| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,967,223 | 0 | C | G | 7.8% | 604.0 / 31.0 | 191 | intergenic (+50/+69) | PP_1762/yciK | hypothetical protein/putative oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (70/102); new base G (7/8); total (79/112) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.86e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
GCAAGAGTTACGACTGCATGTTCCTGTTCCTGGAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAA‑GGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTC > NC_002947/1967076‑1967372 | gCAAGAGTTACGACTGCATGTTCCTGTTCCTGGAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCC‑CAGGATCAcc < 2:2428363/150‑1 (MQ=255)acAAGAGTTACGACTGCATGTTCCTGTTCCTGGAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCAc < 1:3484196/149‑1 (MQ=255)acAAGAGTTACGACTGCATGTTCCTGTTCCTGGAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCAc < 1:3483760/149‑1 (MQ=255) 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tCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAA‑GGATTGCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgc < 1:3719704‑M2/150‑112 (MQ=255) tCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAA‑GGATTGCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgc < 2:6903300‑M2/150‑112 (MQ=255) tCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAA‑GGATTGCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgatgcaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgc < 1:3189828‑M2/150‑112 (MQ=255) ccACAGGATCACCGCAACCCTCAA‑GGATTGCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgctc < 2:5408450‑M2/150‑114 (MQ=255) ccACAGGATCACCGCAACCCTCAA‑GGATTGCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgatgcaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgctc < 2:1021760‑M2/150‑114 (MQ=255) CCACAGGATCACCGCAACCCTCAA‑GGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCAt < 2:217840‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACAGGATCACCGCAACCCTCAA‑GGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCAt < 2:7001499‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACAGGATCACCGCAACCCTCAA‑GGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCAt < 2:1451250‑M1/150‑1 (MQ=255) CACAGGATCACCGCAACCCTCAA‑GGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATg < 1:3199707‑M1/150‑1 (MQ=255) CACAGGATCACCGCAACCCTCAA‑GGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATg < 2:7385746‑M1/150‑1 (MQ=255) 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GCAAGAGTTACGACTGCATGTTCCTGTTCCTGGAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAA‑GGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTC > NC_002947/1967076‑1967372 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |