| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,780,128 | T→A | 18.9% | intergenic (+45/+61) | PP_1587 → / ← dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,780,128 | 0 | T | A | 18.9% | 233.4 / 27.3 | 108 | intergenic (+45/+61) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/36); new base A (15/7); total (65/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.37e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGG > NC_002947/1779984‑1780277 | gTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActgcgct < 2:7096574/150‑1 (MQ=255)gTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActgcgct < 2:5924352/150‑1 (MQ=255)gTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActgcgct < 2:3697136/150‑1 (MQ=255)gTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAaagcgct > 1:3598938/1‑150 (MQ=255) tACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActgcgctg > 2:2741882/1‑150 (MQ=255) tACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActgcgctg > 2:8199372/1‑150 (MQ=255) aCAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActgcgctgc < 2:1475401/150‑1 (MQ=255) cAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCCCAGGTActgggcggcg > 1:1216579/1‑150 (MQ=255) cAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActgcgctgat < 1:9158618/150‑3 (MQ=255) aaaCCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGTTTGTGCTGCAAGTACTGGGTTAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActgcgctgat < 1:4619741/149‑3 (MQ=255) ccTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCtt < 1:4261689/150‑1 (MQ=255) cTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAcagcgctgatttca > 2:2448586/1‑144 (MQ=255) cTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTg < 2:2243122/150‑1 (MQ=255) cTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTg < 1:6297523/150‑1 (MQ=255) tGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGa > 2:7779558/1‑150 (MQ=255) gCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCTGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGaa < 1:1580818/150‑1 (MQ=255) gCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCCCACGTAAAGCGCTGCGCGTGaa > 1:2590039/1‑150 (MQ=255) aTCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑At < 2:2127252/150‑1 (MQ=255) aTCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑At < 2:2126687/150‑1 (MQ=255) aTCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑At < 2:5384588/150‑1 (MQ=255) aTCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑At < 1:6612096/150‑1 (MQ=255) aTCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑At < 1:5492267/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCACGTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCa < 1:4152292/150‑1 (MQ=255) tCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTTCGCTGCGCGTGTA‑ATAAgc > 1:8798294/1‑150 (MQ=255) cAGCACGTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAgcg < 1:3520604/150‑1 (MQ=255) cAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAgcg < 1:2704526/150‑1 (MQ=255) cAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAgcg < 2:1080250/150‑1 (MQ=255) aGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAgcgc < 1:8477398/150‑1 (MQ=255) aCCTGGGGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACAGGTACGGCCCTGCGCGGGAA‑AGCAgcgcggg > 2:7108400/1‑147 (MQ=255) cTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCGCCCCCAAGTAATGCGCGGCGCGTGTA‑AACAGCGCGGTAc > 1:1596161/1‑150 (MQ=255) gtggGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCtg < 1:7567468/150‑1 (MQ=255) tggGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCtgt < 1:1051122/150‑1 (MQ=255) tggGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCtgt < 1:1051085/150‑1 (MQ=255) ggggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATc > 2:4467743/1‑134 (MQ=255) ggggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATc < 1:4467743/134‑1 (MQ=255) ggggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTgg < 1:1377198/150‑1 (MQ=255) ggggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTgg < 1:3683955/150‑1 (MQ=255) ggggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTgg < 1:4721781/150‑1 (MQ=255) ggggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTgg < 1:5082139/150‑1 (MQ=255) ggggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACAGCGCTGATTTCAAG‑CGCAGCGCAGTACCTGTgg < 2:1215869/150‑1 (MQ=21) ggggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACAGCGCTGATTTCAAG‑CGCAGCGCAGTACCTGTgg < 1:8181011/150‑1 (MQ=21) gggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACAGCGCTGATTTCAAG‑CGCAGCGCAGTACCTGTggg < 2:5599227/150‑1 (MQ=21) ggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGa < 1:7881299/150‑1 (MQ=255) ggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACAGGGACTGCGCTGCGCGGGAA‑AACAGCCCGGGACCGGTgggg > 1:5463551/1‑149 (MQ=255) gATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTgg < 1:5348779/147‑1 (MQ=255) gATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTgg > 2:5348779/1‑147 (MQ=255) gATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCTCACCAAGGTAAAGCGCTGCGCGTGAA‑AACAGCCCGGTAACAGTGGGAg > 1:4646281/1‑150 (MQ=255) gAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACAGCGCTGCGCTTGAA‑AACAGCGCTGTACCTGTGGGAGCgg > 2:5020077/1‑150 (MQ=255) gAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACAGCGCTGATTTCAAG‑CGCAGCGCAGTACCTGTGGGAGCgg < 1:4374424/150‑1 (MQ=21) ggtggtGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCGCCCACCCGGAATGCGCGGCGGGTGTA‑ATAAGCCCGGGAACAGTGGGGGCgggg > 1:3800269/1‑149 (MQ=255) gtggtgCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCGTGAA‑ATCAGCGCGGTACCAGTGGGAGCGGGCg > 1:2202605/1‑150 (MQ=255) tggtgCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGcac < 1:1967901/150‑3 (MQ=255) tggtgCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCGGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGcac < 1:6590534/150‑3 (MQ=255) tgCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCAGTAACAGTGGGAGAGGGCGTGcc > 2:306837/1‑150 (MQ=255) aaGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaa > 2:6817188/1‑150 (MQ=255) tACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCAGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCGAAggg > 1:6015958/1‑150 (MQ=255) tACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAggg > 2:5529290/1‑150 (MQ=255) tACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACACGTACAGCGCTGCCCATGAA‑ATCAGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAggg > 2:6177522/1‑150 (MQ=38) tGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCa < 1:5137558/110‑1 (MQ=255) gCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGGTGATCAGc > 1:7592934/1‑150 (MQ=255) gCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATAAGc > 1:7592952/1‑150 (MQ=255) tGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCAGGGGGTGATCCGCgg > 2:6524205/1‑150 (MQ=255) tatGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCGGTTCCGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGCAGGGGTTGATCAGCGGgttt > 2:4609652/1‑150 (MQ=38) gCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTa > 1:3623385/1‑95 (MQ=255) gCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTa < 2:3623385/95‑1 (MQ=255) gCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTACCACAGGTACAGCGCTGCGCTTGAA‑ATAAGCGCAGAACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGGTGATCAGCGGTTTTGAAGGAAGgc > 2:4237873/1‑150 (MQ=38) gCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCCCAGGTACTGGGCGGCGGGTGGA‑AACAGCGCGGTGCCGGGGGGCGCGGGCGTGCCCCCGGAGGGGGTGGTCAGCGGGTTTTGAGGTAGgc > 2:25797/1‑150 (MQ=255) cGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACACGTAATGCGCTGCGCTGGTA‑ATCAGCGCGGTACCGGGGGGAGCGGGCGTGCCCCCGGAGGGGTTGATAAGCGGTTTTGCAGGAAGgcg > 1:4405917/1‑150 (MQ=38) gAAGCTGGGTTCAGTCAAGTAGACGCTATCAAGGCCCTTCGCGGGGGCGCCCGCTGGCACAGGTACTGCGGTGCGGTTGAA‑ATGAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGGCCGCGAAGGGGTTGTTCAGCGGTTTTGCAGGGAGgcgg > 2:325877/1‑149 (MQ=255) gAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACAGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCGGTGGGAGCGGGCGTGGCCGCGGAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGGAGgcgc > 2:3964349/1‑150 (MQ=38) gAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGACGGCGCTGCGCGTGAA‑ATCAGCGCGGTACCGGGGGGCGCGGGCGGGCCCGCGCACGGGGGGATCCGCGGTTTTGCACGAAGgcgc > 2:3964798/1‑150 (MQ=37) tGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGCGCGTGAA‑ATCCGCCCAGGACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCGCAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGacag > 2:7231251/1‑147 (MQ=38) ttCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACACGTACAGCGCTGCGCGGGAA‑AACAGCGCGGTACCTGTGGGGGCGGGCGGGCCCGCGAAGGGGTTGTTCAGCCGTTTTGCAGGAAGGCGCCAATgcgcg > 2:1745185/1‑149 (MQ=255) tCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCGGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGGTGATCAGCGGTTTTGCAGGACGGCGCGCATGCGCTc > 2:7073964/1‑150 (MQ=38) tCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCtgtg > 2:1555957/1‑85 (MQ=255) aaGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACAGCGCTGCGCTTGAA‑ATGAGCGCGGGACCTGTGGGATCCGGCGTGCCCCCCAACGGGGTGTTCAGCGGTTTTGCAGGCAGGCCCGAAGGCGCTCcgccgc > 2:4632378/1‑150 (MQ=37) gTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGTA‑ATAAGCGCTGTACCGGTGGGAGCCGGCGTGCCCGCGCAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGCATGCGCTCCGCCGCtt > 2:3265443/1‑150 (MQ=39) ccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCCCAGGTACGGCGCGGCGCGTGTA‑AACACCGCGGTACCGGTGGGAGCGGGCGGGCCCCCGCAGGGGTTTGTAAGCCGGTTTTCAGGCAGGCGCGAAAGCGCACCCCCGCGTCGCTGc > 2:3077475/1‑150 (MQ=255) ccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACACGGACTGCGCTGGGGGGGCA‑ATCAGAGCAGTACCGGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCAGGGGTTGGTCAGCGGTGTTGCAGGAACGCGCGAAGGCGCTCCGCCGCGGCGATGc > 2:3367330/1‑150 (MQ=255) gcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCTG‑GTTTAAAGCGCAGCGCCCTACCGGGGGGCCCGGGCCCGCCCGCCCAGGGGGTGATCAGCGGGTTTGCAGGCAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCGTCGATGCAGTCGGCCCGccgggc > 2:8264164/1‑145 (MQ=9) cgGGCGCGCCCCCTCCCACAGGTACAGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCGGTGGGATCCGGCGTGCCCCCGAACGGGTTGATCATCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCACCGCCCCGTCCATGCATTCGGCCAGCGGTGCa > 2:627128/1‑150 (MQ=255) gcCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGTGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTg > 2:7993439/1‑150 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCa > 1:2690311/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGGTACAGCGCTGATTTCAAG‑CGCAGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATgc > 2:5744341/1‑150 (MQ=21) ccACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATgcgc > 2:721602/1‑150 (MQ=255) cacaGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCa > 2:4271672/1‑150 (MQ=255) cacaGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCa > 2:700117/1‑150 (MQ=255) acaGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAc > 1:1658038/1‑150 (MQ=255) acaGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAc > 2:58036/1‑150 (MQ=255) acaGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAc > 1:8587119/1‑150 (MQ=255) caGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAcg > 1:8779212/1‑150 (MQ=255) aGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAcgc > 2:8343945/1‑150 (MQ=255) aGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAcgc > 1:1373050/1‑150 (MQ=255) gTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACgcgc > 1:4493678/1‑150 (MQ=255) tACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGcc > 2:6538831/1‑150 (MQ=255) aCTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAAc < 2:2766273/129‑1 (MQ=255) aCTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAAc < 2:2766112/129‑1 (MQ=255) aCTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAAc > 1:2766273/1‑129 (MQ=255) aCTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAAc > 1:2766112/1‑129 (MQ=255) ctgcgctgcgCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCg > 2:1293962/1‑150 (MQ=255) | GTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAA‑ATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGG > NC_002947/1779984‑1780277 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |