGCCACCGGGTTGAGGTGCTCGAGGCGGCCCTGACGGTCGATGATCAGCAGGCCGTCGTCGATGCTGTCGAGTACCGCCTGTAAACGCTGCTGGCCGGCCAGCAGCTCGTCGACGTTGGTGGCCTGGTGCTTGCGCAAGGCATCGGCCATCAGACCAAAACGGCGGGTCAGCTGGTTGAGCTCGGCGGCCTGGGTGACCGGCAAGGTCACATCGAAATTGCCCTTGCCCAACTGGTCGGCC > NC_002947/139592‑139889 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |